RNA–Protein interactions for RNA: YPR069C

SPE3, Transcript of Spermidine synthase, yeastyeast

Gene SPE3, Length 882 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SPE3YPR069C ALD6P54115 500 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
SPE3YPR069C PKH3Q03306 898 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
SPE3YPR069C PUF6Q04373 656 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
SPE3YPR069C DUS4Q06063 367 aa8.31□□□□□ -1.08
SPE3YPR069C RAD61Q99359 647 aa8.31□□□□□ -1.08
SPE3YPR069C CDC19P00549 500 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
SPE3YPR069C BCS1P32839 456 aa8.3□□□□□ -1.08
SPE3YPR069C PBY1P38254 753 aa8.3□□□□□ -1.08
SPE3YPR069C NMD2P38798 1089 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
SPE3YPR069C POL32P47110 350 aa8.3□□□□□ -1.08
SPE3YPR069C YGR125WP53273 1036 aa8.3□□□□□ -1.08
SPE3YPR069C CHS3P29465 1165 aa8.29□□□□□ -1.08
SPE3YPR069C TOM71P38825 639 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
SPE3YPR069C PES4P39684 611 aa8.29□□□□□ -1.08
SPE3YPR069C VID27P40157 782 aa8.29□□□□□ -1.08
SPE3YPR069C BDP1P46678 594 aa8.29□□□□□ -1.08
SPE3YPR069C PIB2P53191 635 aa8.29□□□□□ -1.08
SPE3YPR069C TAH18Q12181 623 aa8.29□□□□□ -1.08
SPE3YPR069C MAM3Q12296 706 aa8.29□□□□□ -1.08
SPE3YPR069C LAM4P38800 1345 aa8.29□□□□□ -1.08
SPE3YPR069C RAD18P10862 487 aa8.28□□□□□ -1.08
SPE3YPR069C UTR4P32626 227 aa8.28□□□□□ -1.08
SPE3YPR069C COQ1P18900 473 aa8.27□□□□□ -1.09
SPE3YPR069C DBP1P24784 617 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
SPE3YPR069C SRP40P32583 406 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
SPE3YPR069C VPS29P38759 282 aa8.27□□□□□ -1.09
SPE3YPR069C SLN1P39928 1220 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
SPE3YPR069C BUL2Q03758 920 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
SPE3YPR069C MRD1Q06106 887 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
SPE3YPR069C SAM2P19358 384 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
SPE3YPR069C OPI1P21957 404 aa8.26□□□□□ -1.09
SPE3YPR069C PHO88P38264 188 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
SPE3YPR069C MSC7P38694 644 aa8.26□□□□□ -1.09
SPE3YPR069C FPR3P38911 411 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
SPE3YPR069C MRPS35P53292 345 aa8.26□□□□□ -1.09
SPE3YPR069C CDC16P09798 840 aa8.25□□□□□ -1.09
SPE3YPR069C TGL1P34163 548 aa8.25□□□□□ -1.09
SPE3YPR069C TFA1P36100 482 aa8.25□□□□□ -1.09
SPE3YPR069C VPS8P39702 1274 aa8.25□□□□□ -1.09
SPE3YPR069C BRE1Q07457 700 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
SPE3YPR069C RIF1P29539 1916 aa8.25□□□□□ -1.09
SPE3YPR069C CHO2P05374 869 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
SPE3YPR069C KTR1P27810 393 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
SPE3YPR069C PRS1P32895 427 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
SPE3YPR069C MET1P36150 593 aa8.24□□□□□ -1.09
SPE3YPR069C RRP8P38961 392 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
SPE3YPR069C NOC2P39744 710 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
SPE3YPR069C UBP9P39967 754 aa8.24□□□□□ -1.09
SPE3YPR069C CSC1Q06538 782 aa8.24□□□□□ -1.09
SPE3YPR069C AHC1Q12433 566 aa8.24□□□□□ -1.09
SPE3YPR069C LDB19Q12502 818 aa8.24□□□□□ -1.09
SPE3YPR069C HEM1P09950 548 aaPredicted RBP8.23□□□□□ -1.09
SPE3YPR069C TIM23P32897 222 aa8.23□□□□□ -1.09
SPE3YPR069C RPS15Q01855 142 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
SPE3YPR069C TMA64Q04600 565 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
SPE3YPR069C SPH1Q06160 661 aa8.23□□□□□ -1.09
SPE3YPR069C MSC6Q08818 692 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
SPE3YPR069C SAM1P10659 382 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
SPE3YPR069C YUR1P26725 428 aa8.22□□□□□ -1.09
SPE3YPR069C PRO3P32263 286 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
SPE3YPR069C KTR2P33550 425 aa8.22□□□□□ -1.09
SPE3YPR069C MYO3P36006 1272 aa8.22□□□□□ -1.09
SPE3YPR069C SKP2P42843 763 aa8.22□□□□□ -1.09
SPE3YPR069C RPL17AP05740 184 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.1
SPE3YPR069C PDC1P06169 563 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.1
SPE3YPR069C POX1P13711 748 aa8.21□□□□□ -1.1
SPE3YPR069C MIP1P15801 1254 aa8.21□□□□□ -1.1
SPE3YPR069C MCM4P30665 933 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.1
SPE3YPR069C DBP7P36120 742 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.1
SPE3YPR069C GRS1P38088 690 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.1
SPE3YPR069C RPL17BP46990 184 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.1
SPE3YPR069C VPS53P47061 822 aa8.21□□□□□ -1.1
SPE3YPR069C FOL1P53848 824 aa8.21□□□□□ -1.1
SPE3YPR069C RMD1Q03441 430 aa8.21□□□□□ -1.1
SPE3YPR069C GUD1Q07729 489 aa8.21□□□□□ -1.1
SPE3YPR069C ERP3Q12403 225 aa8.21□□□□□ -1.1
SPE3YPR069C FKS1P38631 1876 aaKnown RBP8.2□□□□□ -1.1
SPE3YPR069C HIP1P06775 603 aa8.2□□□□□ -1.1
SPE3YPR069C ACE2P21192 770 aa8.2□□□□□ -1.1
SPE3YPR069C SHP1P34223 423 aa8.2□□□□□ -1.1
SPE3YPR069C MCR1P36060 302 aaKnown RBP8.2□□□□□ -1.1
SPE3YPR069C SCS3P53012 380 aa8.2□□□□□ -1.1
SPE3YPR069C UFD2P54860 961 aa8.2□□□□□ -1.1
SPE3YPR069C VPS30Q02948 557 aa8.2□□□□□ -1.1
SPE3YPR069C SLD5Q03406 294 aa8.2□□□□□ -1.1
SPE3YPR069C DUS3Q06053 668 aaKnown RBP8.2□□□□□ -1.1
SPE3YPR069C ISA1Q07821 250 aaPredicted RBP8.2□□□□□ -1.1
SPE3YPR069C YMR084WA2P2R3 262 aa8.19□□□□□ -1.1
SPE3YPR069C TKL1P23254 680 aaKnown RBP8.19□□□□□ -1.1
SPE3YPR069C SEC8P32855 1065 aa8.19□□□□□ -1.1
SPE3YPR069C TFC4P33339 1025 aa8.19□□□□□ -1.1
SPE3YPR069C AVT3P36062 692 aa8.19□□□□□ -1.1
SPE3YPR069C STM1P39015 273 aaKnown RBP8.19□□□□□ -1.1
SPE3YPR069C SSF2Q12153 453 aaPredicted RBP8.19□□□□□ -1.1
SPE3YPR069C CLF1Q12309 687 aaPredicted RBP8.19□□□□□ -1.1
SPE3YPR069C YDR524C-BQ3E6R4 66 aa8.19□□□□□ -1.1
SPE3YPR069C YDR034W-BQ6Q5X2 51 aa8.19□□□□□ -1.1
SPE3YPR069C NUC1P08466 329 aa8.18□□□□□ -1.1
SPE3YPR069C RIT1P23796 513 aa8.18□□□□□ -1.1
SPE3YPR069C ANP1P32629 500 aa8.18□□□□□ -1.1
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