Protein–RNA interactions for Protein: O60583

CCNT2, Cyclin-T2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNT2O60583 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCNT2O60583 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCNT2O60583 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCNT2O60583 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCNT2O60583 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CCNT2O60583 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCNT2O60583 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCNT2O60583 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCNT2O60583 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCNT2O60583 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCNT2O60583 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCNT2O60583 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCNT2O60583 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCNT2O60583 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCNT2O60583 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCNT2O60583 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCNT2O60583 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCNT2O60583 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CCNT2O60583 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCNT2O60583 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCNT2O60583 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CCNT2O60583 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCNT2O60583 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCNT2O60583 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCNT2O60583 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCNT2O60583 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCNT2O60583 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCNT2O60583 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCNT2O60583 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCNT2O60583 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCNT2O60583 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCNT2O60583 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCNT2O60583 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCNT2O60583 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCNT2O60583 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCNT2O60583 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
CCNT2O60583 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCNT2O60583 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCNT2O60583 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCNT2O60583 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCNT2O60583 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCNT2O60583 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCNT2O60583 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCNT2O60583 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCNT2O60583 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCNT2O60583 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCNT2O60583 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCNT2O60583 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCNT2O60583 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCNT2O60583 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCNT2O60583 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCNT2O60583 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCNT2O60583 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCNT2O60583 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCNT2O60583 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCNT2O60583 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CCNT2O60583 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCNT2O60583 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCNT2O60583 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCNT2O60583 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCNT2O60583 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CCNT2O60583 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCNT2O60583 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCNT2O60583 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CCNT2O60583 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCNT2O60583 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCNT2O60583 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCNT2O60583 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCNT2O60583 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCNT2O60583 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCNT2O60583 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCNT2O60583 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCNT2O60583 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCNT2O60583 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCNT2O60583 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCNT2O60583 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCNT2O60583 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCNT2O60583 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCNT2O60583 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCNT2O60583 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCNT2O60583 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCNT2O60583 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCNT2O60583 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCNT2O60583 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCNT2O60583 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCNT2O60583 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCNT2O60583 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCNT2O60583 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCNT2O60583 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCNT2O60583 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCNT2O60583 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCNT2O60583 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCNT2O60583 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCNT2O60583 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCNT2O60583 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCNT2O60583 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCNT2O60583 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCNT2O60583 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCNT2O60583 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCNT2O60583 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms