Protein–RNA interactions for Protein: O94805

ACTL6B, Actin-like protein 6B, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTL6BO94805 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ACTL6BO94805 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ACTL6BO94805 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ACTL6BO94805 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ACTL6BO94805 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ACTL6BO94805 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ACTL6BO94805 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ACTL6BO94805 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
ACTL6BO94805 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ACTL6BO94805 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ACTL6BO94805 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
ACTL6BO94805 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ACTL6BO94805 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ACTL6BO94805 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ACTL6BO94805 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACTL6BO94805 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACTL6BO94805 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACTL6BO94805 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACTL6BO94805 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACTL6BO94805 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACTL6BO94805 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACTL6BO94805 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACTL6BO94805 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACTL6BO94805 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ACTL6BO94805 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ACTL6BO94805 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACTL6BO94805 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACTL6BO94805 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACTL6BO94805 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACTL6BO94805 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACTL6BO94805 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACTL6BO94805 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ACTL6BO94805 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ACTL6BO94805 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ACTL6BO94805 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ACTL6BO94805 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ACTL6BO94805 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
ACTL6BO94805 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ACTL6BO94805 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACTL6BO94805 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
ACTL6BO94805 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACTL6BO94805 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACTL6BO94805 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACTL6BO94805 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACTL6BO94805 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACTL6BO94805 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACTL6BO94805 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACTL6BO94805 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACTL6BO94805 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACTL6BO94805 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACTL6BO94805 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACTL6BO94805 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACTL6BO94805 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACTL6BO94805 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACTL6BO94805 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACTL6BO94805 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACTL6BO94805 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACTL6BO94805 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACTL6BO94805 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACTL6BO94805 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACTL6BO94805 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACTL6BO94805 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACTL6BO94805 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACTL6BO94805 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACTL6BO94805 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACTL6BO94805 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACTL6BO94805 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACTL6BO94805 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACTL6BO94805 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACTL6BO94805 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACTL6BO94805 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACTL6BO94805 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ACTL6BO94805 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACTL6BO94805 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACTL6BO94805 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACTL6BO94805 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACTL6BO94805 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACTL6BO94805 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACTL6BO94805 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACTL6BO94805 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ACTL6BO94805 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACTL6BO94805 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACTL6BO94805 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACTL6BO94805 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACTL6BO94805 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACTL6BO94805 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACTL6BO94805 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACTL6BO94805 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACTL6BO94805 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACTL6BO94805 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACTL6BO94805 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACTL6BO94805 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACTL6BO94805 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACTL6BO94805 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACTL6BO94805 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACTL6BO94805 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACTL6BO94805 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACTL6BO94805 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACTL6BO94805 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACTL6BO94805 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 651.9 ms