Protein–RNA interactions for Protein: P53312

LSC2, Succinate--CoA ligase [ADP-forming] subunit beta, mitochondrial, yeastyeast

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Length 427 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
LSC2P53312 YML009W-BYML009W-B 477 nt22.41■■□□□ 1.18
LSC2P53312 NSR1YGR159C 1245 nt22.38■■□□□ 1.17
LSC2P53312 NOP1YDL014W 984 nt21.6■■□□□ 1.05
LSC2P53312 MDJ1YFL016C 1536 nt20.17■□□□□ 0.82
LSC2P53312 YKL036CYKL036C 393 nt19.85■□□□□ 0.77
LSC2P53312 SRX1YKL086W 384 nt18.97■□□□□ 0.63
LSC2P53312 Q0297Q0297 156 nt18.96■□□□□ 0.63
LSC2P53312 YJL027CYJL027C 417 nt18.49■□□□□ 0.55
LSC2P53312 SCS3YGL126W 1143 nt18.06■□□□□ 0.48
LSC2P53312 YCR051WYCR051W 669 nt17.96■□□□□ 0.47
LSC2P53312 DBP2YNL112W 1641 nt17.83■□□□□ 0.44
LSC2P53312 TRN1tP(UGG)A 72 nt17.31■□□□□ 0.36
LSC2P53312 SUF9tP(UGG)F 72 nt17.31■□□□□ 0.36
LSC2P53312 SUF8tP(UGG)H 72 nt17.31■□□□□ 0.36
LSC2P53312 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt17.31■□□□□ 0.36
LSC2P53312 SUF7tP(UGG)M 72 nt17.31■□□□□ 0.36
LSC2P53312 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt17.31■□□□□ 0.36
LSC2P53312 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt17.31■□□□□ 0.36
LSC2P53312 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt17.31■□□□□ 0.36
LSC2P53312 SUF11tP(UGG)O2 72 nt17.31■□□□□ 0.36
LSC2P53312 YOL085CYOL085C 342 nt17.25■□□□□ 0.35
LSC2P53312 YBR190WYBR190W 312 nt17.14■□□□□ 0.33
LSC2P53312 CCC1YLR220W 969 nt17.09■□□□□ 0.33
LSC2P53312 PKP1YIL042C 1185 nt17.05■□□□□ 0.32
LSC2P53312 RPP1BYDL130W 321 nt17■□□□□ 0.31
LSC2P53312 RTC3YHR087W 336 nt16.72■□□□□ 0.27
LSC2P53312 SCJ1YMR214W 1134 nt16.61■□□□□ 0.25
LSC2P53312 RVS167YDR388W 1449 nt16.49■□□□□ 0.23
LSC2P53312 PET122YER153C 765 nt16.33■□□□□ 0.2
LSC2P53312 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt16.3■□□□□ 0.2
LSC2P53312 ATS1YAL020C 1002 nt16.07■□□□□ 0.16
LSC2P53312 SHR5YOL110W 714 nt15.96■□□□□ 0.15
LSC2P53312 SCR1SCR1 522 nt15.95■□□□□ 0.14
LSC2P53312 RRN5YLR141W 1092 nt15.81■□□□□ 0.12
LSC2P53312 PUT4YOR348C 1884 nt15.81■□□□□ 0.12
LSC2P53312 YDJ1YNL064C 1230 nt15.73■□□□□ 0.11
LSC2P53312 URN1YPR152C 1398 nt15.65■□□□□ 0.1
LSC2P53312 DEP1YAL013W 1218 nt15.63■□□□□ 0.09
LSC2P53312 YER088W-BYER088W-B 147 nt15.52■□□□□ 0.08
LSC2P53312 ARE1YCR048W 1833 nt15.47■□□□□ 0.07
LSC2P53312 OPI9YLR338W 858 nt15.46■□□□□ 0.07
LSC2P53312 SAH1YER043C 1350 nt15.45■□□□□ 0.06
LSC2P53312 GAR1YHR089C 618 nt15.43■□□□□ 0.06
LSC2P53312 RSB1YOR049C 1065 nt15.39■□□□□ 0.05
LSC2P53312 YNL208WYNL208W 600 nt15.28■□□□□ 0.04
LSC2P53312 POA1YBR022W 534 nt15.26■□□□□ 0.03
LSC2P53312 RPN10YHR200W 807 nt15.25■□□□□ 0.03
LSC2P53312 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt15.24■□□□□ 0.03
LSC2P53312 SSA3YBL075C 1950 nt15.16■□□□□ 0.02
LSC2P53312 BSC6YOL137W 1494 nt14.98□□□□□ -0.01
LSC2P53312 PUN1YLR414C 792 nt14.95□□□□□ -0.02
LSC2P53312 PST2YDR032C 597 nt14.94□□□□□ -0.02
LSC2P53312 TIR1YER011W 765 nt14.92□□□□□ -0.02
LSC2P53312 YJR018WYJR018W 363 nt14.9□□□□□ -0.02
LSC2P53312 SSA1YAL005C 1929 nt14.86□□□□□ -0.03
LSC2P53312 PTC2YER089C 1395 nt14.85□□□□□ -0.03
LSC2P53312 BUD23YCR047C 828 nt14.82□□□□□ -0.04
LSC2P53312 YJR120WYJR120W 351 nt14.82□□□□□ -0.04
LSC2P53312 SRB2YHR041C 633 nt14.72□□□□□ -0.05
LSC2P53312 NAB2YGL122C 1578 nt14.64□□□□□ -0.07
LSC2P53312 FIS1YIL065C 468 nt14.55□□□□□ -0.08
LSC2P53312 SPT5YML010W 3192 nt14.53□□□□□ -0.08
LSC2P53312 RPP2BYDR382W 333 nt14.45□□□□□ -0.1
LSC2P53312 DAL1YIR027C 1383 nt14.44□□□□□ -0.1
LSC2P53312 SHU1YHL006C 453 nt14.41□□□□□ -0.1
LSC2P53312 FPR4YLR449W 1179 nt14.38□□□□□ -0.11
LSC2P53312 PHO4YFR034C 939 nt14.34□□□□□ -0.11
LSC2P53312 INM2YDR287W 879 nt14.33□□□□□ -0.12
LSC2P53312 WWM1YFL010C 636 nt14.29□□□□□ -0.12
LSC2P53312 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt14.25□□□□□ -0.13
LSC2P53312 BDH2YAL061W 1254 nt14.23□□□□□ -0.13
LSC2P53312 YBL100CYBL100C 315 nt14.22□□□□□ -0.13
LSC2P53312 YKL097CYKL097C 411 nt14.18□□□□□ -0.14
LSC2P53312 YPS1YLR120C 1710 nt14.13□□□□□ -0.15
LSC2P53312 HOM6YJR139C 1080 nt14.08□□□□□ -0.16
LSC2P53312 FUN26YAL022C 1554 nt14.07□□□□□ -0.16
LSC2P53312 MEP2YNL142W 1500 nt14.06□□□□□ -0.16
LSC2P53312 MNP1YGL068W 585 nt14.04□□□□□ -0.16
LSC2P53312 YDR095CYDR095C 411 nt14.02□□□□□ -0.17
LSC2P53312 YGR021WYGR021W 873 nt14.02□□□□□ -0.17
LSC2P53312 SSA4YER103W 1929 nt13.98□□□□□ -0.17
LSC2P53312 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt13.98□□□□□ -0.17
LSC2P53312 LSM3YLR438C-A 270 nt13.97□□□□□ -0.17
LSC2P53312 TRM9YML014W 840 nt13.93□□□□□ -0.18
LSC2P53312 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt13.92□□□□□ -0.18
LSC2P53312 DCW1YKL046C 1350 nt13.92□□□□□ -0.18
LSC2P53312 CCT6YDR188W 1641 nt13.88□□□□□ -0.19
LSC2P53312 RKM5YLR137W 1104 nt13.86□□□□□ -0.19
LSC2P53312 ALF1YNL148C 765 nt13.81□□□□□ -0.2
LSC2P53312 PTP1YDL230W 1008 nt13.8□□□□□ -0.2
LSC2P53312 YOR139CYOR139C 393 nt13.78□□□□□ -0.2
LSC2P53312 CAC2YML102W 1407 nt13.72□□□□□ -0.21
LSC2P53312 SIS1YNL007C 1059 nt13.71□□□□□ -0.21
LSC2P53312 RPP2AYOL039W 321 nt13.71□□□□□ -0.21
LSC2P53312 EMI2YDR516C 1503 nt13.66□□□□□ -0.22
LSC2P53312 SUF2tP(AGG)C 72 nt13.65□□□□□ -0.22
LSC2P53312 SUF10tP(AGG)N 72 nt13.65□□□□□ -0.22
LSC2P53312 YOL037CYOL037C 354 nt13.61□□□□□ -0.23
LSC2P53312 ART5YGR068C 1761 nt13.55□□□□□ -0.24
LSC2P53312 YDL221WYDL221W 552 nt13.55□□□□□ -0.24
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