Protein–RNA interactions for Protein: Q08AI8

C2orf54, Uncharacterized protein C2orf54, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf54Q08AI8 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
C2orf54Q08AI8 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
C2orf54Q08AI8 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
C2orf54Q08AI8 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
C2orf54Q08AI8 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
C2orf54Q08AI8 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
C2orf54Q08AI8 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
C2orf54Q08AI8 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
C2orf54Q08AI8 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
C2orf54Q08AI8 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
C2orf54Q08AI8 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
C2orf54Q08AI8 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
C2orf54Q08AI8 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
C2orf54Q08AI8 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
C2orf54Q08AI8 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
C2orf54Q08AI8 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
C2orf54Q08AI8 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
C2orf54Q08AI8 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
C2orf54Q08AI8 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
C2orf54Q08AI8 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
C2orf54Q08AI8 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
C2orf54Q08AI8 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
C2orf54Q08AI8 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
C2orf54Q08AI8 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
C2orf54Q08AI8 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
C2orf54Q08AI8 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
C2orf54Q08AI8 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
C2orf54Q08AI8 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
C2orf54Q08AI8 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
C2orf54Q08AI8 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
C2orf54Q08AI8 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
C2orf54Q08AI8 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
C2orf54Q08AI8 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
C2orf54Q08AI8 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
C2orf54Q08AI8 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
C2orf54Q08AI8 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
C2orf54Q08AI8 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
C2orf54Q08AI8 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
C2orf54Q08AI8 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
C2orf54Q08AI8 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
C2orf54Q08AI8 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
C2orf54Q08AI8 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
C2orf54Q08AI8 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
C2orf54Q08AI8 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
C2orf54Q08AI8 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
C2orf54Q08AI8 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
C2orf54Q08AI8 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
C2orf54Q08AI8 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
C2orf54Q08AI8 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
C2orf54Q08AI8 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
C2orf54Q08AI8 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
C2orf54Q08AI8 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
C2orf54Q08AI8 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
C2orf54Q08AI8 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
C2orf54Q08AI8 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
C2orf54Q08AI8 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
C2orf54Q08AI8 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
C2orf54Q08AI8 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
C2orf54Q08AI8 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
C2orf54Q08AI8 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
C2orf54Q08AI8 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
C2orf54Q08AI8 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
C2orf54Q08AI8 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
C2orf54Q08AI8 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
C2orf54Q08AI8 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
C2orf54Q08AI8 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
C2orf54Q08AI8 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
C2orf54Q08AI8 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
C2orf54Q08AI8 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
C2orf54Q08AI8 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
C2orf54Q08AI8 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
C2orf54Q08AI8 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
C2orf54Q08AI8 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
C2orf54Q08AI8 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
C2orf54Q08AI8 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
C2orf54Q08AI8 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
C2orf54Q08AI8 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
C2orf54Q08AI8 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
C2orf54Q08AI8 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
C2orf54Q08AI8 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
C2orf54Q08AI8 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
C2orf54Q08AI8 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
C2orf54Q08AI8 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
C2orf54Q08AI8 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
C2orf54Q08AI8 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
C2orf54Q08AI8 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
C2orf54Q08AI8 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
C2orf54Q08AI8 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
C2orf54Q08AI8 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
C2orf54Q08AI8 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
C2orf54Q08AI8 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
C2orf54Q08AI8 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
C2orf54Q08AI8 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
C2orf54Q08AI8 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
C2orf54Q08AI8 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
C2orf54Q08AI8 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
C2orf54Q08AI8 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
C2orf54Q08AI8 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
C2orf54Q08AI8 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
C2orf54Q08AI8 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms