Protein–RNA interactions for Protein: Q12500

AVL9, Late secretory pathway protein AVL9, yeastyeast

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Length 764 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
AVL9Q12500 YML009W-BYML009W-B 477 nt20.96■□□□□ 0.95
AVL9Q12500 NSR1YGR159C 1245 nt20.9■□□□□ 0.94
AVL9Q12500 NOP1YDL014W 984 nt20.24■□□□□ 0.83
AVL9Q12500 MDJ1YFL016C 1536 nt18.82■□□□□ 0.6
AVL9Q12500 YKL036CYKL036C 393 nt18.52■□□□□ 0.56
AVL9Q12500 SRX1YKL086W 384 nt17.67■□□□□ 0.42
AVL9Q12500 Q0297Q0297 156 nt17.63■□□□□ 0.41
AVL9Q12500 YJL027CYJL027C 417 nt17.33■□□□□ 0.36
AVL9Q12500 YCR051WYCR051W 669 nt16.84■□□□□ 0.29
AVL9Q12500 SCS3YGL126W 1143 nt16.77■□□□□ 0.28
AVL9Q12500 DBP2YNL112W 1641 nt16.52■□□□□ 0.24
AVL9Q12500 TRN1tP(UGG)A 72 nt16.08■□□□□ 0.16
AVL9Q12500 SUF9tP(UGG)F 72 nt16.08■□□□□ 0.16
AVL9Q12500 SUF8tP(UGG)H 72 nt16.08■□□□□ 0.16
AVL9Q12500 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt16.08■□□□□ 0.16
AVL9Q12500 SUF7tP(UGG)M 72 nt16.08■□□□□ 0.16
AVL9Q12500 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt16.08■□□□□ 0.16
AVL9Q12500 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt16.08■□□□□ 0.16
AVL9Q12500 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt16.08■□□□□ 0.16
AVL9Q12500 SUF11tP(UGG)O2 72 nt16.08■□□□□ 0.16
AVL9Q12500 YOL085CYOL085C 342 nt16.07■□□□□ 0.16
AVL9Q12500 CCC1YLR220W 969 nt16.04■□□□□ 0.16
AVL9Q12500 YBR190WYBR190W 312 nt16.02■□□□□ 0.16
AVL9Q12500 PKP1YIL042C 1185 nt15.92■□□□□ 0.14
AVL9Q12500 RPP1BYDL130W 321 nt15.85■□□□□ 0.13
AVL9Q12500 RTC3YHR087W 336 nt15.75■□□□□ 0.11
AVL9Q12500 RVS167YDR388W 1449 nt15.5■□□□□ 0.07
AVL9Q12500 SCJ1YMR214W 1134 nt15.4■□□□□ 0.06
AVL9Q12500 PET122YER153C 765 nt15.2■□□□□ 0.02
AVL9Q12500 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt15.19■□□□□ 0.02
AVL9Q12500 ATS1YAL020C 1002 nt14.96□□□□□ -0.01
AVL9Q12500 SCR1SCR1 522 nt14.96□□□□□ -0.01
AVL9Q12500 SHR5YOL110W 714 nt14.9□□□□□ -0.02
AVL9Q12500 RRN5YLR141W 1092 nt14.76□□□□□ -0.05
AVL9Q12500 PUT4YOR348C 1884 nt14.69□□□□□ -0.06
AVL9Q12500 DEP1YAL013W 1218 nt14.65□□□□□ -0.06
AVL9Q12500 YDJ1YNL064C 1230 nt14.64□□□□□ -0.07
AVL9Q12500 URN1YPR152C 1398 nt14.63□□□□□ -0.07
AVL9Q12500 YER088W-BYER088W-B 147 nt14.45□□□□□ -0.1
AVL9Q12500 GAR1YHR089C 618 nt14.45□□□□□ -0.1
AVL9Q12500 SAH1YER043C 1350 nt14.43□□□□□ -0.1
AVL9Q12500 OPI9YLR338W 858 nt14.42□□□□□ -0.1
AVL9Q12500 RSB1YOR049C 1065 nt14.41□□□□□ -0.1
AVL9Q12500 ARE1YCR048W 1833 nt14.38□□□□□ -0.11
AVL9Q12500 RPN10YHR200W 807 nt14.34□□□□□ -0.11
AVL9Q12500 YNL208WYNL208W 600 nt14.31□□□□□ -0.12
AVL9Q12500 POA1YBR022W 534 nt14.28□□□□□ -0.12
AVL9Q12500 SSA3YBL075C 1950 nt14.27□□□□□ -0.12
AVL9Q12500 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt14.22□□□□□ -0.13
AVL9Q12500 PUN1YLR414C 792 nt13.99□□□□□ -0.17
AVL9Q12500 BSC6YOL137W 1494 nt13.97□□□□□ -0.17
AVL9Q12500 YJR018WYJR018W 363 nt13.94□□□□□ -0.18
AVL9Q12500 BUD23YCR047C 828 nt13.93□□□□□ -0.18
AVL9Q12500 TIR1YER011W 765 nt13.93□□□□□ -0.18
AVL9Q12500 PTC2YER089C 1395 nt13.91□□□□□ -0.18
AVL9Q12500 PST2YDR032C 597 nt13.87□□□□□ -0.19
AVL9Q12500 SSA1YAL005C 1929 nt13.81□□□□□ -0.2
AVL9Q12500 NAB2YGL122C 1578 nt13.71□□□□□ -0.22
AVL9Q12500 YJR120WYJR120W 351 nt13.67□□□□□ -0.22
AVL9Q12500 RPP2BYDR382W 333 nt13.6□□□□□ -0.23
AVL9Q12500 SRB2YHR041C 633 nt13.58□□□□□ -0.24
AVL9Q12500 FPR4YLR449W 1179 nt13.56□□□□□ -0.24
AVL9Q12500 DAL1YIR027C 1383 nt13.5□□□□□ -0.25
AVL9Q12500 FIS1YIL065C 468 nt13.49□□□□□ -0.25
AVL9Q12500 INM2YDR287W 879 nt13.43□□□□□ -0.26
AVL9Q12500 PHO4YFR034C 939 nt13.38□□□□□ -0.27
AVL9Q12500 SHU1YHL006C 453 nt13.37□□□□□ -0.27
AVL9Q12500 SPT5YML010W 3192 nt13.35□□□□□ -0.27
AVL9Q12500 WWM1YFL010C 636 nt13.32□□□□□ -0.28
AVL9Q12500 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt13.31□□□□□ -0.28
AVL9Q12500 YBL100CYBL100C 315 nt13.31□□□□□ -0.28
AVL9Q12500 BDH2YAL061W 1254 nt13.28□□□□□ -0.28
AVL9Q12500 YKL097CYKL097C 411 nt13.24□□□□□ -0.29
AVL9Q12500 YPS1YLR120C 1710 nt13.16□□□□□ -0.3
AVL9Q12500 FUN26YAL022C 1554 nt13.15□□□□□ -0.3
AVL9Q12500 YGR021WYGR021W 873 nt13.11□□□□□ -0.31
AVL9Q12500 MEP2YNL142W 1500 nt13.11□□□□□ -0.31
AVL9Q12500 TRM9YML014W 840 nt13.1□□□□□ -0.31
AVL9Q12500 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt13.08□□□□□ -0.32
AVL9Q12500 HOM6YJR139C 1080 nt13.07□□□□□ -0.32
AVL9Q12500 LSM3YLR438C-A 270 nt13.05□□□□□ -0.32
AVL9Q12500 MNP1YGL068W 585 nt13.04□□□□□ -0.32
AVL9Q12500 YDR095CYDR095C 411 nt13.03□□□□□ -0.32
AVL9Q12500 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt13.03□□□□□ -0.32
AVL9Q12500 ALF1YNL148C 765 nt13.01□□□□□ -0.33
AVL9Q12500 SSA4YER103W 1929 nt13□□□□□ -0.33
AVL9Q12500 DCW1YKL046C 1350 nt12.95□□□□□ -0.34
AVL9Q12500 CCT6YDR188W 1641 nt12.92□□□□□ -0.34
AVL9Q12500 RKM5YLR137W 1104 nt12.89□□□□□ -0.35
AVL9Q12500 SUF2tP(AGG)C 72 nt12.84□□□□□ -0.35
AVL9Q12500 SUF10tP(AGG)N 72 nt12.84□□□□□ -0.35
AVL9Q12500 RPP2AYOL039W 321 nt12.83□□□□□ -0.36
AVL9Q12500 PTP1YDL230W 1008 nt12.79□□□□□ -0.36
AVL9Q12500 SIS1YNL007C 1059 nt12.77□□□□□ -0.37
AVL9Q12500 EMI2YDR516C 1503 nt12.75□□□□□ -0.37
AVL9Q12500 CAC2YML102W 1407 nt12.75□□□□□ -0.37
AVL9Q12500 YOR139CYOR139C 393 nt12.74□□□□□ -0.37
AVL9Q12500 NPL3YDR432W 1245 nt12.69□□□□□ -0.38
AVL9Q12500 YOL037CYOL037C 354 nt12.67□□□□□ -0.38
AVL9Q12500 YMR090WYMR090W 684 nt12.66□□□□□ -0.38
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