Protein–RNA interactions for Protein: Q5T4D3

TMTC4, Transmembrane and TPR repeat-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMTC4Q5T4D3 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMTC4Q5T4D3 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
TMTC4Q5T4D3 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMTC4Q5T4D3 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMTC4Q5T4D3 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMTC4Q5T4D3 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMTC4Q5T4D3 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMTC4Q5T4D3 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMTC4Q5T4D3 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMTC4Q5T4D3 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMTC4Q5T4D3 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMTC4Q5T4D3 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMTC4Q5T4D3 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMTC4Q5T4D3 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMTC4Q5T4D3 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMTC4Q5T4D3 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
TMTC4Q5T4D3 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMTC4Q5T4D3 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMTC4Q5T4D3 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMTC4Q5T4D3 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMTC4Q5T4D3 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMTC4Q5T4D3 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMTC4Q5T4D3 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMTC4Q5T4D3 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMTC4Q5T4D3 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMTC4Q5T4D3 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMTC4Q5T4D3 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMTC4Q5T4D3 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
TMTC4Q5T4D3 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TMTC4Q5T4D3 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
TMTC4Q5T4D3 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
TMTC4Q5T4D3 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMTC4Q5T4D3 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMTC4Q5T4D3 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMTC4Q5T4D3 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMTC4Q5T4D3 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMTC4Q5T4D3 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMTC4Q5T4D3 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMTC4Q5T4D3 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMTC4Q5T4D3 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMTC4Q5T4D3 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMTC4Q5T4D3 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMTC4Q5T4D3 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMTC4Q5T4D3 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMTC4Q5T4D3 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMTC4Q5T4D3 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMTC4Q5T4D3 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMTC4Q5T4D3 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMTC4Q5T4D3 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMTC4Q5T4D3 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMTC4Q5T4D3 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
TMTC4Q5T4D3 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMTC4Q5T4D3 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMTC4Q5T4D3 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMTC4Q5T4D3 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMTC4Q5T4D3 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMTC4Q5T4D3 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMTC4Q5T4D3 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMTC4Q5T4D3 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMTC4Q5T4D3 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMTC4Q5T4D3 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMTC4Q5T4D3 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMTC4Q5T4D3 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMTC4Q5T4D3 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMTC4Q5T4D3 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMTC4Q5T4D3 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMTC4Q5T4D3 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMTC4Q5T4D3 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMTC4Q5T4D3 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMTC4Q5T4D3 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMTC4Q5T4D3 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMTC4Q5T4D3 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMTC4Q5T4D3 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMTC4Q5T4D3 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMTC4Q5T4D3 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TMTC4Q5T4D3 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMTC4Q5T4D3 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMTC4Q5T4D3 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMTC4Q5T4D3 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMTC4Q5T4D3 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMTC4Q5T4D3 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMTC4Q5T4D3 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMTC4Q5T4D3 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMTC4Q5T4D3 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMTC4Q5T4D3 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
TMTC4Q5T4D3 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMTC4Q5T4D3 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMTC4Q5T4D3 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMTC4Q5T4D3 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
TMTC4Q5T4D3 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMTC4Q5T4D3 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMTC4Q5T4D3 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMTC4Q5T4D3 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMTC4Q5T4D3 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMTC4Q5T4D3 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMTC4Q5T4D3 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMTC4Q5T4D3 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMTC4Q5T4D3 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMTC4Q5T4D3 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMTC4Q5T4D3 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms