Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CNGA3Q16281 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CNGA3Q16281 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CNGA3Q16281 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CNGA3Q16281 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CNGA3Q16281 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CNGA3Q16281 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CNGA3Q16281 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CNGA3Q16281 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CNGA3Q16281 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CNGA3Q16281 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CNGA3Q16281 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CNGA3Q16281 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
CNGA3Q16281 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CNGA3Q16281 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CNGA3Q16281 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CNGA3Q16281 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CNGA3Q16281 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CNGA3Q16281 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CNGA3Q16281 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CNGA3Q16281 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CNGA3Q16281 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CNGA3Q16281 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CNGA3Q16281 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CNGA3Q16281 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CNGA3Q16281 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CNGA3Q16281 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CNGA3Q16281 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CNGA3Q16281 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CNGA3Q16281 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CNGA3Q16281 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CNGA3Q16281 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CNGA3Q16281 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CNGA3Q16281 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CNGA3Q16281 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CNGA3Q16281 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CNGA3Q16281 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CNGA3Q16281 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CNGA3Q16281 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CNGA3Q16281 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CNGA3Q16281 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CNGA3Q16281 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CNGA3Q16281 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CNGA3Q16281 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CNGA3Q16281 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CNGA3Q16281 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CNGA3Q16281 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CNGA3Q16281 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CNGA3Q16281 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CNGA3Q16281 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CNGA3Q16281 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CNGA3Q16281 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CNGA3Q16281 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CNGA3Q16281 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CNGA3Q16281 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CNGA3Q16281 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CNGA3Q16281 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CNGA3Q16281 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CNGA3Q16281 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CNGA3Q16281 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CNGA3Q16281 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CNGA3Q16281 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CNGA3Q16281 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CNGA3Q16281 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CNGA3Q16281 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CNGA3Q16281 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CNGA3Q16281 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CNGA3Q16281 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CNGA3Q16281 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CNGA3Q16281 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CNGA3Q16281 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CNGA3Q16281 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CNGA3Q16281 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CNGA3Q16281 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CNGA3Q16281 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CNGA3Q16281 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CNGA3Q16281 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CNGA3Q16281 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CNGA3Q16281 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CNGA3Q16281 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CNGA3Q16281 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CNGA3Q16281 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CNGA3Q16281 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CNGA3Q16281 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CNGA3Q16281 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CNGA3Q16281 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CNGA3Q16281 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CNGA3Q16281 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CNGA3Q16281 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CNGA3Q16281 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CNGA3Q16281 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CNGA3Q16281 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CNGA3Q16281 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CNGA3Q16281 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CNGA3Q16281 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CNGA3Q16281 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CNGA3Q16281 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CNGA3Q16281 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CNGA3Q16281 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CNGA3Q16281 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms