RNA–Protein interactions for RNA: YHR108W

GGA2, Transcript of Protein that regulates Arf1p, Arf2p to facilitate Golgi trafficking, yeast

Gene GGA2, Length 1,758 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
GGA2	YHR108W	LYS14	P40971	790 aa		9.19	□□□□□ -0.94
GGA2	YHR108W	TRS120	Q04183	1289 aa		9.19	□□□□□ -0.94
GGA2	YHR108W	CDC37	P06101	506 aa	Known RBP	9.19	□□□□□ -0.94
GGA2	YHR108W	PDC1	P06169	563 aa	Known RBP	9.19	□□□□□ -0.94
GGA2	YHR108W	SRP54	P20424	541 aa	Known RBP	9.19	□□□□□ -0.94
GGA2	YHR108W	MSH3	P25336	1018 aa		9.19	□□□□□ -0.94
GGA2	YHR108W	SEC20	P28791	383 aa		9.19	□□□□□ -0.94
GGA2	YHR108W	RET3	P53600	189 aa		9.19	□□□□□ -0.94
GGA2	YHR108W	KIN4	Q01919	800 aa		9.19	□□□□□ -0.94
GGA2	YHR108W	CSM3	Q04659	317 aa		9.19	□□□□□ -0.94
GGA2	YHR108W	PHO13	P19881	312 aa		9.18	□□□□□ -0.94
GGA2	YHR108W	CHS3	P29465	1165 aa		9.18	□□□□□ -0.94
GGA2	YHR108W	BCD1	P38772	366 aa		9.18	□□□□□ -0.94
GGA2	YHR108W	VPS45	P38932	577 aa		9.18	□□□□□ -0.94
GGA2	YHR108W	SDA1	P53313	767 aa	Known RBP	9.18	□□□□□ -0.94
GGA2	YHR108W	BNI5	P53890	448 aa	Known RBP	9.18	□□□□□ -0.94
GGA2	YHR108W	SEN54	Q02825	467 aa	Predicted RBP	9.18	□□□□□ -0.94
GGA2	YHR108W	SKG3	Q06315	1026 aa		9.18	□□□□□ -0.94
GGA2	YHR108W	SLK19	Q08581	821 aa	Known RBP	9.18	□□□□□ -0.94
GGA2	YHR108W	FLO11	P08640	1367 aa		9.18	□□□□□ -0.94
GGA2	YHR108W	TUF1	P02992	437 aa	Known RBP	9.17	□□□□□ -0.94
GGA2	YHR108W	RPS9B	P05755	195 aa	Known RBP	9.17	□□□□□ -0.94
GGA2	YHR108W	CEP3	P40969	608 aa		9.17	□□□□□ -0.94
GGA2	YHR108W	OSW7	P43611	510 aa		9.17	□□□□□ -0.94
GGA2	YHR108W	FYV8	P46949	817 aa	Known RBP	9.17	□□□□□ -0.94
GGA2	YHR108W	UBA2	P52488	636 aa		9.17	□□□□□ -0.94
GGA2	YHR108W	DSE4	P53753	1117 aa		9.17	□□□□□ -0.94
GGA2	YHR108W	CRF1	Q04930	467 aa		9.17	□□□□□ -0.94
GGA2	YHR108W	YDL124W	Q07551	312 aa	Known RBP	9.17	□□□□□ -0.94
GGA2	YHR108W	SFI1	Q12369	946 aa		9.17	□□□□□ -0.94
GGA2	YHR108W	TOP1	P04786	769 aa		9.17	□□□□□ -0.94
GGA2	YHR108W	SPT8	P38915	602 aa		9.17	□□□□□ -0.94
GGA2	YHR108W	VTC2	P43585	828 aa		9.17	□□□□□ -0.94
GGA2	YHR108W	YGR153W	P48238	217 aa		9.17	□□□□□ -0.94
GGA2	YHR108W	YGR237C	P50089	785 aa		9.17	□□□□□ -0.94
GGA2	YHR108W	AAD16	Q02895	342 aa		9.17	□□□□□ -0.94
GGA2	YHR108W	MYO1	P08964	1928 aa		9.16	□□□□□ -0.94
GGA2	YHR108W	MRC1	P25588	1096 aa		9.16	□□□□□ -0.94
GGA2	YHR108W	YJL171C	P46992	396 aa		9.16	□□□□□ -0.94
GGA2	YHR108W	STR2	P47164	639 aa		9.16	□□□□□ -0.94
GGA2	YHR108W	VPS60	Q03390	229 aa		9.16	□□□□□ -0.94
GGA2	YHR108W	VIP1	Q06685	1146 aa	Known RBP	9.16	□□□□□ -0.94
GGA2	YHR108W	TLG2	Q08144	397 aa		9.16	□□□□□ -0.94
GGA2	YHR108W	APL4	Q12028	832 aa		9.16	□□□□□ -0.94
GGA2	YHR108W	DIP2	Q12220	943 aa	Predicted RBP	9.16	□□□□□ -0.94
GGA2	YHR108W	YET1	P35723	206 aa		9.15	□□□□□ -0.94
GGA2	YHR108W	CST26	P38226	397 aa		9.15	□□□□□ -0.94
GGA2	YHR108W	TCD1	P38756	429 aa		9.15	□□□□□ -0.94
GGA2	YHR108W	CTM1	P38818	585 aa		9.15	□□□□□ -0.94
GGA2	YHR108W	SHC1	P39000	512 aa		9.15	□□□□□ -0.94
GGA2	YHR108W	THI6	P41835	540 aa		9.15	□□□□□ -0.94
GGA2	YHR108W	ASE1	P50275	885 aa		9.15	□□□□□ -0.94
GGA2	YHR108W	SPP382	Q06411	708 aa	Predicted RBP	9.15	□□□□□ -0.94
GGA2	YHR108W	RPL8A	P17076	256 aa	Known RBP	9.14	□□□□□ -0.95
GGA2	YHR108W	ADP1	P25371	1049 aa		9.14	□□□□□ -0.95
GGA2	YHR108W	SPB4	P25808	606 aa	Predicted RBP	9.14	□□□□□ -0.95
GGA2	YHR108W	SEC65	P29478	273 aa		9.14	□□□□□ -0.95
GGA2	YHR108W	YBL028C	P38202	106 aa		9.14	□□□□□ -0.95
GGA2	YHR108W	SNU71	P53207	620 aa	Known RBP	9.14	□□□□□ -0.95
GGA2	YHR108W	LSB1	P53281	241 aa		9.14	□□□□□ -0.95
GGA2	YHR108W	EBS1	Q03466	884 aa	Known RBP	9.14	□□□□□ -0.95
GGA2	YHR108W	TUS1	Q06412	1307 aa		9.14	□□□□□ -0.95
GGA2	YHR108W	FOB1	O13329	566 aa		9.14	□□□□□ -0.95
GGA2	YHR108W	KIN1	P13185	1064 aa		9.14	□□□□□ -0.95
GGA2	YHR108W	LEO1	P38439	464 aa		9.14	□□□□□ -0.95
GGA2	YHR108W	COG4	Q06096	861 aa		9.14	□□□□□ -0.95
GGA2	YHR108W	PET123	P17558	318 aa		9.13	□□□□□ -0.95
GGA2	YHR108W	MSM1	P22438	575 aa		9.13	□□□□□ -0.95
GGA2	YHR108W	PSO2	P30620	661 aa		9.13	□□□□□ -0.95
GGA2	YHR108W	PCH2	P38126	564 aa		9.13	□□□□□ -0.95
GGA2	YHR108W	RTT107	P38850	1070 aa		9.13	□□□□□ -0.95
GGA2	YHR108W	CAJ1	P39101	391 aa		9.13	□□□□□ -0.95
GGA2	YHR108W	UBP9	P39967	754 aa		9.13	□□□□□ -0.95
GGA2	YHR108W	ATG32	P40458	529 aa		9.13	□□□□□ -0.95
GGA2	YHR108W	CIT3	P43635	486 aa		9.13	□□□□□ -0.95
GGA2	YHR108W	LSC2	P53312	427 aa		9.13	□□□□□ -0.95
GGA2	YHR108W	VPS38	Q05919	439 aa		9.13	□□□□□ -0.95
GGA2	YHR108W	PMA1	P05030	918 aa	Known RBP	9.12	□□□□□ -0.95
GGA2	YHR108W	CKA2	P19454	339 aa		9.12	□□□□□ -0.95
GGA2	YHR108W	SRO9	P25567	434 aa	Known RBP	9.12	□□□□□ -0.95
GGA2	YHR108W	PWP2	P25635	923 aa	Known RBP	9.12	□□□□□ -0.95
GGA2	YHR108W	PXL1	P36166	706 aa		9.12	□□□□□ -0.95
GGA2	YHR108W	EFM2	P38347	419 aa		9.12	□□□□□ -0.95
GGA2	YHR108W	ALF1	P53904	254 aa		9.12	□□□□□ -0.95
GGA2	YHR108W	ATG9	Q12142	997 aa		9.12	□□□□□ -0.95
GGA2	YHR108W	GSC2	P40989	1895 aa		9.12	□□□□□ -0.95
GGA2	YHR108W	PET111	P08468	800 aa		9.12	□□□□□ -0.95
GGA2	YHR108W	SAM2	P19358	384 aa	Known RBP	9.12	□□□□□ -0.95
GGA2	YHR108W	GSY1	P23337	708 aa		9.12	□□□□□ -0.95
GGA2	YHR108W	RRP43	P25359	394 aa	Predicted RBP	9.12	□□□□□ -0.95
GGA2	YHR108W	PET10	P36139	283 aa		9.12	□□□□□ -0.95
GGA2	YHR108W	ERG7	P38604	731 aa		9.12	□□□□□ -0.95
GGA2	YHR108W	AIP1	P46680	615 aa	Known RBP	9.12	□□□□□ -0.95
GGA2	YHR108W	APT1	P49435	187 aa	Known RBP	9.12	□□□□□ -0.95
GGA2	YHR108W	MTC3	P53077	123 aa		9.12	□□□□□ -0.95
GGA2	YHR108W	OM45	P16547	393 aa		9.11	□□□□□ -0.95
GGA2	YHR108W	SPO11	P23179	398 aa		9.11	□□□□□ -0.95
GGA2	YHR108W	YLR287C	Q05881	355 aa		9.11	□□□□□ -0.95
GGA2	YHR108W	ADY4	Q05955	493 aa		9.11	□□□□□ -0.95
GGA2	YHR108W	LAP2	Q10740	671 aa		9.11	□□□□□ -0.95

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