Protein–RNA interactions for Protein: Q06623

HDA3, HDA1 complex subunit 3, yeastyeast

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Length 655 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HDA3Q06623 NSR1YGR159C 1245 nt20.06■□□□□ 0.8
HDA3Q06623 YML009W-BYML009W-B 477 nt19.98■□□□□ 0.79
HDA3Q06623 NOP1YDL014W 984 nt19.28■□□□□ 0.68
HDA3Q06623 MDJ1YFL016C 1536 nt18.1■□□□□ 0.49
HDA3Q06623 YKL036CYKL036C 393 nt17.56■□□□□ 0.4
HDA3Q06623 SRX1YKL086W 384 nt16.86■□□□□ 0.29
HDA3Q06623 Q0297Q0297 156 nt16.8■□□□□ 0.28
HDA3Q06623 YJL027CYJL027C 417 nt16.66■□□□□ 0.26
HDA3Q06623 YCR051WYCR051W 669 nt16■□□□□ 0.15
HDA3Q06623 DBP2YNL112W 1641 nt15.9■□□□□ 0.14
HDA3Q06623 SCS3YGL126W 1143 nt15.85■□□□□ 0.13
HDA3Q06623 YBR190WYBR190W 312 nt15.47■□□□□ 0.07
HDA3Q06623 TRN1tP(UGG)A 72 nt15.4■□□□□ 0.06
HDA3Q06623 SUF9tP(UGG)F 72 nt15.4■□□□□ 0.06
HDA3Q06623 SUF8tP(UGG)H 72 nt15.4■□□□□ 0.06
HDA3Q06623 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt15.4■□□□□ 0.06
HDA3Q06623 SUF7tP(UGG)M 72 nt15.4■□□□□ 0.06
HDA3Q06623 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt15.4■□□□□ 0.06
HDA3Q06623 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt15.4■□□□□ 0.06
HDA3Q06623 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt15.4■□□□□ 0.06
HDA3Q06623 SUF11tP(UGG)O2 72 nt15.4■□□□□ 0.06
HDA3Q06623 CCC1YLR220W 969 nt15.28■□□□□ 0.04
HDA3Q06623 YOL085CYOL085C 342 nt15.23■□□□□ 0.03
HDA3Q06623 RTC3YHR087W 336 nt15.14■□□□□ 0.01
HDA3Q06623 RPP1BYDL130W 321 nt15.08■□□□□ 0
HDA3Q06623 PKP1YIL042C 1185 nt15.06■□□□□ 0
HDA3Q06623 RVS167YDR388W 1449 nt14.85□□□□□ -0.03
HDA3Q06623 SCJ1YMR214W 1134 nt14.76□□□□□ -0.05
HDA3Q06623 Q0182Q0182 405 nt14.73□□□□□ -0.05
HDA3Q06623 MOT3YMR070W 1473 nt14.58□□□□□ -0.08
HDA3Q06623 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt14.49□□□□□ -0.09
HDA3Q06623 PET122YER153C 765 nt14.46□□□□□ -0.09
HDA3Q06623 SHR5YOL110W 714 nt14.28□□□□□ -0.12
HDA3Q06623 ATS1YAL020C 1002 nt14.26□□□□□ -0.13
HDA3Q06623 PUT4YOR348C 1884 nt14.26□□□□□ -0.13
HDA3Q06623 SCR1SCR1 522 nt14.19□□□□□ -0.14
HDA3Q06623 URN1YPR152C 1398 nt14.07□□□□□ -0.16
HDA3Q06623 DEP1YAL013W 1218 nt14.02□□□□□ -0.17
HDA3Q06623 RRN5YLR141W 1092 nt14.02□□□□□ -0.17
HDA3Q06623 YDJ1YNL064C 1230 nt14.01□□□□□ -0.17
HDA3Q06623 ARE1YCR048W 1833 nt13.92□□□□□ -0.18
HDA3Q06623 SSA3YBL075C 1950 nt13.91□□□□□ -0.18
HDA3Q06623 OPI9YLR338W 858 nt13.91□□□□□ -0.18
HDA3Q06623 SAH1YER043C 1350 nt13.91□□□□□ -0.18
HDA3Q06623 POA1YBR022W 534 nt13.82□□□□□ -0.2
HDA3Q06623 RPN10YHR200W 807 nt13.77□□□□□ -0.21
HDA3Q06623 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt13.76□□□□□ -0.21
HDA3Q06623 GAR1YHR089C 618 nt13.76□□□□□ -0.21
HDA3Q06623 YER088W-BYER088W-B 147 nt13.74□□□□□ -0.21
HDA3Q06623 YNL208WYNL208W 600 nt13.72□□□□□ -0.21
HDA3Q06623 RSB1YOR049C 1065 nt13.65□□□□□ -0.22
HDA3Q06623 BSC6YOL137W 1494 nt13.55□□□□□ -0.24
HDA3Q06623 PUN1YLR414C 792 nt13.49□□□□□ -0.25
HDA3Q06623 BUD23YCR047C 828 nt13.43□□□□□ -0.26
HDA3Q06623 YJR018WYJR018W 363 nt13.41□□□□□ -0.26
HDA3Q06623 PTC2YER089C 1395 nt13.39□□□□□ -0.27
HDA3Q06623 TIR1YER011W 765 nt13.31□□□□□ -0.28
HDA3Q06623 YGR139WYGR139W 339 nt13.29□□□□□ -0.28
HDA3Q06623 NAB2YGL122C 1578 nt13.24□□□□□ -0.29
HDA3Q06623 SSA1YAL005C 1929 nt13.21□□□□□ -0.29
HDA3Q06623 YJR120WYJR120W 351 nt13.16□□□□□ -0.3
HDA3Q06623 PST2YDR032C 597 nt13.14□□□□□ -0.31
HDA3Q06623 NME1NME1 340 nt13.13□□□□□ -0.31
HDA3Q06623 SPT5YML010W 3192 nt13.08□□□□□ -0.32
HDA3Q06623 RPP2BYDR382W 333 nt13.04□□□□□ -0.32
HDA3Q06623 FIS1YIL065C 468 nt13.03□□□□□ -0.32
HDA3Q06623 DAL1YIR027C 1383 nt13.02□□□□□ -0.33
HDA3Q06623 FPR4YLR449W 1179 nt13.01□□□□□ -0.33
HDA3Q06623 SRB2YHR041C 633 nt12.97□□□□□ -0.33
HDA3Q06623 INM2YDR287W 879 nt12.94□□□□□ -0.34
HDA3Q06623 PHO4YFR034C 939 nt12.91□□□□□ -0.34
HDA3Q06623 YKL097CYKL097C 411 nt12.81□□□□□ -0.36
HDA3Q06623 YBL100CYBL100C 315 nt12.79□□□□□ -0.36
HDA3Q06623 SSA4YER103W 1929 nt12.75□□□□□ -0.37
HDA3Q06623 MEP2YNL142W 1500 nt12.74□□□□□ -0.37
HDA3Q06623 BDH2YAL061W 1254 nt12.74□□□□□ -0.37
HDA3Q06623 YPS1YLR120C 1710 nt12.74□□□□□ -0.37
HDA3Q06623 WWM1YFL010C 636 nt12.7□□□□□ -0.38
HDA3Q06623 SHU1YHL006C 453 nt12.65□□□□□ -0.38
HDA3Q06623 FUN26YAL022C 1554 nt12.64□□□□□ -0.39
HDA3Q06623 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt12.63□□□□□ -0.39
HDA3Q06623 YDR095CYDR095C 411 nt12.62□□□□□ -0.39
HDA3Q06623 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt12.57□□□□□ -0.4
HDA3Q06623 DCW1YKL046C 1350 nt12.56□□□□□ -0.4
HDA3Q06623 TRM9YML014W 840 nt12.55□□□□□ -0.4
HDA3Q06623 LSM3YLR438C-A 270 nt12.52□□□□□ -0.41
HDA3Q06623 YGR021WYGR021W 873 nt12.5□□□□□ -0.41
HDA3Q06623 ALF1YNL148C 765 nt12.5□□□□□ -0.41
HDA3Q06623 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt12.46□□□□□ -0.41
HDA3Q06623 HOM6YJR139C 1080 nt12.46□□□□□ -0.41
HDA3Q06623 CCT6YDR188W 1641 nt12.43□□□□□ -0.42
HDA3Q06623 MNP1YGL068W 585 nt12.39□□□□□ -0.43
HDA3Q06623 EMI2YDR516C 1503 nt12.38□□□□□ -0.43
HDA3Q06623 PTP1YDL230W 1008 nt12.38□□□□□ -0.43
HDA3Q06623 RPP2AYOL039W 321 nt12.38□□□□□ -0.43
HDA3Q06623 CAC2YML102W 1407 nt12.34□□□□□ -0.43
HDA3Q06623 SUF2tP(AGG)C 72 nt12.32□□□□□ -0.44
HDA3Q06623 SUF10tP(AGG)N 72 nt12.32□□□□□ -0.44
HDA3Q06623 SIS1YNL007C 1059 nt12.32□□□□□ -0.44
HDA3Q06623 RKM5YLR137W 1104 nt12.28□□□□□ -0.44
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