Protein–RNA interactions for Protein: Q13042

CDC16, Cell division cycle protein 16 homolog, humanhuman

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Length 620 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC16Q13042 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDC16Q13042 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDC16Q13042 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CDC16Q13042 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDC16Q13042 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDC16Q13042 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDC16Q13042 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDC16Q13042 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CDC16Q13042 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDC16Q13042 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDC16Q13042 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDC16Q13042 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDC16Q13042 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDC16Q13042 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDC16Q13042 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDC16Q13042 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDC16Q13042 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDC16Q13042 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDC16Q13042 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDC16Q13042 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CDC16Q13042 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDC16Q13042 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDC16Q13042 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDC16Q13042 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDC16Q13042 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CDC16Q13042 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDC16Q13042 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CDC16Q13042 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDC16Q13042 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDC16Q13042 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDC16Q13042 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDC16Q13042 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDC16Q13042 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDC16Q13042 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDC16Q13042 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDC16Q13042 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDC16Q13042 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDC16Q13042 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDC16Q13042 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDC16Q13042 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDC16Q13042 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDC16Q13042 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDC16Q13042 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDC16Q13042 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDC16Q13042 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDC16Q13042 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDC16Q13042 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDC16Q13042 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDC16Q13042 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDC16Q13042 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDC16Q13042 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDC16Q13042 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDC16Q13042 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDC16Q13042 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CDC16Q13042 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDC16Q13042 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDC16Q13042 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDC16Q13042 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDC16Q13042 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDC16Q13042 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDC16Q13042 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDC16Q13042 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDC16Q13042 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CDC16Q13042 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDC16Q13042 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDC16Q13042 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDC16Q13042 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CDC16Q13042 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDC16Q13042 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDC16Q13042 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDC16Q13042 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CDC16Q13042 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDC16Q13042 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDC16Q13042 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDC16Q13042 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDC16Q13042 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDC16Q13042 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDC16Q13042 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDC16Q13042 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDC16Q13042 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDC16Q13042 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDC16Q13042 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDC16Q13042 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDC16Q13042 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDC16Q13042 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDC16Q13042 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDC16Q13042 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDC16Q13042 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CDC16Q13042 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CDC16Q13042 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CDC16Q13042 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CDC16Q13042 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CDC16Q13042 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CDC16Q13042 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CDC16Q13042 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDC16Q13042 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDC16Q13042 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDC16Q13042 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDC16Q13042 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDC16Q13042 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
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