Protein–RNA interactions for Protein: Q8N816

TMEM99, Transmembrane protein 99, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM99Q8N816 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM99Q8N816 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM99Q8N816 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM99Q8N816 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM99Q8N816 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM99Q8N816 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM99Q8N816 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM99Q8N816 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM99Q8N816 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM99Q8N816 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM99Q8N816 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM99Q8N816 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM99Q8N816 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM99Q8N816 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TMEM99Q8N816 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM99Q8N816 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM99Q8N816 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM99Q8N816 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM99Q8N816 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM99Q8N816 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM99Q8N816 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM99Q8N816 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM99Q8N816 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM99Q8N816 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM99Q8N816 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM99Q8N816 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM99Q8N816 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM99Q8N816 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM99Q8N816 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM99Q8N816 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM99Q8N816 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM99Q8N816 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM99Q8N816 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM99Q8N816 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM99Q8N816 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM99Q8N816 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM99Q8N816 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM99Q8N816 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM99Q8N816 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM99Q8N816 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM99Q8N816 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM99Q8N816 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM99Q8N816 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM99Q8N816 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM99Q8N816 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM99Q8N816 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM99Q8N816 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM99Q8N816 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM99Q8N816 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM99Q8N816 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM99Q8N816 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM99Q8N816 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM99Q8N816 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM99Q8N816 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM99Q8N816 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM99Q8N816 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM99Q8N816 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM99Q8N816 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM99Q8N816 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM99Q8N816 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM99Q8N816 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM99Q8N816 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM99Q8N816 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM99Q8N816 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM99Q8N816 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM99Q8N816 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM99Q8N816 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM99Q8N816 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM99Q8N816 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM99Q8N816 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM99Q8N816 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM99Q8N816 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM99Q8N816 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM99Q8N816 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM99Q8N816 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM99Q8N816 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM99Q8N816 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM99Q8N816 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM99Q8N816 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM99Q8N816 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM99Q8N816 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM99Q8N816 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM99Q8N816 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM99Q8N816 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM99Q8N816 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM99Q8N816 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM99Q8N816 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM99Q8N816 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM99Q8N816 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM99Q8N816 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM99Q8N816 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM99Q8N816 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM99Q8N816 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM99Q8N816 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM99Q8N816 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM99Q8N816 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM99Q8N816 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM99Q8N816 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM99Q8N816 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM99Q8N816 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.8 ms