Protein–RNA interactions for Protein: P20783

NTF3, Neurotrophin-3, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTF3P20783 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NTF3P20783 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NTF3P20783 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NTF3P20783 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NTF3P20783 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NTF3P20783 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NTF3P20783 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NTF3P20783 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NTF3P20783 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NTF3P20783 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NTF3P20783 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NTF3P20783 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NTF3P20783 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NTF3P20783 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
NTF3P20783 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NTF3P20783 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NTF3P20783 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NTF3P20783 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NTF3P20783 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NTF3P20783 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NTF3P20783 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NTF3P20783 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NTF3P20783 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NTF3P20783 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NTF3P20783 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NTF3P20783 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NTF3P20783 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NTF3P20783 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NTF3P20783 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NTF3P20783 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NTF3P20783 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NTF3P20783 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NTF3P20783 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NTF3P20783 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NTF3P20783 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NTF3P20783 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NTF3P20783 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NTF3P20783 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NTF3P20783 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NTF3P20783 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
NTF3P20783 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NTF3P20783 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NTF3P20783 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NTF3P20783 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NTF3P20783 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NTF3P20783 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NTF3P20783 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NTF3P20783 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NTF3P20783 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NTF3P20783 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NTF3P20783 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NTF3P20783 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NTF3P20783 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NTF3P20783 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NTF3P20783 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NTF3P20783 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NTF3P20783 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NTF3P20783 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NTF3P20783 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NTF3P20783 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NTF3P20783 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NTF3P20783 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NTF3P20783 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NTF3P20783 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NTF3P20783 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NTF3P20783 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NTF3P20783 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NTF3P20783 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NTF3P20783 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NTF3P20783 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NTF3P20783 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NTF3P20783 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NTF3P20783 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NTF3P20783 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NTF3P20783 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NTF3P20783 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NTF3P20783 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NTF3P20783 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NTF3P20783 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NTF3P20783 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NTF3P20783 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NTF3P20783 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NTF3P20783 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NTF3P20783 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NTF3P20783 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NTF3P20783 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NTF3P20783 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NTF3P20783 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NTF3P20783 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NTF3P20783 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NTF3P20783 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NTF3P20783 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NTF3P20783 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NTF3P20783 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NTF3P20783 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NTF3P20783 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NTF3P20783 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NTF3P20783 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NTF3P20783 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NTF3P20783 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms