Protein–RNA interactions for Protein: Q5GJ75

TNFAIP8L3, Tumor necrosis factor alpha-induced protein 8-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFAIP8L3Q5GJ75 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TNFAIP8L3Q5GJ75 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TNFAIP8L3Q5GJ75 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TNFAIP8L3Q5GJ75 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TNFAIP8L3Q5GJ75 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TNFAIP8L3Q5GJ75 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TNFAIP8L3Q5GJ75 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
TNFAIP8L3Q5GJ75 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TNFAIP8L3Q5GJ75 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TNFAIP8L3Q5GJ75 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TNFAIP8L3Q5GJ75 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TNFAIP8L3Q5GJ75 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TNFAIP8L3Q5GJ75 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TNFAIP8L3Q5GJ75 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TNFAIP8L3Q5GJ75 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TNFAIP8L3Q5GJ75 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TNFAIP8L3Q5GJ75 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TNFAIP8L3Q5GJ75 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TNFAIP8L3Q5GJ75 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TNFAIP8L3Q5GJ75 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TNFAIP8L3Q5GJ75 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TNFAIP8L3Q5GJ75 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TNFAIP8L3Q5GJ75 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TNFAIP8L3Q5GJ75 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TNFAIP8L3Q5GJ75 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TNFAIP8L3Q5GJ75 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TNFAIP8L3Q5GJ75 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TNFAIP8L3Q5GJ75 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TNFAIP8L3Q5GJ75 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TNFAIP8L3Q5GJ75 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TNFAIP8L3Q5GJ75 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TNFAIP8L3Q5GJ75 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TNFAIP8L3Q5GJ75 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
TNFAIP8L3Q5GJ75 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TNFAIP8L3Q5GJ75 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TNFAIP8L3Q5GJ75 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TNFAIP8L3Q5GJ75 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TNFAIP8L3Q5GJ75 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TNFAIP8L3Q5GJ75 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TNFAIP8L3Q5GJ75 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TNFAIP8L3Q5GJ75 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TNFAIP8L3Q5GJ75 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TNFAIP8L3Q5GJ75 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TNFAIP8L3Q5GJ75 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TNFAIP8L3Q5GJ75 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TNFAIP8L3Q5GJ75 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TNFAIP8L3Q5GJ75 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TNFAIP8L3Q5GJ75 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TNFAIP8L3Q5GJ75 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TNFAIP8L3Q5GJ75 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TNFAIP8L3Q5GJ75 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TNFAIP8L3Q5GJ75 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TNFAIP8L3Q5GJ75 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TNFAIP8L3Q5GJ75 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TNFAIP8L3Q5GJ75 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TNFAIP8L3Q5GJ75 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TNFAIP8L3Q5GJ75 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TNFAIP8L3Q5GJ75 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TNFAIP8L3Q5GJ75 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
TNFAIP8L3Q5GJ75 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TNFAIP8L3Q5GJ75 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TNFAIP8L3Q5GJ75 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TNFAIP8L3Q5GJ75 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
TNFAIP8L3Q5GJ75 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TNFAIP8L3Q5GJ75 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TNFAIP8L3Q5GJ75 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TNFAIP8L3Q5GJ75 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TNFAIP8L3Q5GJ75 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TNFAIP8L3Q5GJ75 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TNFAIP8L3Q5GJ75 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TNFAIP8L3Q5GJ75 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TNFAIP8L3Q5GJ75 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TNFAIP8L3Q5GJ75 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TNFAIP8L3Q5GJ75 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TNFAIP8L3Q5GJ75 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TNFAIP8L3Q5GJ75 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TNFAIP8L3Q5GJ75 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TNFAIP8L3Q5GJ75 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TNFAIP8L3Q5GJ75 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TNFAIP8L3Q5GJ75 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TNFAIP8L3Q5GJ75 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TNFAIP8L3Q5GJ75 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TNFAIP8L3Q5GJ75 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TNFAIP8L3Q5GJ75 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TNFAIP8L3Q5GJ75 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TNFAIP8L3Q5GJ75 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TNFAIP8L3Q5GJ75 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TNFAIP8L3Q5GJ75 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TNFAIP8L3Q5GJ75 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TNFAIP8L3Q5GJ75 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TNFAIP8L3Q5GJ75 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TNFAIP8L3Q5GJ75 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TNFAIP8L3Q5GJ75 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
TNFAIP8L3Q5GJ75 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TNFAIP8L3Q5GJ75 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TNFAIP8L3Q5GJ75 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TNFAIP8L3Q5GJ75 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TNFAIP8L3Q5GJ75 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TNFAIP8L3Q5GJ75 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TNFAIP8L3Q5GJ75 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms