Protein–RNA interactions for Protein: P10966

CD8B, T-cell surface glycoprotein CD8 beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD8BP10966 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CD8BP10966 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CD8BP10966 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CD8BP10966 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CD8BP10966 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CD8BP10966 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CD8BP10966 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CD8BP10966 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CD8BP10966 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CD8BP10966 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CD8BP10966 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CD8BP10966 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CD8BP10966 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CD8BP10966 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CD8BP10966 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CD8BP10966 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CD8BP10966 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CD8BP10966 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CD8BP10966 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CD8BP10966 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CD8BP10966 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CD8BP10966 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CD8BP10966 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CD8BP10966 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CD8BP10966 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CD8BP10966 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CD8BP10966 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CD8BP10966 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CD8BP10966 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CD8BP10966 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CD8BP10966 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CD8BP10966 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CD8BP10966 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CD8BP10966 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CD8BP10966 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CD8BP10966 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CD8BP10966 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CD8BP10966 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CD8BP10966 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CD8BP10966 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CD8BP10966 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CD8BP10966 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CD8BP10966 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CD8BP10966 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CD8BP10966 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CD8BP10966 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CD8BP10966 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CD8BP10966 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CD8BP10966 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CD8BP10966 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CD8BP10966 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CD8BP10966 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CD8BP10966 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CD8BP10966 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CD8BP10966 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CD8BP10966 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CD8BP10966 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CD8BP10966 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CD8BP10966 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CD8BP10966 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CD8BP10966 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CD8BP10966 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CD8BP10966 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CD8BP10966 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CD8BP10966 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CD8BP10966 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CD8BP10966 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CD8BP10966 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CD8BP10966 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CD8BP10966 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CD8BP10966 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CD8BP10966 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CD8BP10966 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CD8BP10966 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CD8BP10966 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CD8BP10966 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CD8BP10966 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CD8BP10966 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CD8BP10966 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CD8BP10966 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CD8BP10966 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CD8BP10966 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CD8BP10966 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CD8BP10966 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CD8BP10966 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CD8BP10966 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CD8BP10966 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CD8BP10966 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CD8BP10966 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CD8BP10966 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CD8BP10966 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CD8BP10966 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CD8BP10966 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CD8BP10966 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CD8BP10966 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CD8BP10966 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CD8BP10966 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CD8BP10966 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CD8BP10966 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CD8BP10966 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.2 ms