Protein–RNA interactions for Protein: B2RBV5

Putative MORF4 family-associated protein 1-like protein UPP, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B2RBV5 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
B2RBV5 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
B2RBV5 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
B2RBV5 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
B2RBV5 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
B2RBV5 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
B2RBV5 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
B2RBV5 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
B2RBV5 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
B2RBV5 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
B2RBV5 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
B2RBV5 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
B2RBV5 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
B2RBV5 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
B2RBV5 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
B2RBV5 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
B2RBV5 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
B2RBV5 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
B2RBV5 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
B2RBV5 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
B2RBV5 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
B2RBV5 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
B2RBV5 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
B2RBV5 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
B2RBV5 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
B2RBV5 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
B2RBV5 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
B2RBV5 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
B2RBV5 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
B2RBV5 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
B2RBV5 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
B2RBV5 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
B2RBV5 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
B2RBV5 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
B2RBV5 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
B2RBV5 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
B2RBV5 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
B2RBV5 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
B2RBV5 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
B2RBV5 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
B2RBV5 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
B2RBV5 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
B2RBV5 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
B2RBV5 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
B2RBV5 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
B2RBV5 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
B2RBV5 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
B2RBV5 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
B2RBV5 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
B2RBV5 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
B2RBV5 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
B2RBV5 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
B2RBV5 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
B2RBV5 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
B2RBV5 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
B2RBV5 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
B2RBV5 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
B2RBV5 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
B2RBV5 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
B2RBV5 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
B2RBV5 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
B2RBV5 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
B2RBV5 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
B2RBV5 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
B2RBV5 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
B2RBV5 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
B2RBV5 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
B2RBV5 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
B2RBV5 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
B2RBV5 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
B2RBV5 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
B2RBV5 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
B2RBV5 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
B2RBV5 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
B2RBV5 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
B2RBV5 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
B2RBV5 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
B2RBV5 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
B2RBV5 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
B2RBV5 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
B2RBV5 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
B2RBV5 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
B2RBV5 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
B2RBV5 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
B2RBV5 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
B2RBV5 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
B2RBV5 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
B2RBV5 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
B2RBV5 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
B2RBV5 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
B2RBV5 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
B2RBV5 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
B2RBV5 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
B2RBV5 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
B2RBV5 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
B2RBV5 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
B2RBV5 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
B2RBV5 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
B2RBV5 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
B2RBV5 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms