Protein–RNA interactions for Protein: Q15029

EFTUD2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 972 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2Q15029 KDELR1-201ENST00000330720 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.132e-6■■■■■ 60.2
EFTUD2Q15029 NUP62-219ENST00000599830 588 ntTSL 413.89□□□□□ -0.191e-16■■■■■ 60.2
EFTUD2Q15029 NUP62-208ENST00000596217 3590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.321e-16■■■■■ 60.2
EFTUD2Q15029 NUP62-201ENST00000352066 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.331e-16■■■■■ 60.2
EFTUD2Q15029 PPP2R1A-207ENST00000473455 615 ntTSL 312.39□□□□□ -0.431e-16■■■■■ 60.2
EFTUD2Q15029 IL4I1-205ENST00000596011 714 ntTSL 212.31□□□□□ -0.441e-16■■■■■ 60.2
EFTUD2Q15029 NUP62-214ENST00000598301 565 ntTSL 412□□□□□ -0.491e-16■■■■■ 60.2
EFTUD2Q15029 NUP62-215ENST00000599186 466 ntTSL 512□□□□□ -0.491e-16■■■■■ 60.2
EFTUD2Q15029 SARS2-211ENST00000598831 665 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.571e-16■■■■■ 60.2
EFTUD2Q15029 IL4I1-207ENST00000597295 651 ntTSL 311.49□□□□□ -0.571e-16■■■■■ 60.2
EFTUD2Q15029 NUP62-223ENST00000601665 531 ntTSL 511.27□□□□□ -0.611e-16■■■■■ 60.2
EFTUD2Q15029 NUP62-209ENST00000596437 894 ntTSL 410.99□□□□□ -0.651e-16■■■■■ 60.2
EFTUD2Q15029 NUP62-220ENST00000600583 782 ntTSL 410.96□□□□□ -0.651e-16■■■■■ 60.2
EFTUD2Q15029 NUP62-216ENST00000599560 562 ntTSL 210.94□□□□□ -0.661e-16■■■■■ 60.2
EFTUD2Q15029 NUP62-202ENST00000422090 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.731e-16■■■■■ 60.2
EFTUD2Q15029 NUP62-222ENST00000600935 587 ntTSL 410.05□□□□□ -0.81e-16■■■■■ 60.2
EFTUD2Q15029 NUP62-203ENST00000593652 905 ntTSL 29.62□□□□□ -0.871e-16■■■■■ 60.2
EFTUD2Q15029 NUP62-218ENST00000599788 564 ntTSL 49.58□□□□□ -0.881e-16■■■■■ 60.2
EFTUD2Q15029 AC011452.1-201ENST00000451973 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.881e-16■■■■■ 60.2
EFTUD2Q15029 PPP2R1A-211ENST00000495876 562 ntTSL 49.21□□□□□ -0.941e-16■■■■■ 60.2
EFTUD2Q15029 KDELR1-205ENST00000600980 815 ntTSL 39.03□□□□□ -0.962e-6■■■■■ 60.2
EFTUD2Q15029 KDELR1-204ENST00000599084 582 ntTSL 28.29□□□□□ -1.082e-6■■■■■ 60.2
EFTUD2Q15029 NUP62-217ENST00000599567 579 ntTSL 48.27□□□□□ -1.091e-16■■■■■ 60.2
EFTUD2Q15029 NUP62-213ENST00000597814 510 ntTSL 47□□□□□ -1.291e-16■■■■■ 60.2
EFTUD2Q15029 NUP62-210ENST00000596680 473 ntTSL 25.91□□□□□ -1.461e-16■■■■■ 60.2
EFTUD2Q15029 C8orf59-203ENST00000521286 759 ntTSL 36.72□□□□□ -1.339e-32■■■■■ 60
EFTUD2Q15029 C8orf59-202ENST00000518786 827 ntTSL 24.84□□□□□ -1.639e-32■■■■■ 60
EFTUD2Q15029 TNFRSF1A-203ENST00000437813 634 ntTSL 513.37□□□□□ -0.272e-8■■■■■ 60
EFTUD2Q15029 TSC2-226ENST00000569930 2621 ntTSL 219.64■□□□□ 0.737e-11■■■■■ 59.9
EFTUD2Q15029 TSC2-225ENST00000569110 1687 ntTSL 516.76■□□□□ 0.277e-11■■■■■ 59.9
EFTUD2Q15029 TSC2-216ENST00000497886 3248 ntTSL 214.42□□□□□ -0.17e-11■■■■■ 59.9
EFTUD2Q15029 RPS2-204ENST00000526908 638 ntTSL 218.91■□□□□ 0.623e-17■■■■■ 59.8
EFTUD2Q15029 VAMP3-201ENST00000054666 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.047e-7■■■■■ 59.7
EFTUD2Q15029 HIBCH-206ENST00000409934 826 ntTSL 321.19■□□□□ 0.984e-11■■■■■ 59.7
EFTUD2Q15029 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.484e-11■■■■■ 59.7
EFTUD2Q15029 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.44e-11■■■■■ 59.7
EFTUD2Q15029 HMGB3-205ENST00000455596 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)20.01■□□□□ 0.791e-8■■■■■ 59.6
EFTUD2Q15029 HMGB3-204ENST00000448905 812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.431e-8■■■■■ 59.6
EFTUD2Q15029 HMGB3-201ENST00000325307 3560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.81e-8■■■■■ 59.6
EFTUD2Q15029 HMGB3-202ENST00000419110 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 36.03□□□□□ -1.441e-8■■■■■ 59.6
EFTUD2Q15029 NLE1-206ENST00000589367 1017 ntTSL 518.88■□□□□ 0.612e-6■■■■■ 59.5
EFTUD2Q15029 NLE1-207ENST00000593176 800 ntTSL 314.49□□□□□ -0.092e-6■■■■■ 59.5
EFTUD2Q15029 NLE1-205ENST00000588642 580 ntTSL 214.04□□□□□ -0.162e-6■■■■■ 59.5
EFTUD2Q15029 PIGQ-219ENST00000635935 2000 ntTSL 531.26■■■□□ 2.592e-8■■■■■ 59.4
EFTUD2Q15029 PIGQ-208ENST00000443147 2054 ntTSL 222.19■■□□□ 1.142e-8■■■■■ 59.4
EFTUD2Q15029 PIGQ-218ENST00000635909 2212 ntTSL 519.72■□□□□ 0.752e-8■■■■■ 59.4
EFTUD2Q15029 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.752e-8■■■■■ 59.4
EFTUD2Q15029 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.622e-8■■■■■ 59.4
EFTUD2Q15029 PIGQ-211ENST00000480424 2202 ntTSL 218.33■□□□□ 0.532e-8■■■■■ 59.4
EFTUD2Q15029 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.422e-8■■■■■ 59.4
EFTUD2Q15029 PIGQ-221ENST00000636657 2841 ntTSL 516.97■□□□□ 0.312e-8■■■■■ 59.4
EFTUD2Q15029 PIGQ-205ENST00000420990 932 ntTSL 515.65■□□□□ 0.12e-8■■■■■ 59.4
EFTUD2Q15029 PIGQ-224ENST00000638143 563 ntTSL 515.1■□□□□ 0.012e-8■■■■■ 59.4
EFTUD2Q15029 PIGQ-217ENST00000635205 936 ntTSL 514.96□□□□□ -0.012e-8■■■■■ 59.4
EFTUD2Q15029 PIGQ-220ENST00000636005 1355 ntTSL 514.57□□□□□ -0.082e-8■■■■■ 59.4
EFTUD2Q15029 PIGQ-222ENST00000637468 650 ntTSL 514.29□□□□□ -0.122e-8■■■■■ 59.4
EFTUD2Q15029 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.447e-14■■■■■ 59.3
EFTUD2Q15029 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.447e-14■■■■■ 59.3
EFTUD2Q15029 RPS20-203ENST00000519369 824 ntTSL 212.63□□□□□ -0.397e-14■■■■■ 59.3
EFTUD2Q15029 RPS20-208ENST00000521262 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.417e-14■■■■■ 59.3
EFTUD2Q15029 RPS20-209ENST00000521289 737 ntTSL 510.17□□□□□ -0.787e-14■■■■■ 59.3
EFTUD2Q15029 RPS20-212ENST00000618656 627 ntTSL 3 BASIC9□□□□□ -0.977e-14■■■■■ 59.3
EFTUD2Q15029 RPS20-207ENST00000520627 423 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.017e-14■■■■■ 59.3
EFTUD2Q15029 RPS20-201ENST00000009589 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.137e-14■■■■■ 59.3
EFTUD2Q15029 RPS20-204ENST00000519606 424 ntTSL 3 BASIC7.98□□□□□ -1.137e-14■■■■■ 59.3
EFTUD2Q15029 RPS20-206ENST00000520490 402 ntTSL 37.84□□□□□ -1.157e-14■■■■■ 59.3
EFTUD2Q15029 RPS20-205ENST00000519807 1826 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.227e-14■■■■■ 59.3
EFTUD2Q15029 RPS20-202ENST00000518875 671 ntTSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.327e-14■■■■■ 59.3
EFTUD2Q15029 CUTA-208ENST00000482684 837 ntTSL 1 (best)20.08■□□□□ 0.817e-10■■■■■ 59.1
EFTUD2Q15029 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.187e-10■■■■■ 59.1
EFTUD2Q15029 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.067e-10■■■■■ 59.1
EFTUD2Q15029 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.297e-10■■■■■ 59.1
EFTUD2Q15029 CUTA-203ENST00000374500 937 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.357e-10■■■■■ 59.1
EFTUD2Q15029 CUTA-201ENST00000374484 658 ntTSL 312.87□□□□□ -0.357e-10■■■■■ 59.1
EFTUD2Q15029 CUTA-204ENST00000440279 822 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.457e-10■■■■■ 59.1
EFTUD2Q15029 CUTA-206ENST00000465956 961 ntTSL 211.55□□□□□ -0.567e-10■■■■■ 59.1
EFTUD2Q15029 CUTA-209ENST00000487637 1378 ntTSL 211.28□□□□□ -0.67e-10■■■■■ 59.1
EFTUD2Q15029 CUTA-205ENST00000462802 1054 ntTSL 1 (best)10.8□□□□□ -0.687e-10■■■■■ 59.1
EFTUD2Q15029 CUTA-211ENST00000488478 676 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.747e-10■■■■■ 59.1
EFTUD2Q15029 CUTA-213ENST00000494751 731 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.827e-10■■■■■ 59.1
EFTUD2Q15029 CUTA-214ENST00000607266 661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.917e-10■■■■■ 59.1
EFTUD2Q15029 CUTA-207ENST00000479249 562 ntTSL 36.92□□□□□ -1.37e-10■■■■■ 59.1
EFTUD2Q15029 INTS3-206ENST00000480659 866 ntTSL 46.57□□□□□ -1.362e-8■■■■■ 59.1
EFTUD2Q15029 LYPLA1-205ENST00000519272 765 ntTSL 37.55□□□□□ -1.26e-14■■■■■ 59.1
EFTUD2Q15029 RDH11-211ENST00000557726 621 ntTSL 311.88□□□□□ -0.517e-8■■■■■ 59
EFTUD2Q15029 RDH11-207ENST00000554731 888 ntTSL 311.58□□□□□ -0.567e-8■■■■■ 59
EFTUD2Q15029 RDH11-210ENST00000557331 553 ntTSL 49.5□□□□□ -0.897e-8■■■■■ 59
EFTUD2Q15029 RDH11-201ENST00000381346 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.97e-8■■■■■ 59
EFTUD2Q15029 RDH11-202ENST00000428130 1064 ntTSL 2 BASIC9.4□□□□□ -0.97e-8■■■■■ 59
EFTUD2Q15029 RDH11-209ENST00000557273 562 ntTSL 39.37□□□□□ -0.917e-8■■■■■ 59
EFTUD2Q15029 RDH11-205ENST00000553816 1163 ntTSL 27.9□□□□□ -1.147e-8■■■■■ 59
EFTUD2Q15029 RDH11-203ENST00000553384 1926 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.237e-8■■■■■ 59
EFTUD2Q15029 RDH11-208ENST00000556692 801 ntTSL 23.14□□□□□ -1.917e-8■■■■■ 59
EFTUD2Q15029 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.151e-10■■■■■ 58.9
EFTUD2Q15029 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.041e-10■■■■■ 58.9
EFTUD2Q15029 SYNGR2-204ENST00000589168 2125 ntTSL 219.09■□□□□ 0.651e-10■■■■■ 58.9
EFTUD2Q15029 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.431e-10■■■■■ 58.9
EFTUD2Q15029 SYNGR2-205ENST00000589183 796 ntTSL 317.54■□□□□ 0.41e-10■■■■■ 58.9
EFTUD2Q15029 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.241e-10■■■■■ 58.9
EFTUD2Q15029 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.141e-10■■■■■ 58.9
Retrieved 100 of 48,698 protein–RNA pairs in 3461.2 ms