Protein–RNA interactions for Protein: Q3LHN1

KRTAP21-3, Keratin-associated protein 21-3, humanhuman

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Length 58 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-3Q3LHN1 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
KRTAP21-3Q3LHN1 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
KRTAP21-3Q3LHN1 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
KRTAP21-3Q3LHN1 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
KRTAP21-3Q3LHN1 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
KRTAP21-3Q3LHN1 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
KRTAP21-3Q3LHN1 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
KRTAP21-3Q3LHN1 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
KRTAP21-3Q3LHN1 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
KRTAP21-3Q3LHN1 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
KRTAP21-3Q3LHN1 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
KRTAP21-3Q3LHN1 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KRTAP21-3Q3LHN1 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KRTAP21-3Q3LHN1 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KRTAP21-3Q3LHN1 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KRTAP21-3Q3LHN1 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KRTAP21-3Q3LHN1 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
KRTAP21-3Q3LHN1 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KRTAP21-3Q3LHN1 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KRTAP21-3Q3LHN1 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KRTAP21-3Q3LHN1 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KRTAP21-3Q3LHN1 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KRTAP21-3Q3LHN1 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KRTAP21-3Q3LHN1 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KRTAP21-3Q3LHN1 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KRTAP21-3Q3LHN1 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KRTAP21-3Q3LHN1 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KRTAP21-3Q3LHN1 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KRTAP21-3Q3LHN1 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KRTAP21-3Q3LHN1 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KRTAP21-3Q3LHN1 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KRTAP21-3Q3LHN1 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KRTAP21-3Q3LHN1 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KRTAP21-3Q3LHN1 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KRTAP21-3Q3LHN1 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KRTAP21-3Q3LHN1 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KRTAP21-3Q3LHN1 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KRTAP21-3Q3LHN1 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KRTAP21-3Q3LHN1 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KRTAP21-3Q3LHN1 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KRTAP21-3Q3LHN1 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KRTAP21-3Q3LHN1 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KRTAP21-3Q3LHN1 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KRTAP21-3Q3LHN1 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KRTAP21-3Q3LHN1 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KRTAP21-3Q3LHN1 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KRTAP21-3Q3LHN1 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KRTAP21-3Q3LHN1 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KRTAP21-3Q3LHN1 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
KRTAP21-3Q3LHN1 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KRTAP21-3Q3LHN1 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KRTAP21-3Q3LHN1 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KRTAP21-3Q3LHN1 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KRTAP21-3Q3LHN1 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KRTAP21-3Q3LHN1 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KRTAP21-3Q3LHN1 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KRTAP21-3Q3LHN1 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
KRTAP21-3Q3LHN1 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
KRTAP21-3Q3LHN1 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
KRTAP21-3Q3LHN1 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KRTAP21-3Q3LHN1 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KRTAP21-3Q3LHN1 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KRTAP21-3Q3LHN1 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KRTAP21-3Q3LHN1 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KRTAP21-3Q3LHN1 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KRTAP21-3Q3LHN1 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KRTAP21-3Q3LHN1 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KRTAP21-3Q3LHN1 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KRTAP21-3Q3LHN1 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KRTAP21-3Q3LHN1 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KRTAP21-3Q3LHN1 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KRTAP21-3Q3LHN1 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KRTAP21-3Q3LHN1 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KRTAP21-3Q3LHN1 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KRTAP21-3Q3LHN1 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KRTAP21-3Q3LHN1 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KRTAP21-3Q3LHN1 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
KRTAP21-3Q3LHN1 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KRTAP21-3Q3LHN1 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KRTAP21-3Q3LHN1 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KRTAP21-3Q3LHN1 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KRTAP21-3Q3LHN1 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KRTAP21-3Q3LHN1 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
KRTAP21-3Q3LHN1 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
KRTAP21-3Q3LHN1 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
KRTAP21-3Q3LHN1 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
KRTAP21-3Q3LHN1 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
KRTAP21-3Q3LHN1 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KRTAP21-3Q3LHN1 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KRTAP21-3Q3LHN1 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KRTAP21-3Q3LHN1 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
KRTAP21-3Q3LHN1 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KRTAP21-3Q3LHN1 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KRTAP21-3Q3LHN1 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KRTAP21-3Q3LHN1 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KRTAP21-3Q3LHN1 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KRTAP21-3Q3LHN1 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KRTAP21-3Q3LHN1 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KRTAP21-3Q3LHN1 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KRTAP21-3Q3LHN1 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
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