Protein–RNA interactions for Protein: P30084

ECHS1, Enoyl-CoA hydratase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHS1P30084 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ECHS1P30084 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ECHS1P30084 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ECHS1P30084 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ECHS1P30084 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ECHS1P30084 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ECHS1P30084 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ECHS1P30084 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ECHS1P30084 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ECHS1P30084 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ECHS1P30084 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ECHS1P30084 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ECHS1P30084 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ECHS1P30084 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ECHS1P30084 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ECHS1P30084 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
ECHS1P30084 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ECHS1P30084 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ECHS1P30084 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ECHS1P30084 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
ECHS1P30084 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ECHS1P30084 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
ECHS1P30084 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ECHS1P30084 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ECHS1P30084 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ECHS1P30084 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ECHS1P30084 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ECHS1P30084 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ECHS1P30084 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ECHS1P30084 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ECHS1P30084 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
ECHS1P30084 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ECHS1P30084 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
ECHS1P30084 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ECHS1P30084 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ECHS1P30084 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ECHS1P30084 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ECHS1P30084 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ECHS1P30084 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ECHS1P30084 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ECHS1P30084 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ECHS1P30084 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ECHS1P30084 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ECHS1P30084 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ECHS1P30084 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ECHS1P30084 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ECHS1P30084 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ECHS1P30084 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ECHS1P30084 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ECHS1P30084 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
ECHS1P30084 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ECHS1P30084 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ECHS1P30084 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ECHS1P30084 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ECHS1P30084 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ECHS1P30084 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ECHS1P30084 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ECHS1P30084 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ECHS1P30084 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
ECHS1P30084 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ECHS1P30084 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ECHS1P30084 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ECHS1P30084 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ECHS1P30084 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ECHS1P30084 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ECHS1P30084 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ECHS1P30084 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ECHS1P30084 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
ECHS1P30084 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ECHS1P30084 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ECHS1P30084 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
ECHS1P30084 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ECHS1P30084 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ECHS1P30084 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ECHS1P30084 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ECHS1P30084 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ECHS1P30084 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ECHS1P30084 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ECHS1P30084 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ECHS1P30084 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ECHS1P30084 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ECHS1P30084 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
ECHS1P30084 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ECHS1P30084 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ECHS1P30084 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ECHS1P30084 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ECHS1P30084 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ECHS1P30084 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ECHS1P30084 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ECHS1P30084 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ECHS1P30084 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ECHS1P30084 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ECHS1P30084 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ECHS1P30084 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ECHS1P30084 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ECHS1P30084 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
ECHS1P30084 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ECHS1P30084 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ECHS1P30084 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ECHS1P30084 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms