Protein–RNA interactions for Protein: P25343

RVS161, Reduced viability upon starvation protein 161, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 265 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RVS161P25343 NSR1YGR159C 1245 nt19.5■□□□□ 0.71
RVS161P25343 YML009W-BYML009W-B 477 nt19.38■□□□□ 0.69
RVS161P25343 NOP1YDL014W 984 nt18.84■□□□□ 0.61
RVS161P25343 MDJ1YFL016C 1536 nt17.63■□□□□ 0.41
RVS161P25343 YKL036CYKL036C 393 nt17.14■□□□□ 0.33
RVS161P25343 SRX1YKL086W 384 nt16.41■□□□□ 0.22
RVS161P25343 Q0297Q0297 156 nt16.39■□□□□ 0.21
RVS161P25343 YJL027CYJL027C 417 nt16.26■□□□□ 0.19
RVS161P25343 YCR051WYCR051W 669 nt15.52■□□□□ 0.08
RVS161P25343 DBP2YNL112W 1641 nt15.45■□□□□ 0.06
RVS161P25343 SCS3YGL126W 1143 nt15.43■□□□□ 0.06
RVS161P25343 YBR190WYBR190W 312 nt15.18■□□□□ 0.02
RVS161P25343 TRN1tP(UGG)A 72 nt14.95□□□□□ -0.02
RVS161P25343 SUF9tP(UGG)F 72 nt14.95□□□□□ -0.02
RVS161P25343 SUF8tP(UGG)H 72 nt14.95□□□□□ -0.02
RVS161P25343 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt14.95□□□□□ -0.02
RVS161P25343 SUF7tP(UGG)M 72 nt14.95□□□□□ -0.02
RVS161P25343 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt14.95□□□□□ -0.02
RVS161P25343 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt14.95□□□□□ -0.02
RVS161P25343 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt14.95□□□□□ -0.02
RVS161P25343 SUF11tP(UGG)O2 72 nt14.95□□□□□ -0.02
RVS161P25343 YOL085CYOL085C 342 nt14.82□□□□□ -0.04
RVS161P25343 RTC3YHR087W 336 nt14.79□□□□□ -0.04
RVS161P25343 CCC1YLR220W 969 nt14.75□□□□□ -0.05
RVS161P25343 RPP1BYDL130W 321 nt14.7□□□□□ -0.06
RVS161P25343 PKP1YIL042C 1185 nt14.55□□□□□ -0.08
RVS161P25343 RVS167YDR388W 1449 nt14.48□□□□□ -0.09
RVS161P25343 SCJ1YMR214W 1134 nt14.26□□□□□ -0.13
RVS161P25343 SSA3YBL075C 1950 nt14.2□□□□□ -0.14
RVS161P25343 PUT4YOR348C 1884 nt14.1□□□□□ -0.15
RVS161P25343 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt14.06□□□□□ -0.16
RVS161P25343 PET122YER153C 765 nt14.02□□□□□ -0.17
RVS161P25343 SCR1SCR1 522 nt13.89□□□□□ -0.19
RVS161P25343 SHR5YOL110W 714 nt13.89□□□□□ -0.19
RVS161P25343 ATS1YAL020C 1002 nt13.76□□□□□ -0.21
RVS161P25343 ARE1YCR048W 1833 nt13.71□□□□□ -0.22
RVS161P25343 URN1YPR152C 1398 nt13.7□□□□□ -0.22
RVS161P25343 YDJ1YNL064C 1230 nt13.66□□□□□ -0.22
RVS161P25343 SAH1YER043C 1350 nt13.61□□□□□ -0.23
RVS161P25343 OPI9YLR338W 858 nt13.61□□□□□ -0.23
RVS161P25343 POA1YBR022W 534 nt13.61□□□□□ -0.23
RVS161P25343 RRN5YLR141W 1092 nt13.58□□□□□ -0.24
RVS161P25343 DEP1YAL013W 1218 nt13.56□□□□□ -0.24
RVS161P25343 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt13.52□□□□□ -0.25
RVS161P25343 RPN10YHR200W 807 nt13.44□□□□□ -0.26
RVS161P25343 BSC6YOL137W 1494 nt13.4□□□□□ -0.26
RVS161P25343 YNL208WYNL208W 600 nt13.34□□□□□ -0.27
RVS161P25343 YER088W-BYER088W-B 147 nt13.33□□□□□ -0.28
RVS161P25343 GAR1YHR089C 618 nt13.31□□□□□ -0.28
RVS161P25343 RSB1YOR049C 1065 nt13.26□□□□□ -0.29
RVS161P25343 PUN1YLR414C 792 nt13.2□□□□□ -0.3
RVS161P25343 BUD23YCR047C 828 nt13.17□□□□□ -0.3
RVS161P25343 SPT5YML010W 3192 nt13.1□□□□□ -0.31
RVS161P25343 PTC2YER089C 1395 nt13.09□□□□□ -0.31
RVS161P25343 YJR018WYJR018W 363 nt13.05□□□□□ -0.32
RVS161P25343 NAB2YGL122C 1578 nt13□□□□□ -0.33
RVS161P25343 TIR1YER011W 765 nt12.9□□□□□ -0.34
RVS161P25343 SSA4YER103W 1929 nt12.82□□□□□ -0.36
RVS161P25343 PST2YDR032C 597 nt12.77□□□□□ -0.37
RVS161P25343 FIS1YIL065C 468 nt12.77□□□□□ -0.37
RVS161P25343 YJR120WYJR120W 351 nt12.76□□□□□ -0.37
RVS161P25343 DAL1YIR027C 1383 nt12.75□□□□□ -0.37
RVS161P25343 SSA1YAL005C 1929 nt12.75□□□□□ -0.37
RVS161P25343 RPP2BYDR382W 333 nt12.71□□□□□ -0.37
RVS161P25343 FPR4YLR449W 1179 nt12.68□□□□□ -0.38
RVS161P25343 INM2YDR287W 879 nt12.65□□□□□ -0.38
RVS161P25343 MEP2YNL142W 1500 nt12.63□□□□□ -0.39
RVS161P25343 PHO4YFR034C 939 nt12.62□□□□□ -0.39
RVS161P25343 YPS1YLR120C 1710 nt12.54□□□□□ -0.4
RVS161P25343 YBL100CYBL100C 315 nt12.44□□□□□ -0.42
RVS161P25343 SRB2YHR041C 633 nt12.43□□□□□ -0.42
RVS161P25343 DCW1YKL046C 1350 nt12.41□□□□□ -0.42
RVS161P25343 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt12.4□□□□□ -0.42
RVS161P25343 YDR095CYDR095C 411 nt12.39□□□□□ -0.43
RVS161P25343 BDH2YAL061W 1254 nt12.38□□□□□ -0.43
RVS161P25343 BDF1YLR399C 2061 nt12.37□□□□□ -0.43
RVS161P25343 FUN26YAL022C 1554 nt12.29□□□□□ -0.44
RVS161P25343 SHU1YHL006C 453 nt12.27□□□□□ -0.45
RVS161P25343 WWM1YFL010C 636 nt12.26□□□□□ -0.45
RVS161P25343 EMI2YDR516C 1503 nt12.25□□□□□ -0.45
RVS161P25343 YGR021WYGR021W 873 nt12.24□□□□□ -0.45
RVS161P25343 LSM3YLR438C-A 270 nt12.22□□□□□ -0.45
RVS161P25343 YMR090WYMR090W 684 nt12.21□□□□□ -0.45
RVS161P25343 TAT1YBR069C 1860 nt12.2□□□□□ -0.46
RVS161P25343 TRM9YML014W 840 nt12.19□□□□□ -0.46
RVS161P25343 ALF1YNL148C 765 nt12.19□□□□□ -0.46
RVS161P25343 YKL097CYKL097C 411 nt12.18□□□□□ -0.46
RVS161P25343 YBR220CYBR220C 1683 nt12.16□□□□□ -0.46
RVS161P25343 PTP1YDL230W 1008 nt12.16□□□□□ -0.46
RVS161P25343 RPP2AYOL039W 321 nt12.16□□□□□ -0.46
RVS161P25343 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt12.15□□□□□ -0.46
RVS161P25343 YDL221WYDL221W 552 nt12.13□□□□□ -0.47
RVS161P25343 CAC2YML102W 1407 nt12.12□□□□□ -0.47
RVS161P25343 HOM6YJR139C 1080 nt12.11□□□□□ -0.47
RVS161P25343 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt12.1□□□□□ -0.47
RVS161P25343 CCT6YDR188W 1641 nt12.1□□□□□ -0.47
RVS161P25343 PAC11YDR488C 1602 nt12.06□□□□□ -0.48
RVS161P25343 SDH1YKL148C 1923 nt12.05□□□□□ -0.48
RVS161P25343 SUF2tP(AGG)C 72 nt12.04□□□□□ -0.48
RVS161P25343 SUF10tP(AGG)N 72 nt12.04□□□□□ -0.48
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