Protein–RNA interactions for Protein: Q06455

RUNX1T1, Protein CBFA2T1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX1T1Q06455 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RUNX1T1Q06455 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RUNX1T1Q06455 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RUNX1T1Q06455 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RUNX1T1Q06455 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RUNX1T1Q06455 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RUNX1T1Q06455 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RUNX1T1Q06455 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RUNX1T1Q06455 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RUNX1T1Q06455 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RUNX1T1Q06455 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RUNX1T1Q06455 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RUNX1T1Q06455 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RUNX1T1Q06455 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RUNX1T1Q06455 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RUNX1T1Q06455 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RUNX1T1Q06455 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RUNX1T1Q06455 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RUNX1T1Q06455 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RUNX1T1Q06455 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RUNX1T1Q06455 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RUNX1T1Q06455 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RUNX1T1Q06455 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RUNX1T1Q06455 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RUNX1T1Q06455 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RUNX1T1Q06455 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RUNX1T1Q06455 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RUNX1T1Q06455 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RUNX1T1Q06455 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RUNX1T1Q06455 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RUNX1T1Q06455 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RUNX1T1Q06455 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RUNX1T1Q06455 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RUNX1T1Q06455 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RUNX1T1Q06455 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
RUNX1T1Q06455 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RUNX1T1Q06455 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RUNX1T1Q06455 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RUNX1T1Q06455 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RUNX1T1Q06455 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
RUNX1T1Q06455 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RUNX1T1Q06455 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RUNX1T1Q06455 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RUNX1T1Q06455 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RUNX1T1Q06455 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RUNX1T1Q06455 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RUNX1T1Q06455 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RUNX1T1Q06455 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RUNX1T1Q06455 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RUNX1T1Q06455 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RUNX1T1Q06455 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RUNX1T1Q06455 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RUNX1T1Q06455 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RUNX1T1Q06455 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RUNX1T1Q06455 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RUNX1T1Q06455 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RUNX1T1Q06455 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RUNX1T1Q06455 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RUNX1T1Q06455 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RUNX1T1Q06455 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RUNX1T1Q06455 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RUNX1T1Q06455 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RUNX1T1Q06455 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RUNX1T1Q06455 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RUNX1T1Q06455 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RUNX1T1Q06455 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RUNX1T1Q06455 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RUNX1T1Q06455 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RUNX1T1Q06455 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RUNX1T1Q06455 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RUNX1T1Q06455 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RUNX1T1Q06455 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RUNX1T1Q06455 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RUNX1T1Q06455 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RUNX1T1Q06455 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RUNX1T1Q06455 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RUNX1T1Q06455 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RUNX1T1Q06455 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RUNX1T1Q06455 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RUNX1T1Q06455 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RUNX1T1Q06455 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RUNX1T1Q06455 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RUNX1T1Q06455 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RUNX1T1Q06455 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RUNX1T1Q06455 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RUNX1T1Q06455 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RUNX1T1Q06455 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RUNX1T1Q06455 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RUNX1T1Q06455 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RUNX1T1Q06455 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RUNX1T1Q06455 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RUNX1T1Q06455 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RUNX1T1Q06455 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RUNX1T1Q06455 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RUNX1T1Q06455 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RUNX1T1Q06455 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RUNX1T1Q06455 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RUNX1T1Q06455 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RUNX1T1Q06455 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RUNX1T1Q06455 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.9 ms