RNA–Protein interactions for RNA: YDR457W

TOM1, Transcript of E3 ubiquitin ligase of the hect-domain class, yeast

Gene TOM1, Length 9,807 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TOM1	YDR457W	YAF9	P53930	226 aa		2.96	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	TMA20	P89886	181 aa	Predicted RBP	2.96	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	RKM2	Q03942	479 aa		2.96	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	HDA3	Q06623	655 aa		2.96	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	KEL3	Q08979	651 aa	Predicted RBP	2.96	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	RPO26	P20435	155 aa		2.96	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	APL1	P27351	700 aa		2.96	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	CHS3	P29465	1165 aa		2.96	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	PXA2	P34230	853 aa		2.96	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	MGE1	P38523	228 aa		2.96	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	FET4	P40988	552 aa		2.96	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	NMD5	P46970	1048 aa		2.96	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	RMT2	Q03305	412 aa		2.96	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	YDR341C	Q05506	607 aa	Known RBP	2.96	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	COG4	Q06096	861 aa		2.96	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	MMR1	Q06324	491 aa		2.96	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	SAC3	P46674	1301 aa		2.96	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	CLB2	P24869	491 aa		2.96	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	RVS161	P25343	265 aa	Known RBP	2.96	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	HEF3	P53978	1044 aa	Known RBP	2.96	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	ATG38	Q05789	226 aa	Known RBP	2.96	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	RPB4	P20433	221 aa	Predicted RBP	2.95	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	POL4	P25615	582 aa		2.95	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	ISW1	P38144	1129 aa		2.95	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	RFC5	P38251	354 aa		2.95	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	TPO2	P53283	614 aa		2.95	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	MGR3	Q04472	501 aa		2.95	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	VPS38	Q05919	439 aa		2.95	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	CFT2	Q12102	859 aa	Predicted RBP	2.95	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	STI1	P15705	589 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.95	□□□□□ -1.94	RIP-Chip
TOM1	YDR457W	LAM5	P43560	674 aa		2.95	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	IES1	P43579	692 aa		2.95	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	SDH5	Q08230	162 aa		2.95	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	FEX2	Q08991	375 aa		2.95	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	EDE1	P34216	1381 aa		2.95	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	AAD3	P25612	363 aa		2.95	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	RPT2	P40327	437 aa	Known RBP	2.95	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	FAR11	P53917	953 aa		2.95	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	HOT1	Q03213	719 aa		2.95	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	RRP15	Q06511	250 aa	Predicted RBP	2.95	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	SSB1	P11484	613 aa	Known RBP	2.95	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	RPC53	P25441	422 aa		2.95	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	SDS22	P36047	338 aa		2.95	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	THO1	P40040	218 aa	Known RBP	2.95	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	SSB2	P40150	613 aa	Known RBP	2.95	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	UTP6	Q02354	440 aa	Known RBP	2.95	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	KRE28	Q04431	385 aa		2.95	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	TIP41	Q12199	356 aa		2.95	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	RTC1	Q08281	1341 aa		2.95	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	OSH3	P38713	996 aa	Known RBP	2.95	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	MTR4	P47047	1073 aa	Known RBP	2.95	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	CAF130	P53280	1122 aa	Predicted RBP	2.95	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	UBP3	Q01477	912 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.95	□□□□□ -1.94	not detected
TOM1	YDR457W	MMT1	Q03218	510 aa		2.95	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	GSF2	Q04697	403 aa	Known RBP	2.95	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	YOS9	Q99220	542 aa		2.95	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	TUS1	Q06412	1307 aa		2.95	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	GPA1	P08539	472 aa		2.95	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	TRL1	P09880	827 aa	Known RBP	2.95	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	VPS53	P47061	822 aa		2.95	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	TRF5	P48561	642 aa	Known RBP	2.95	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	PUS4	P48567	403 aa	Known RBP	2.95	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	DBP5	P20449	482 aa	Known RBP	2.95	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	ECM25	P32525	599 aa		2.95	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	LNP1	P38878	278 aa		2.95	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	PLP1	Q04004	230 aa		2.95	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	ICL2	Q12031	575 aa		2.95	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	MRPL36	P36531	177 aa		2.95	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	FYV10	P40492	516 aa		2.95	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	COS6	P53344	381 aa		2.95	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	CWC25	P53854	179 aa	Known RBP	2.95	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	TRS33	Q99394	268 aa		2.95	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	SWR1	Q05471	1514 aa		2.95	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	MAG1	P22134	296 aa	Known RBP	2.94	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	YKR018C	P36114	725 aa		2.94	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	TOM20	P35180	183 aa		2.94	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	PXL1	P36166	706 aa		2.94	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	HLJ1	P48353	224 aa		2.94	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	MUM3	Q08750	479 aa		2.94	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	TRP5	P00931	707 aa	Known RBP	2.94	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	MIS1	P09440	975 aa	Known RBP	2.94	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	ALD2	P47771	506 aa		2.94	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	YGR016W	P53209	190 aa		2.94	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	ALD3	P54114	506 aa		2.94	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	SAS4	Q04003	481 aa		2.94	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	FEX1	Q08913	375 aa		2.94	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	AVL9	Q12500	764 aa		2.94	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	SEC8	P32855	1065 aa		2.94	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	TIF11	P38912	153 aa	Known RBP	2.94	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	YIL092W	P40497	633 aa		2.94	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	EFM6	P53970	246 aa		2.94	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	SWA2	Q06677	668 aa		2.94	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	AIM41	Q12032	185 aa		2.94	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	HCS1	P34243	683 aa		2.94	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	MRP8	P35719	219 aa		2.94	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	ADE17	P38009	592 aa	Known RBP	2.94	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	YHL017W	P38745	532 aa		2.94	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	TEL2	P53038	688 aa		2.94	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	MCM6	P53091	1017 aa	Known RBP	2.94	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	DNM1	P54861	757 aa		2.94	□□□□□ -1.94

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