Protein–RNA interactions for Protein: P55055

NR1H2, Oxysterols receptor LXR-beta, humanhuman

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H2P55055 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NR1H2P55055 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NR1H2P55055 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NR1H2P55055 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NR1H2P55055 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NR1H2P55055 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NR1H2P55055 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NR1H2P55055 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NR1H2P55055 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NR1H2P55055 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NR1H2P55055 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NR1H2P55055 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NR1H2P55055 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NR1H2P55055 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NR1H2P55055 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NR1H2P55055 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
NR1H2P55055 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NR1H2P55055 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NR1H2P55055 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NR1H2P55055 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NR1H2P55055 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NR1H2P55055 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NR1H2P55055 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NR1H2P55055 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
NR1H2P55055 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
NR1H2P55055 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NR1H2P55055 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NR1H2P55055 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NR1H2P55055 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NR1H2P55055 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NR1H2P55055 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NR1H2P55055 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NR1H2P55055 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NR1H2P55055 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
NR1H2P55055 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NR1H2P55055 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NR1H2P55055 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NR1H2P55055 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NR1H2P55055 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NR1H2P55055 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NR1H2P55055 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NR1H2P55055 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NR1H2P55055 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NR1H2P55055 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NR1H2P55055 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NR1H2P55055 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NR1H2P55055 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NR1H2P55055 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NR1H2P55055 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NR1H2P55055 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NR1H2P55055 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NR1H2P55055 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NR1H2P55055 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NR1H2P55055 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NR1H2P55055 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NR1H2P55055 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NR1H2P55055 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NR1H2P55055 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NR1H2P55055 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NR1H2P55055 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
NR1H2P55055 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NR1H2P55055 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NR1H2P55055 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NR1H2P55055 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NR1H2P55055 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NR1H2P55055 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NR1H2P55055 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NR1H2P55055 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NR1H2P55055 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NR1H2P55055 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NR1H2P55055 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NR1H2P55055 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NR1H2P55055 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NR1H2P55055 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NR1H2P55055 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NR1H2P55055 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NR1H2P55055 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NR1H2P55055 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NR1H2P55055 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NR1H2P55055 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NR1H2P55055 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NR1H2P55055 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NR1H2P55055 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NR1H2P55055 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NR1H2P55055 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NR1H2P55055 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NR1H2P55055 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NR1H2P55055 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NR1H2P55055 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NR1H2P55055 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NR1H2P55055 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NR1H2P55055 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NR1H2P55055 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NR1H2P55055 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NR1H2P55055 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NR1H2P55055 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NR1H2P55055 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NR1H2P55055 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
NR1H2P55055 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NR1H2P55055 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.5 ms