Protein–RNA interactions for Protein: P12270

TPR, Nucleoprotein TPR, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRP12270 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TPRP12270 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TPRP12270 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
TPRP12270 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TPRP12270 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TPRP12270 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TPRP12270 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TPRP12270 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TPRP12270 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TPRP12270 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TPRP12270 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TPRP12270 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TPRP12270 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TPRP12270 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TPRP12270 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TPRP12270 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TPRP12270 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TPRP12270 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TPRP12270 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TPRP12270 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TPRP12270 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TPRP12270 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TPRP12270 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TPRP12270 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TPRP12270 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TPRP12270 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TPRP12270 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TPRP12270 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TPRP12270 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TPRP12270 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
TPRP12270 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
TPRP12270 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TPRP12270 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TPRP12270 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TPRP12270 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TPRP12270 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TPRP12270 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TPRP12270 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TPRP12270 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TPRP12270 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TPRP12270 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TPRP12270 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TPRP12270 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TPRP12270 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TPRP12270 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TPRP12270 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TPRP12270 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TPRP12270 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TPRP12270 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TPRP12270 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TPRP12270 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TPRP12270 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TPRP12270 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TPRP12270 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TPRP12270 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TPRP12270 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TPRP12270 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TPRP12270 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TPRP12270 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TPRP12270 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TPRP12270 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TPRP12270 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TPRP12270 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TPRP12270 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TPRP12270 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TPRP12270 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TPRP12270 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TPRP12270 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TPRP12270 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TPRP12270 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TPRP12270 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TPRP12270 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TPRP12270 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TPRP12270 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TPRP12270 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TPRP12270 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TPRP12270 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TPRP12270 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TPRP12270 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TPRP12270 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TPRP12270 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TPRP12270 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TPRP12270 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
TPRP12270 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TPRP12270 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TPRP12270 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TPRP12270 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TPRP12270 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
TPRP12270 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TPRP12270 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TPRP12270 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TPRP12270 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TPRP12270 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24■■□□□ 1.43
TPRP12270 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TPRP12270 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TPRP12270 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TPRP12270 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TPRP12270 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TPRP12270 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TPRP12270 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms