Protein–RNA interactions for Protein: Q06053

DUS3, tRNA-dihydrouridine(47) synthase [NAD(P)(+)], yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 668 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
DUS3Q06053 YML009W-BYML009W-B 477 nt23.19■■□□□ 1.3
DUS3Q06053 NSR1YGR159C 1245 nt22.72■■□□□ 1.23
DUS3Q06053 NOP1YDL014W 984 nt22.61■■□□□ 1.21
DUS3Q06053 YKL036CYKL036C 393 nt21.22■□□□□ 0.99
DUS3Q06053 Q0297Q0297 156 nt19.95■□□□□ 0.78
DUS3Q06053 MDJ1YFL016C 1536 nt19.93■□□□□ 0.78
DUS3Q06053 YJL027CYJL027C 417 nt19.88■□□□□ 0.77
DUS3Q06053 SRX1YKL086W 384 nt19.81■□□□□ 0.76
DUS3Q06053 SCS3YGL126W 1143 nt19.52■□□□□ 0.72
DUS3Q06053 YCR051WYCR051W 669 nt18.81■□□□□ 0.6
DUS3Q06053 YOL085CYOL085C 342 nt18.39■□□□□ 0.53
DUS3Q06053 PKP1YIL042C 1185 nt18.1■□□□□ 0.49
DUS3Q06053 RPP1BYDL130W 321 nt17.9■□□□□ 0.46
DUS3Q06053 DBP2YNL112W 1641 nt17.79■□□□□ 0.44
DUS3Q06053 TRN1tP(UGG)A 72 nt17.74■□□□□ 0.43
DUS3Q06053 SUF9tP(UGG)F 72 nt17.74■□□□□ 0.43
DUS3Q06053 SUF8tP(UGG)H 72 nt17.74■□□□□ 0.43
DUS3Q06053 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt17.74■□□□□ 0.43
DUS3Q06053 SUF7tP(UGG)M 72 nt17.74■□□□□ 0.43
DUS3Q06053 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt17.74■□□□□ 0.43
DUS3Q06053 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt17.74■□□□□ 0.43
DUS3Q06053 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt17.74■□□□□ 0.43
DUS3Q06053 SUF11tP(UGG)O2 72 nt17.74■□□□□ 0.43
DUS3Q06053 SCJ1YMR214W 1134 nt17.65■□□□□ 0.42
DUS3Q06053 CCC1YLR220W 969 nt17.55■□□□□ 0.4
DUS3Q06053 ATS1YAL020C 1002 nt17.54■□□□□ 0.4
DUS3Q06053 PET122YER153C 765 nt17.1■□□□□ 0.33
DUS3Q06053 SCR1SCR1 522 nt16.94■□□□□ 0.3
DUS3Q06053 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt16.88■□□□□ 0.29
DUS3Q06053 YBR190WYBR190W 312 nt16.85■□□□□ 0.29
DUS3Q06053 RVS167YDR388W 1449 nt16.7■□□□□ 0.26
DUS3Q06053 RRN5YLR141W 1092 nt16.62■□□□□ 0.25
DUS3Q06053 RTC3YHR087W 336 nt16.49■□□□□ 0.23
DUS3Q06053 RSB1YOR049C 1065 nt16.37■□□□□ 0.21
DUS3Q06053 YER088W-BYER088W-B 147 nt16.31■□□□□ 0.2
DUS3Q06053 YDJ1YNL064C 1230 nt16.3■□□□□ 0.2
DUS3Q06053 SHR5YOL110W 714 nt16.23■□□□□ 0.19
DUS3Q06053 PST2YDR032C 597 nt16.2■□□□□ 0.18
DUS3Q06053 GAR1YHR089C 618 nt15.91■□□□□ 0.14
DUS3Q06053 YKL097CYKL097C 411 nt15.71■□□□□ 0.11
DUS3Q06053 DEP1YAL013W 1218 nt15.7■□□□□ 0.1
DUS3Q06053 URN1YPR152C 1398 nt15.59■□□□□ 0.09
DUS3Q06053 SHU1YHL006C 453 nt15.48■□□□□ 0.07
DUS3Q06053 YNL208WYNL208W 600 nt15.44■□□□□ 0.06
DUS3Q06053 RPN10YHR200W 807 nt15.38■□□□□ 0.05
DUS3Q06053 TIR1YER011W 765 nt15.36■□□□□ 0.05
DUS3Q06053 OPI9YLR338W 858 nt15.29■□□□□ 0.04
DUS3Q06053 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt15.15■□□□□ 0.02
DUS3Q06053 SSA1YAL005C 1929 nt15.14■□□□□ 0.01
DUS3Q06053 SAH1YER043C 1350 nt15.12■□□□□ 0.01
DUS3Q06053 PUT4YOR348C 1884 nt15.09■□□□□ 0.01
DUS3Q06053 YOR139CYOR139C 393 nt15.07■□□□□ 0
DUS3Q06053 SRB2YHR041C 633 nt15.02■□□□□ -0
DUS3Q06053 ARE1YCR048W 1833 nt14.93□□□□□ -0.02
DUS3Q06053 YJR018WYJR018W 363 nt14.88□□□□□ -0.03
DUS3Q06053 PUN1YLR414C 792 nt14.82□□□□□ -0.04
DUS3Q06053 NPL3YDR432W 1245 nt14.81□□□□□ -0.04
DUS3Q06053 YJR120WYJR120W 351 nt14.81□□□□□ -0.04
DUS3Q06053 WWM1YFL010C 636 nt14.77□□□□□ -0.05
DUS3Q06053 MNP1YGL068W 585 nt14.76□□□□□ -0.05
DUS3Q06053 HOM6YJR139C 1080 nt14.74□□□□□ -0.05
DUS3Q06053 YGR021WYGR021W 873 nt14.73□□□□□ -0.05
DUS3Q06053 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt14.72□□□□□ -0.05
DUS3Q06053 RPP2BYDR382W 333 nt14.63□□□□□ -0.07
DUS3Q06053 POA1YBR022W 534 nt14.63□□□□□ -0.07
DUS3Q06053 PTC2YER089C 1395 nt14.61□□□□□ -0.07
DUS3Q06053 YOL037CYOL037C 354 nt14.58□□□□□ -0.08
DUS3Q06053 SSA3YBL075C 1950 nt14.54□□□□□ -0.08
DUS3Q06053 RKM5YLR137W 1104 nt14.52□□□□□ -0.09
DUS3Q06053 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt14.49□□□□□ -0.09
DUS3Q06053 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt14.44□□□□□ -0.1
DUS3Q06053 IMT4tM(CAU)E 72 nt14.44□□□□□ -0.1
DUS3Q06053 IMT3tM(CAU)J3 72 nt14.44□□□□□ -0.1
DUS3Q06053 IMT1tM(CAU)O1 72 nt14.44□□□□□ -0.1
DUS3Q06053 IMT2tM(CAU)P 72 nt14.44□□□□□ -0.1
DUS3Q06053 BDH2YAL061W 1254 nt14.43□□□□□ -0.1
DUS3Q06053 BUD23YCR047C 828 nt14.39□□□□□ -0.11
DUS3Q06053 NAB2YGL122C 1578 nt14.35□□□□□ -0.11
DUS3Q06053 LSM3YLR438C-A 270 nt14.28□□□□□ -0.12
DUS3Q06053 INM2YDR287W 879 nt14.27□□□□□ -0.13
DUS3Q06053 BSC6YOL137W 1494 nt14.25□□□□□ -0.13
DUS3Q06053 FIS1YIL065C 468 nt14.25□□□□□ -0.13
DUS3Q06053 DAL1YIR027C 1383 nt14.24□□□□□ -0.13
DUS3Q06053 YLR281CYLR281C 468 nt14.23□□□□□ -0.13
DUS3Q06053 YBL100CYBL100C 315 nt14.23□□□□□ -0.13
DUS3Q06053 FPR4YLR449W 1179 nt14.21□□□□□ -0.13
DUS3Q06053 PUS2YGL063W 1113 nt14.2□□□□□ -0.14
DUS3Q06053 WHI5YOR083W 888 nt14.14□□□□□ -0.15
DUS3Q06053 PHO4YFR034C 939 nt14.13□□□□□ -0.15
DUS3Q06053 TRM9YML014W 840 nt14.08□□□□□ -0.16
DUS3Q06053 FUN26YAL022C 1554 nt14.08□□□□□ -0.16
DUS3Q06053 MOT3YMR070W 1473 nt14□□□□□ -0.17
DUS3Q06053 CCT6YDR188W 1641 nt13.95□□□□□ -0.18
DUS3Q06053 YPR011CYPR011C 981 nt13.93□□□□□ -0.18
DUS3Q06053 YLR236CYLR236C 324 nt13.88□□□□□ -0.19
DUS3Q06053 DSK2YMR276W 1122 nt13.88□□□□□ -0.19
DUS3Q06053 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt13.87□□□□□ -0.19
DUS3Q06053 FMP45YDL222C 930 nt13.86□□□□□ -0.19
DUS3Q06053 IMP2'YIL154C 1041 nt13.77□□□□□ -0.21
DUS3Q06053 ALF1YNL148C 765 nt13.77□□□□□ -0.21
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