RNA–Protein interactions for RNA: YML035C

AMD1, Transcript of AMP deaminase, yeast

Gene AMD1, Length 2,433 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
AMD1	YML035C	RRP8	P38961	392 aa	Known RBP	6.66	□□□□□ -1.34
AMD1	YML035C	TRM44	Q02648	567 aa	Known RBP	6.66	□□□□□ -1.34
AMD1	YML035C	RTG2	P32608	588 aa	Known RBP	6.66	□□□□□ -1.34
AMD1	YML035C	CIC1	P38779	376 aa	Known RBP	6.66	□□□□□ -1.34
AMD1	YML035C	SLN1	P39928	1220 aa	Predicted RBP	6.66	□□□□□ -1.34
AMD1	YML035C	MSH4	P40965	878 aa	Predicted RBP	6.66	□□□□□ -1.34
AMD1	YML035C	MTC3	P53077	123 aa		6.66	□□□□□ -1.34
AMD1	YML035C	NSG2	P53898	299 aa		6.66	□□□□□ -1.34
AMD1	YML035C	RPS15	Q01855	142 aa	Known RBP	6.66	□□□□□ -1.34
AMD1	YML035C	PCL8	Q08966	492 aa		6.66	□□□□□ -1.34
AMD1	YML035C	YHL050C	P38721	697 aa		6.65	□□□□□ -1.34
AMD1	YML035C	FET4	P40988	552 aa		6.65	□□□□□ -1.34
AMD1	YML035C	YGR117C	P53270	476 aa		6.65	□□□□□ -1.34
AMD1	YML035C	YPL260W	Q08977	551 aa		6.65	□□□□□ -1.34
AMD1	YML035C	SRS2	P12954	1174 aa		6.65	□□□□□ -1.35
AMD1	YML035C	STV1	P37296	890 aa		6.65	□□□□□ -1.35
AMD1	YML035C	ECM23	Q02710	187 aa		6.65	□□□□□ -1.35
AMD1	YML035C	SEN54	Q02825	467 aa	Predicted RBP	6.65	□□□□□ -1.35
AMD1	YML035C	UFD2	P54860	961 aa		6.64	□□□□□ -1.35
AMD1	YML035C	PGA3	Q12746	312 aa	Known RBP	6.64	□□□□□ -1.35
AMD1	YML035C	RAD61	Q99359	647 aa		6.64	□□□□□ -1.35
AMD1	YML035C	KRI1	P42846	591 aa	Known RBP	6.64	□□□□□ -1.35
AMD1	YML035C	VPS4	P52917	437 aa		6.64	□□□□□ -1.35
AMD1	YML035C	CHO2	P05374	869 aa	Known RBP	6.63	□□□□□ -1.35
AMD1	YML035C	GAP1	P19145	602 aa	Predicted RBP	6.63	□□□□□ -1.35
AMD1	YML035C	RER2	P35196	286 aa		6.63	□□□□□ -1.35
AMD1	YML035C	MYO3	P36006	1272 aa		6.63	□□□□□ -1.35
AMD1	YML035C	EMP47	P43555	445 aa		6.63	□□□□□ -1.35
AMD1	YML035C	MRD1	Q06106	887 aa	Known RBP	6.63	□□□□□ -1.35
AMD1	YML035C	KEL3	Q08979	651 aa	Predicted RBP	6.63	□□□□□ -1.35
AMD1	YML035C	LSP1	Q12230	341 aa	Known RBP	6.63	□□□□□ -1.35
AMD1	YML035C	THS1	P04801	734 aa	Known RBP	6.62	□□□□□ -1.35
AMD1	YML035C	HPR1	P17629	752 aa	Known RBP	6.62	□□□□□ -1.35
AMD1	YML035C	IMP2'	P32351	346 aa		6.62	□□□□□ -1.35
AMD1	YML035C	ANP1	P32629	500 aa		6.62	□□□□□ -1.35
AMD1	YML035C	VPS24	P36095	224 aa	Known RBP	6.62	□□□□□ -1.35
AMD1	YML035C	MPH3	P0CE00	602 aa		6.61	□□□□□ -1.35
AMD1	YML035C	MATALPHA2	P0CY08	210 aa		6.61	□□□□□ -1.35
AMD1	YML035C	HMLALPHA2	P0CY09	210 aa		6.61	□□□□□ -1.35
AMD1	YML035C	FBP26	P32604	452 aa		6.61	□□□□□ -1.35
AMD1	YML035C	PES4	P39684	611 aa		6.61	□□□□□ -1.35
AMD1	YML035C	VID27	P40157	782 aa		6.61	□□□□□ -1.35
AMD1	YML035C	EST2	Q06163	884 aa		6.61	□□□□□ -1.35
AMD1	YML035C	AIM7	Q12156	149 aa		6.61	□□□□□ -1.35
AMD1	YML035C	SIS2	P36024	562 aa		6.61	□□□□□ -1.35
AMD1	YML035C	ESF1	Q06344	628 aa	Known RBP	6.61	□□□□□ -1.35
AMD1	YML035C	PSK2	Q08217	1101 aa		6.61	□□□□□ -1.35
AMD1	YML035C	CBP1	P07252	654 aa		6.6	□□□□□ -1.35
AMD1	YML035C	KIN1	P13185	1064 aa		6.6	□□□□□ -1.35
AMD1	YML035C	ADP1	P25371	1049 aa		6.6	□□□□□ -1.35
AMD1	YML035C	MSP1	P28737	362 aa		6.6	□□□□□ -1.35
AMD1	YML035C	YHL017W	P38745	532 aa		6.6	□□□□□ -1.35
AMD1	YML035C	YKE2	P52553	114 aa		6.6	□□□□□ -1.35
AMD1	YML035C	VPS20	Q04272	221 aa		6.6	□□□□□ -1.35
AMD1	YML035C	PUS5	Q06244	254 aa		6.6	□□□□□ -1.35
AMD1	YML035C	PRE8	P23639	250 aa		6.6	□□□□□ -1.35
AMD1	YML035C	UBP10	P53874	792 aa	Predicted RBP	6.6	□□□□□ -1.35
AMD1	YML035C	SKG3	Q06315	1026 aa		6.6	□□□□□ -1.35
AMD1	YML035C	PMA1	P05030	918 aa	Known RBP	6.59	□□□□□ -1.35
AMD1	YML035C	RAD53	P22216	821 aa		6.59	□□□□□ -1.35
AMD1	YML035C	NIT1	P40447	199 aa		6.59	□□□□□ -1.35
AMD1	YML035C	VID28	P40547	921 aa		6.59	□□□□□ -1.35
AMD1	YML035C	NPA3	P47122	385 aa		6.59	□□□□□ -1.35
AMD1	YML035C	SNU71	P53207	620 aa	Known RBP	6.59	□□□□□ -1.35
AMD1	YML035C	ARP5	P53946	755 aa		6.59	□□□□□ -1.35
AMD1	YML035C	TFC6	Q06339	672 aa		6.59	□□□□□ -1.35
AMD1	YML035C	TSR3	Q12094	313 aa	Known RBP	6.59	□□□□□ -1.35
AMD1	YML035C	MYO1	P08964	1928 aa		6.59	□□□□□ -1.35
AMD1	YML035C	RPL19A	P0CX82	189 aa	Known RBP	6.59	□□□□□ -1.35
AMD1	YML035C	RPL19B	P0CX83	189 aa	Predicted RBP	6.59	□□□□□ -1.35
AMD1	YML035C	GAL2	P13181	574 aa		6.59	□□□□□ -1.35
AMD1	YML035C	SRM1	P21827	482 aa		6.59	□□□□□ -1.35
AMD1	YML035C	RIT1	P23796	513 aa		6.59	□□□□□ -1.35
AMD1	YML035C	ARL1	P38116	183 aa	Known RBP	6.59	□□□□□ -1.35
AMD1	YML035C	KEL1	P38853	1164 aa	Known RBP	6.59	□□□□□ -1.35
AMD1	YML035C	ALG2	P43636	503 aa		6.59	□□□□□ -1.35
AMD1	YML035C	MYO5	Q04439	1219 aa	Known RBP	6.59	□□□□□ -1.35
AMD1	YML035C	ISW2	Q08773	1120 aa		6.59	□□□□□ -1.35
AMD1	YML035C	CLF1	Q12309	687 aa	Predicted RBP	6.59	□□□□□ -1.35
AMD1	YML035C	MAK31	P23059	88 aa		6.58	□□□□□ -1.36
AMD1	YML035C	TTI1	P36097	1038 aa		6.58	□□□□□ -1.36
AMD1	YML035C	YBL028C	P38202	106 aa		6.58	□□□□□ -1.36
AMD1	YML035C	CST26	P38226	397 aa		6.58	□□□□□ -1.36
AMD1	YML035C	CTF18	P49956	741 aa		6.58	□□□□□ -1.36
AMD1	YML035C	YLR407W	Q06070	228 aa		6.58	□□□□□ -1.36
AMD1	YML035C	YDL124W	Q07551	312 aa	Known RBP	6.58	□□□□□ -1.36
AMD1	YML035C	CSR2	Q12734	1121 aa		6.58	□□□□□ -1.36
AMD1	YML035C	PRO3	P32263	286 aa	Known RBP	6.58	□□□□□ -1.36
AMD1	YML035C	KNS1	P32350	737 aa	Predicted RBP	6.58	□□□□□ -1.36
AMD1	YML035C	PEA2	P40091	420 aa		6.58	□□□□□ -1.36
AMD1	YML035C	PEX21	P50091	288 aa		6.58	□□□□□ -1.36
AMD1	YML035C	HDA1	P53973	706 aa		6.58	□□□□□ -1.36
AMD1	YML035C	YPL150W	Q12152	901 aa		6.58	□□□□□ -1.36
AMD1	YML035C	VPS8	P39702	1274 aa		6.57	□□□□□ -1.36
AMD1	YML035C	PTK2	P47116	818 aa	Known RBP	6.57	□□□□□ -1.36
AMD1	YML035C	ELG1	Q12050	791 aa		6.57	□□□□□ -1.36
AMD1	YML035C	TUS1	Q06412	1307 aa		6.57	□□□□□ -1.36
AMD1	YML035C	PFK2	P16862	959 aa	Known RBP RIP-Chip data	6.57	□□□□□ -1.36	not detected
AMD1	YML035C	BMH2	P34730	273 aa	Known RBP	6.57	□□□□□ -1.36
AMD1	YML035C	BDH2	P39713	417 aa		6.57	□□□□□ -1.36

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