Protein–RNA interactions for Protein: P06730

EIF4E, Eukaryotic translation initiation factor 4E, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4EP06730 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
EIF4EP06730 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
EIF4EP06730 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
EIF4EP06730 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EIF4EP06730 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EIF4EP06730 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EIF4EP06730 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EIF4EP06730 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EIF4EP06730 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EIF4EP06730 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
EIF4EP06730 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
EIF4EP06730 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
EIF4EP06730 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
EIF4EP06730 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
EIF4EP06730 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EIF4EP06730 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
EIF4EP06730 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
EIF4EP06730 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EIF4EP06730 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EIF4EP06730 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EIF4EP06730 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
EIF4EP06730 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EIF4EP06730 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EIF4EP06730 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
EIF4EP06730 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EIF4EP06730 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EIF4EP06730 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EIF4EP06730 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
EIF4EP06730 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EIF4EP06730 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EIF4EP06730 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
EIF4EP06730 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EIF4EP06730 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
EIF4EP06730 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
EIF4EP06730 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EIF4EP06730 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EIF4EP06730 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EIF4EP06730 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EIF4EP06730 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EIF4EP06730 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
EIF4EP06730 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
EIF4EP06730 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EIF4EP06730 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
EIF4EP06730 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EIF4EP06730 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
EIF4EP06730 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EIF4EP06730 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EIF4EP06730 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EIF4EP06730 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EIF4EP06730 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EIF4EP06730 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EIF4EP06730 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EIF4EP06730 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EIF4EP06730 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EIF4EP06730 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EIF4EP06730 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EIF4EP06730 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EIF4EP06730 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EIF4EP06730 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EIF4EP06730 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EIF4EP06730 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EIF4EP06730 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EIF4EP06730 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EIF4EP06730 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EIF4EP06730 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EIF4EP06730 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EIF4EP06730 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EIF4EP06730 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EIF4EP06730 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EIF4EP06730 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EIF4EP06730 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
EIF4EP06730 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
EIF4EP06730 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
EIF4EP06730 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
EIF4EP06730 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EIF4EP06730 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EIF4EP06730 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EIF4EP06730 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EIF4EP06730 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EIF4EP06730 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EIF4EP06730 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EIF4EP06730 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EIF4EP06730 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EIF4EP06730 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EIF4EP06730 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EIF4EP06730 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EIF4EP06730 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EIF4EP06730 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EIF4EP06730 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
EIF4EP06730 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EIF4EP06730 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EIF4EP06730 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EIF4EP06730 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EIF4EP06730 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EIF4EP06730 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EIF4EP06730 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
EIF4EP06730 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
EIF4EP06730 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
EIF4EP06730 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
EIF4EP06730 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms