Protein–RNA interactions for Protein: P38523

MGE1, GrpE protein homolog, mitochondrial, yeastyeast

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
MGE1P38523 YML009W-BYML009W-B 477 nt18.23■□□□□ 0.51
MGE1P38523 NSR1YGR159C 1245 nt17.97■□□□□ 0.47
MGE1P38523 NOP1YDL014W 984 nt17.78■□□□□ 0.44
MGE1P38523 YKL036CYKL036C 393 nt16.49■□□□□ 0.23
MGE1P38523 MDJ1YFL016C 1536 nt15.85■□□□□ 0.13
MGE1P38523 Q0182Q0182 405 nt15.68■□□□□ 0.1
MGE1P38523 Q0297Q0297 156 nt15.54■□□□□ 0.08
MGE1P38523 SRX1YKL086W 384 nt15.49■□□□□ 0.07
MGE1P38523 YJL027CYJL027C 417 nt15.43■□□□□ 0.06
MGE1P38523 MOT3YMR070W 1473 nt15.16■□□□□ 0.02
MGE1P38523 SCS3YGL126W 1143 nt15.05■□□□□ -0
MGE1P38523 YCR051WYCR051W 669 nt14.75□□□□□ -0.05
MGE1P38523 YOL085CYOL085C 342 nt14.25□□□□□ -0.13
MGE1P38523 PKP1YIL042C 1185 nt14.05□□□□□ -0.16
MGE1P38523 DBP2YNL112W 1641 nt14.01□□□□□ -0.17
MGE1P38523 RPP1BYDL130W 321 nt13.96□□□□□ -0.17
MGE1P38523 TRN1tP(UGG)A 72 nt13.93□□□□□ -0.18
MGE1P38523 SUF9tP(UGG)F 72 nt13.93□□□□□ -0.18
MGE1P38523 SUF8tP(UGG)H 72 nt13.93□□□□□ -0.18
MGE1P38523 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt13.93□□□□□ -0.18
MGE1P38523 SUF7tP(UGG)M 72 nt13.93□□□□□ -0.18
MGE1P38523 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt13.93□□□□□ -0.18
MGE1P38523 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt13.93□□□□□ -0.18
MGE1P38523 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt13.93□□□□□ -0.18
MGE1P38523 SUF11tP(UGG)O2 72 nt13.93□□□□□ -0.18
MGE1P38523 CCC1YLR220W 969 nt13.83□□□□□ -0.2
MGE1P38523 ATS1YAL020C 1002 nt13.48□□□□□ -0.25
MGE1P38523 YBR190WYBR190W 312 nt13.48□□□□□ -0.25
MGE1P38523 SCJ1YMR214W 1134 nt13.47□□□□□ -0.25
MGE1P38523 PET122YER153C 765 nt13.32□□□□□ -0.28
MGE1P38523 RVS167YDR388W 1449 nt13.31□□□□□ -0.28
MGE1P38523 SCR1SCR1 522 nt13.26□□□□□ -0.29
MGE1P38523 RTC3YHR087W 336 nt13.24□□□□□ -0.29
MGE1P38523 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt13.22□□□□□ -0.29
MGE1P38523 SSA3YBL075C 1950 nt13.17□□□□□ -0.3
MGE1P38523 RRN5YLR141W 1092 nt12.95□□□□□ -0.34
MGE1P38523 SHR5YOL110W 714 nt12.84□□□□□ -0.35
MGE1P38523 YDJ1YNL064C 1230 nt12.79□□□□□ -0.36
MGE1P38523 RSB1YOR049C 1065 nt12.77□□□□□ -0.37
MGE1P38523 YER088W-BYER088W-B 147 nt12.69□□□□□ -0.38
MGE1P38523 NME1NME1 340 nt12.59□□□□□ -0.39
MGE1P38523 GAR1YHR089C 618 nt12.51□□□□□ -0.41
MGE1P38523 DEP1YAL013W 1218 nt12.45□□□□□ -0.42
MGE1P38523 PST2YDR032C 597 nt12.44□□□□□ -0.42
MGE1P38523 URN1YPR152C 1398 nt12.41□□□□□ -0.42
MGE1P38523 RPN10YHR200W 807 nt12.31□□□□□ -0.44
MGE1P38523 YNL208WYNL208W 600 nt12.26□□□□□ -0.45
MGE1P38523 OPI9YLR338W 858 nt12.19□□□□□ -0.46
MGE1P38523 SSA1YAL005C 1929 nt12.14□□□□□ -0.47
MGE1P38523 PUT4YOR348C 1884 nt12.1□□□□□ -0.47
MGE1P38523 SAH1YER043C 1350 nt12.08□□□□□ -0.48
MGE1P38523 TIR1YER011W 765 nt12.08□□□□□ -0.48
MGE1P38523 YKL097CYKL097C 411 nt12.08□□□□□ -0.48
MGE1P38523 SHU1YHL006C 453 nt11.92□□□□□ -0.5
MGE1P38523 ARE1YCR048W 1833 nt11.92□□□□□ -0.5
MGE1P38523 PUN1YLR414C 792 nt11.87□□□□□ -0.51
MGE1P38523 YJR018WYJR018W 363 nt11.84□□□□□ -0.51
MGE1P38523 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt11.83□□□□□ -0.52
MGE1P38523 POA1YBR022W 534 nt11.77□□□□□ -0.53
MGE1P38523 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt11.71□□□□□ -0.53
MGE1P38523 PTC2YER089C 1395 nt11.68□□□□□ -0.54
MGE1P38523 RPP2BYDR382W 333 nt11.68□□□□□ -0.54
MGE1P38523 SRB2YHR041C 633 nt11.66□□□□□ -0.54
MGE1P38523 YJR120WYJR120W 351 nt11.62□□□□□ -0.55
MGE1P38523 BUD23YCR047C 828 nt11.6□□□□□ -0.55
MGE1P38523 YGR139WYGR139W 339 nt11.58□□□□□ -0.56
MGE1P38523 YGR021WYGR021W 873 nt11.56□□□□□ -0.56
MGE1P38523 WWM1YFL010C 636 nt11.55□□□□□ -0.56
MGE1P38523 SPT5YML010W 3192 nt11.55□□□□□ -0.56
MGE1P38523 YOR139CYOR139C 393 nt11.51□□□□□ -0.57
MGE1P38523 NAB2YGL122C 1578 nt11.5□□□□□ -0.57
MGE1P38523 BSC6YOL137W 1494 nt11.49□□□□□ -0.57
MGE1P38523 SSA4YER103W 1929 nt11.48□□□□□ -0.57
MGE1P38523 HOM6YJR139C 1080 nt11.48□□□□□ -0.57
MGE1P38523 NPL3YDR432W 1245 nt11.46□□□□□ -0.57
MGE1P38523 MNP1YGL068W 585 nt11.46□□□□□ -0.57
MGE1P38523 BDH2YAL061W 1254 nt11.42□□□□□ -0.58
MGE1P38523 INM2YDR287W 879 nt11.41□□□□□ -0.58
MGE1P38523 FPR4YLR449W 1179 nt11.41□□□□□ -0.58
MGE1P38523 DAL1YIR027C 1383 nt11.39□□□□□ -0.59
MGE1P38523 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt11.38□□□□□ -0.59
MGE1P38523 MET8YBR213W 825 nt11.37□□□□□ -0.59
MGE1P38523 FIS1YIL065C 468 nt11.34□□□□□ -0.59
MGE1P38523 YOL037CYOL037C 354 nt11.34□□□□□ -0.59
MGE1P38523 RKM5YLR137W 1104 nt11.33□□□□□ -0.6
MGE1P38523 YBL100CYBL100C 315 nt11.33□□□□□ -0.6
MGE1P38523 LSM3YLR438C-A 270 nt11.29□□□□□ -0.6
MGE1P38523 FRE6YLL051C 2139 nt11.27□□□□□ -0.6
MGE1P38523 PHO4YFR034C 939 nt11.27□□□□□ -0.61
MGE1P38523 YJL225CYJL225C 5277 nt11.25□□□□□ -0.61
MGE1P38523 RPM1RPM1 483 nt11.23□□□□□ -0.61
MGE1P38523 CLB6YGR109C 1143 nt11.21□□□□□ -0.61
MGE1P38523 TRM9YML014W 840 nt11.21□□□□□ -0.61
MGE1P38523 FUN26YAL022C 1554 nt11.18□□□□□ -0.62
MGE1P38523 BDF1YLR399C 2061 nt11.17□□□□□ -0.62
MGE1P38523 RDN37-1RDN37-1 5354 nt11.1□□□□□ -0.63
MGE1P38523 RDN37-2RDN37-2 5354 nt11.1□□□□□ -0.63
MGE1P38523 ALF1YNL148C 765 nt11.06□□□□□ -0.64
MGE1P38523 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt11.05□□□□□ -0.64
MGE1P38523 IMT4tM(CAU)E 72 nt11.05□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 14.1 ms