Protein–RNA interactions for Protein: P20783

NTF3, Neurotrophin-3, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTF3P20783 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NTF3P20783 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NTF3P20783 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NTF3P20783 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NTF3P20783 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
NTF3P20783 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NTF3P20783 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NTF3P20783 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NTF3P20783 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NTF3P20783 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NTF3P20783 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NTF3P20783 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NTF3P20783 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NTF3P20783 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NTF3P20783 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NTF3P20783 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NTF3P20783 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NTF3P20783 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NTF3P20783 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NTF3P20783 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NTF3P20783 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NTF3P20783 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NTF3P20783 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NTF3P20783 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NTF3P20783 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NTF3P20783 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NTF3P20783 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NTF3P20783 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NTF3P20783 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NTF3P20783 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NTF3P20783 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NTF3P20783 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NTF3P20783 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NTF3P20783 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NTF3P20783 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NTF3P20783 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NTF3P20783 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NTF3P20783 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NTF3P20783 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
NTF3P20783 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NTF3P20783 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NTF3P20783 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NTF3P20783 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NTF3P20783 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
NTF3P20783 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NTF3P20783 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
NTF3P20783 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
NTF3P20783 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NTF3P20783 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
NTF3P20783 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NTF3P20783 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
NTF3P20783 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
NTF3P20783 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NTF3P20783 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NTF3P20783 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NTF3P20783 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NTF3P20783 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NTF3P20783 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NTF3P20783 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NTF3P20783 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NTF3P20783 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
NTF3P20783 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NTF3P20783 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NTF3P20783 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NTF3P20783 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NTF3P20783 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NTF3P20783 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NTF3P20783 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NTF3P20783 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NTF3P20783 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NTF3P20783 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NTF3P20783 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NTF3P20783 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NTF3P20783 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NTF3P20783 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NTF3P20783 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NTF3P20783 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NTF3P20783 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NTF3P20783 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NTF3P20783 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NTF3P20783 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NTF3P20783 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NTF3P20783 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NTF3P20783 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NTF3P20783 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NTF3P20783 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NTF3P20783 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NTF3P20783 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NTF3P20783 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NTF3P20783 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NTF3P20783 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NTF3P20783 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NTF3P20783 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NTF3P20783 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NTF3P20783 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
NTF3P20783 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NTF3P20783 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NTF3P20783 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NTF3P20783 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NTF3P20783 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83 ms