Protein–RNA interactions for Protein: B2RXH2

KDM4E, Lysine-specific demethylase 4E, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM4EB2RXH2 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KDM4EB2RXH2 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KDM4EB2RXH2 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KDM4EB2RXH2 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KDM4EB2RXH2 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KDM4EB2RXH2 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KDM4EB2RXH2 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KDM4EB2RXH2 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KDM4EB2RXH2 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KDM4EB2RXH2 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KDM4EB2RXH2 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KDM4EB2RXH2 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KDM4EB2RXH2 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KDM4EB2RXH2 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KDM4EB2RXH2 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KDM4EB2RXH2 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KDM4EB2RXH2 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KDM4EB2RXH2 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KDM4EB2RXH2 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KDM4EB2RXH2 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KDM4EB2RXH2 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KDM4EB2RXH2 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KDM4EB2RXH2 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KDM4EB2RXH2 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KDM4EB2RXH2 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KDM4EB2RXH2 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KDM4EB2RXH2 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KDM4EB2RXH2 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KDM4EB2RXH2 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KDM4EB2RXH2 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KDM4EB2RXH2 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KDM4EB2RXH2 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KDM4EB2RXH2 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KDM4EB2RXH2 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
KDM4EB2RXH2 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KDM4EB2RXH2 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KDM4EB2RXH2 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KDM4EB2RXH2 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KDM4EB2RXH2 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KDM4EB2RXH2 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KDM4EB2RXH2 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KDM4EB2RXH2 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KDM4EB2RXH2 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KDM4EB2RXH2 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
KDM4EB2RXH2 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KDM4EB2RXH2 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KDM4EB2RXH2 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KDM4EB2RXH2 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KDM4EB2RXH2 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KDM4EB2RXH2 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KDM4EB2RXH2 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KDM4EB2RXH2 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KDM4EB2RXH2 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KDM4EB2RXH2 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KDM4EB2RXH2 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KDM4EB2RXH2 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KDM4EB2RXH2 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KDM4EB2RXH2 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KDM4EB2RXH2 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KDM4EB2RXH2 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KDM4EB2RXH2 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KDM4EB2RXH2 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KDM4EB2RXH2 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KDM4EB2RXH2 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KDM4EB2RXH2 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KDM4EB2RXH2 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KDM4EB2RXH2 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KDM4EB2RXH2 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
KDM4EB2RXH2 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
KDM4EB2RXH2 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
KDM4EB2RXH2 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KDM4EB2RXH2 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KDM4EB2RXH2 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KDM4EB2RXH2 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KDM4EB2RXH2 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KDM4EB2RXH2 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KDM4EB2RXH2 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KDM4EB2RXH2 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KDM4EB2RXH2 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KDM4EB2RXH2 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KDM4EB2RXH2 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KDM4EB2RXH2 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KDM4EB2RXH2 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KDM4EB2RXH2 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KDM4EB2RXH2 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KDM4EB2RXH2 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KDM4EB2RXH2 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KDM4EB2RXH2 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KDM4EB2RXH2 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KDM4EB2RXH2 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KDM4EB2RXH2 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KDM4EB2RXH2 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KDM4EB2RXH2 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
KDM4EB2RXH2 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KDM4EB2RXH2 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KDM4EB2RXH2 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KDM4EB2RXH2 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KDM4EB2RXH2 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KDM4EB2RXH2 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
KDM4EB2RXH2 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms