Protein–RNA interactions for Protein: P20719

HOXA5, Homeobox protein Hox-A5, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA5P20719 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXA5P20719 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXA5P20719 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXA5P20719 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXA5P20719 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXA5P20719 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXA5P20719 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HOXA5P20719 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HOXA5P20719 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HOXA5P20719 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HOXA5P20719 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
HOXA5P20719 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HOXA5P20719 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
HOXA5P20719 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
HOXA5P20719 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
HOXA5P20719 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
HOXA5P20719 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
HOXA5P20719 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
HOXA5P20719 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
HOXA5P20719 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
HOXA5P20719 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
HOXA5P20719 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
HOXA5P20719 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
HOXA5P20719 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
HOXA5P20719 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
HOXA5P20719 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC19.41■□□□□ 0.7
HOXA5P20719 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
HOXA5P20719 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
HOXA5P20719 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
HOXA5P20719 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
HOXA5P20719 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
HOXA5P20719 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
HOXA5P20719 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
HOXA5P20719 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
HOXA5P20719 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
HOXA5P20719 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
HOXA5P20719 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
HOXA5P20719 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
HOXA5P20719 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
HOXA5P20719 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
HOXA5P20719 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
HOXA5P20719 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
HOXA5P20719 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
HOXA5P20719 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
HOXA5P20719 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
HOXA5P20719 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
HOXA5P20719 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
HOXA5P20719 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
HOXA5P20719 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
HOXA5P20719 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
HOXA5P20719 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
HOXA5P20719 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
HOXA5P20719 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
HOXA5P20719 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
HOXA5P20719 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HOXA5P20719 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
HOXA5P20719 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HOXA5P20719 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HOXA5P20719 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HOXA5P20719 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HOXA5P20719 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HOXA5P20719 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HOXA5P20719 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HOXA5P20719 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HOXA5P20719 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HOXA5P20719 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HOXA5P20719 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HOXA5P20719 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
HOXA5P20719 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HOXA5P20719 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HOXA5P20719 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HOXA5P20719 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HOXA5P20719 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HOXA5P20719 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HOXA5P20719 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HOXA5P20719 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HOXA5P20719 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
HOXA5P20719 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
HOXA5P20719 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXA5P20719 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXA5P20719 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXA5P20719 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXA5P20719 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXA5P20719 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXA5P20719 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXA5P20719 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXA5P20719 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXA5P20719 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXA5P20719 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXA5P20719 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXA5P20719 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXA5P20719 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXA5P20719 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXA5P20719 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXA5P20719 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXA5P20719 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXA5P20719 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXA5P20719 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXA5P20719 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXA5P20719 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms