Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC34.35■■■■□ 3.09
CNGA3Q16281 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
CNGA3Q16281 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
CNGA3Q16281 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC33.32■■■□□ 2.92
CNGA3Q16281 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
CNGA3Q16281 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
CNGA3Q16281 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC33.13■■■□□ 2.89
CNGA3Q16281 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.87
CNGA3Q16281 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
CNGA3Q16281 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
CNGA3Q16281 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.51■■■□□ 2.79
CNGA3Q16281 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
CNGA3Q16281 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
CNGA3Q16281 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
CNGA3Q16281 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC32.26■■■□□ 2.76
CNGA3Q16281 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
CNGA3Q16281 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC31.92■■■□□ 2.7
CNGA3Q16281 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
CNGA3Q16281 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.85■■■□□ 2.69
CNGA3Q16281 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC31.77■■■□□ 2.68
CNGA3Q16281 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
CNGA3Q16281 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC31.61■■■□□ 2.65
CNGA3Q16281 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
CNGA3Q16281 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
CNGA3Q16281 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
CNGA3Q16281 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC31.47■■■□□ 2.63
CNGA3Q16281 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
CNGA3Q16281 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
CNGA3Q16281 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC31.22■■■□□ 2.59
CNGA3Q16281 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
CNGA3Q16281 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
CNGA3Q16281 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
CNGA3Q16281 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
CNGA3Q16281 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
CNGA3Q16281 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
CNGA3Q16281 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
CNGA3Q16281 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
CNGA3Q16281 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
CNGA3Q16281 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
CNGA3Q16281 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
CNGA3Q16281 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
CNGA3Q16281 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
CNGA3Q16281 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC30.69■■■□□ 2.5
CNGA3Q16281 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
CNGA3Q16281 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
CNGA3Q16281 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
CNGA3Q16281 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC30.62■■■□□ 2.49
CNGA3Q16281 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
CNGA3Q16281 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
CNGA3Q16281 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
CNGA3Q16281 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
CNGA3Q16281 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
CNGA3Q16281 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
CNGA3Q16281 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
CNGA3Q16281 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
CNGA3Q16281 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
CNGA3Q16281 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
CNGA3Q16281 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
CNGA3Q16281 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
CNGA3Q16281 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CNGA3Q16281 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CNGA3Q16281 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
CNGA3Q16281 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
CNGA3Q16281 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
CNGA3Q16281 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CNGA3Q16281 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CNGA3Q16281 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CNGA3Q16281 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CNGA3Q16281 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CNGA3Q16281 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CNGA3Q16281 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
CNGA3Q16281 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CNGA3Q16281 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CNGA3Q16281 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CNGA3Q16281 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
CNGA3Q16281 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CNGA3Q16281 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CNGA3Q16281 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CNGA3Q16281 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.33
CNGA3Q16281 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CNGA3Q16281 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CNGA3Q16281 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CNGA3Q16281 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CNGA3Q16281 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CNGA3Q16281 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CNGA3Q16281 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CNGA3Q16281 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CNGA3Q16281 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CNGA3Q16281 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CNGA3Q16281 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CNGA3Q16281 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CNGA3Q16281 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CNGA3Q16281 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CNGA3Q16281 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CNGA3Q16281 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CNGA3Q16281 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CNGA3Q16281 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CNGA3Q16281 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CNGA3Q16281 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CNGA3Q16281 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
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