RNA–Protein interactions for RNA: YHR069C

RRP4, Transcript of Exosome non-catalytic core component, yeastyeast

Gene RRP4, Length 1,080 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RRP4YHR069C MTC1P47018 478 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
RRP4YHR069C DRS1P32892 752 aaKnown RBP11.84□□□□□ -0.51
RRP4YHR069C MON2P48563 1636 aaPredicted RBP10.97□□□□□ -0.65
RRP4YHR069C SGS1P35187 1447 aa10.89□□□□□ -0.67
RRP4YHR069C INO80P53115 1489 aa10.86□□□□□ -0.67
RRP4YHR069C TCB3Q03640 1545 aaKnown RBP10.76□□□□□ -0.69
RRP4YHR069C TY1B-DR4Q07793 1604 aa10.74□□□□□ -0.69
RRP4YHR069C SWR1Q05471 1514 aa10.61□□□□□ -0.71
RRP4YHR069C HSL1P34244 1518 aa10.43□□□□□ -0.74
RRP4YHR069C DNA2P38859 1522 aa10.41□□□□□ -0.74
RRP4YHR069C SPT6P23615 1451 aaKnown RBP10.38□□□□□ -0.75
RRP4YHR069C KOG1P38873 1557 aa10.31□□□□□ -0.76
RRP4YHR069C SSN2P38931 1420 aa10.25□□□□□ -0.77
RRP4YHR069C SPA2P23201 1466 aaKnown RBP10.23□□□□□ -0.77
RRP4YHR069C HIR3P47171 1648 aa10.22□□□□□ -0.77
RRP4YHR069C BFR2Q06631 534 aaKnown RBP10.14□□□□□ -0.79
RRP4YHR069C DIP2Q12220 943 aaPredicted RBP10.13□□□□□ -0.79
RRP4YHR069C XRN1P22147 1528 aaKnown RBP10.07□□□□□ -0.8
RRP4YHR069C FAP1P53971 965 aa10.03□□□□□ -0.8
RRP4YHR069C THO2P53552 1597 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
RRP4YHR069C AVT3P36062 692 aa9.96□□□□□ -0.82
RRP4YHR069C ECM5Q03214 1411 aa9.96□□□□□ -0.82
RRP4YHR069C BUD4P47136 1447 aa9.94□□□□□ -0.82
RRP4YHR069C REV3P14284 1504 aa9.93□□□□□ -0.82
RRP4YHR069C SIN3P22579 1536 aa9.87□□□□□ -0.83
RRP4YHR069C ATG2P53855 1592 aa9.84□□□□□ -0.83
RRP4YHR069C PEP1P32319 1579 aa9.83□□□□□ -0.84
RRP4YHR069C MDS3P53094 1487 aa9.82□□□□□ -0.84
RRP4YHR069C SSK2P53599 1579 aa9.79□□□□□ -0.84
RRP4YHR069C TAF2P23255 1407 aa9.75□□□□□ -0.85
RRP4YHR069C ISW2Q08773 1120 aa9.74□□□□□ -0.85
RRP4YHR069C ESP1Q03018 1630 aa9.73□□□□□ -0.85
RRP4YHR069C PRI1P10363 409 aa9.71□□□□□ -0.86
RRP4YHR069C RSE1Q04693 1361 aaKnown RBP9.7□□□□□ -0.86
RRP4YHR069C RPG1P38249 964 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.86
RRP4YHR069C SKI3P17883 1432 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.87
RRP4YHR069C MYO2P19524 1574 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
RRP4YHR069C YPK9Q12697 1472 aa9.57□□□□□ -0.88
RRP4YHR069C AAD16Q02895 342 aa9.56□□□□□ -0.88
RRP4YHR069C SCC2Q04002 1493 aa9.53□□□□□ -0.88
RRP4YHR069C BPT1P14772 1559 aa9.52□□□□□ -0.89
RRP4YHR069C RPO31P04051 1460 aa9.47□□□□□ -0.89
RRP4YHR069C UFD4P33202 1483 aa9.47□□□□□ -0.89
RRP4YHR069C TY2B-LR1P0C2J3 1770 aa9.45□□□□□ -0.9
RRP4YHR069C TY2B-FP0CX63 1770 aa9.45□□□□□ -0.9
RRP4YHR069C TY2B-GR2P0CX64 1770 aa9.45□□□□□ -0.9
RRP4YHR069C TY2B-CP25384 1770 aa9.45□□□□□ -0.9
RRP4YHR069C TY2B-DR2Q03494 1770 aa9.45□□□□□ -0.9
RRP4YHR069C TY1B-DR1Q03855 1755 aa9.45□□□□□ -0.9
RRP4YHR069C TY2B-DR3Q07791 1770 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
RRP4YHR069C TY2B-OR1Q12113 1770 aa9.45□□□□□ -0.9
RRP4YHR069C TY2B-DR1Q12472 1770 aa9.45□□□□□ -0.9
RRP4YHR069C TY2B-OR2Q12501 1770 aa9.45□□□□□ -0.9
RRP4YHR069C POL1P13382 1468 aa9.41□□□□□ -0.9
RRP4YHR069C TFA1P36100 482 aa9.41□□□□□ -0.9
RRP4YHR069C YCF1P39109 1515 aaKnown RBP9.41□□□□□ -0.9
RRP4YHR069C PRY3P47033 881 aa9.4□□□□□ -0.9
RRP4YHR069C RKR1Q04781 1562 aa9.37□□□□□ -0.91
RRP4YHR069C TY1B-DR3Q99231 1755 aa9.36□□□□□ -0.91
RRP4YHR069C TY1B-BRQ12193 1756 aa9.35□□□□□ -0.91
RRP4YHR069C TY1B-GR3Q12316 1755 aa9.35□□□□□ -0.91
RRP4YHR069C TY1B-ORQ92393 1755 aa9.35□□□□□ -0.91
RRP4YHR069C TOP2P06786 1428 aaKnown RBP9.35□□□□□ -0.91
RRP4YHR069C STU1P38198 1513 aa9.34□□□□□ -0.91
RRP4YHR069C TY2B-BQ12491 1770 aa9.34□□□□□ -0.91
RRP4YHR069C TY1B-HO13535 1793 aa9.3□□□□□ -0.92
RRP4YHR069C TY1B-DR5P0C2I2 1755 aa9.3□□□□□ -0.92
RRP4YHR069C TY1B-DR6P0C2I3 1755 aa9.3□□□□□ -0.92
RRP4YHR069C TY1B-LR2P0C2I5 1755 aa9.3□□□□□ -0.92
RRP4YHR069C TY1B-LR3P0C2I6 1755 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
RRP4YHR069C TY1B-PR1P0C2I9 1755 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
RRP4YHR069C TY1B-PR2P0C2J0 1756 aa9.3□□□□□ -0.92
RRP4YHR069C TY1B-PR3P0C2J1 1755 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
RRP4YHR069C TY1B-JR1P47098 1755 aa9.3□□□□□ -0.92
RRP4YHR069C TY1B-ML2Q03434 1755 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
RRP4YHR069C TY1B-ER1Q03612 1755 aa9.3□□□□□ -0.92
RRP4YHR069C TY1B-ML1Q04711 1755 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
RRP4YHR069C TY1B-GR2Q12269 1755 aa9.3□□□□□ -0.92
RRP4YHR069C TY1B-OLQ12273 1755 aa9.3□□□□□ -0.92
RRP4YHR069C TY1B-PLQ12414 1755 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
RRP4YHR069C YOR1P53049 1477 aa9.3□□□□□ -0.92
RRP4YHR069C CDC25P04821 1589 aa9.29□□□□□ -0.92
RRP4YHR069C CHD1P32657 1468 aa9.28□□□□□ -0.92
RRP4YHR069C RPL17AP05740 184 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
RRP4YHR069C RPL17BP46990 184 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
RRP4YHR069C SMC4Q12267 1418 aa9.25□□□□□ -0.93
RRP4YHR069C TSR3Q12094 313 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
RRP4YHR069C PAN1P32521 1480 aa9.21□□□□□ -0.93
RRP4YHR069C DNF1P32660 1571 aa9.21□□□□□ -0.93
RRP4YHR069C ESC1Q03661 1658 aaKnown RBP9.21□□□□□ -0.93
RRP4YHR069C MMS22Q06164 1454 aa9.19□□□□□ -0.94
RRP4YHR069C RPA190P10964 1664 aaKnown RBP9.17□□□□□ -0.94
RRP4YHR069C YTA7P40340 1379 aa9.15□□□□□ -0.94
RRP4YHR069C REB1P21538 810 aa9.15□□□□□ -0.94
RRP4YHR069C MYO4P32492 1471 aa9.14□□□□□ -0.95
RRP4YHR069C SPP41P38904 1435 aa9.14□□□□□ -0.95
RRP4YHR069C RQC2Q12532 1038 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
RRP4YHR069C TY1B-JR2P47100 1755 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
RRP4YHR069C TY1B-ER2Q03619 1755 aa9.13□□□□□ -0.95
RRP4YHR069C TY1B-MR1Q04214 1755 aa9.13□□□□□ -0.95
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