Protein–RNA interactions for Protein: P29317

EPHA2, Ephrin type-A receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA2P29317 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
EPHA2P29317 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EPHA2P29317 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EPHA2P29317 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EPHA2P29317 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EPHA2P29317 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
EPHA2P29317 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EPHA2P29317 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EPHA2P29317 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EPHA2P29317 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
EPHA2P29317 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
EPHA2P29317 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EPHA2P29317 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EPHA2P29317 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EPHA2P29317 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EPHA2P29317 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EPHA2P29317 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EPHA2P29317 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EPHA2P29317 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EPHA2P29317 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EPHA2P29317 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EPHA2P29317 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EPHA2P29317 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EPHA2P29317 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EPHA2P29317 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EPHA2P29317 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EPHA2P29317 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EPHA2P29317 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
EPHA2P29317 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EPHA2P29317 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EPHA2P29317 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EPHA2P29317 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EPHA2P29317 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EPHA2P29317 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EPHA2P29317 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EPHA2P29317 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EPHA2P29317 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EPHA2P29317 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EPHA2P29317 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EPHA2P29317 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EPHA2P29317 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EPHA2P29317 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
EPHA2P29317 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
EPHA2P29317 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
EPHA2P29317 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
EPHA2P29317 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EPHA2P29317 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EPHA2P29317 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EPHA2P29317 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
EPHA2P29317 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EPHA2P29317 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EPHA2P29317 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EPHA2P29317 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EPHA2P29317 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EPHA2P29317 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EPHA2P29317 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EPHA2P29317 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EPHA2P29317 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EPHA2P29317 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EPHA2P29317 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EPHA2P29317 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EPHA2P29317 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EPHA2P29317 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EPHA2P29317 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EPHA2P29317 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EPHA2P29317 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EPHA2P29317 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EPHA2P29317 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EPHA2P29317 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EPHA2P29317 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EPHA2P29317 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EPHA2P29317 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EPHA2P29317 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EPHA2P29317 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
EPHA2P29317 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EPHA2P29317 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EPHA2P29317 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
EPHA2P29317 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
EPHA2P29317 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EPHA2P29317 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EPHA2P29317 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EPHA2P29317 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
EPHA2P29317 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EPHA2P29317 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EPHA2P29317 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EPHA2P29317 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
EPHA2P29317 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EPHA2P29317 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EPHA2P29317 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EPHA2P29317 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EPHA2P29317 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EPHA2P29317 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EPHA2P29317 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EPHA2P29317 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
EPHA2P29317 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EPHA2P29317 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EPHA2P29317 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EPHA2P29317 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EPHA2P29317 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EPHA2P29317 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms