Protein–RNA interactions for Protein: P42575

CASP2, Caspase-2, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP2P42575 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CASP2P42575 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CASP2P42575 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CASP2P42575 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CASP2P42575 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CASP2P42575 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CASP2P42575 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CASP2P42575 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CASP2P42575 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CASP2P42575 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CASP2P42575 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CASP2P42575 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CASP2P42575 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CASP2P42575 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CASP2P42575 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CASP2P42575 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CASP2P42575 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CASP2P42575 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CASP2P42575 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CASP2P42575 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CASP2P42575 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CASP2P42575 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CASP2P42575 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CASP2P42575 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CASP2P42575 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CASP2P42575 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CASP2P42575 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CASP2P42575 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CASP2P42575 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CASP2P42575 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CASP2P42575 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CASP2P42575 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CASP2P42575 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CASP2P42575 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CASP2P42575 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CASP2P42575 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CASP2P42575 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CASP2P42575 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CASP2P42575 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CASP2P42575 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CASP2P42575 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CASP2P42575 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CASP2P42575 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CASP2P42575 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CASP2P42575 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CASP2P42575 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CASP2P42575 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CASP2P42575 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CASP2P42575 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CASP2P42575 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CASP2P42575 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CASP2P42575 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CASP2P42575 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CASP2P42575 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CASP2P42575 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CASP2P42575 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CASP2P42575 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CASP2P42575 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CASP2P42575 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CASP2P42575 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CASP2P42575 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CASP2P42575 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CASP2P42575 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CASP2P42575 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CASP2P42575 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CASP2P42575 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CASP2P42575 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CASP2P42575 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CASP2P42575 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CASP2P42575 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CASP2P42575 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CASP2P42575 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CASP2P42575 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CASP2P42575 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CASP2P42575 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CASP2P42575 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CASP2P42575 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CASP2P42575 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CASP2P42575 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CASP2P42575 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CASP2P42575 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CASP2P42575 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CASP2P42575 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CASP2P42575 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CASP2P42575 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CASP2P42575 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CASP2P42575 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CASP2P42575 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CASP2P42575 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CASP2P42575 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CASP2P42575 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CASP2P42575 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CASP2P42575 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CASP2P42575 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CASP2P42575 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CASP2P42575 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CASP2P42575 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CASP2P42575 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CASP2P42575 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CASP2P42575 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms