Protein–RNA interactions for Protein: P53270

YGR117C, Uncharacterized protein YGR117C, yeastyeast

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Length 476 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YGR117CP53270 YML009W-BYML009W-B 477 nt24.36■■□□□ 1.49
YGR117CP53270 NOP1YDL014W 984 nt23.91■■□□□ 1.42
YGR117CP53270 NSR1YGR159C 1245 nt23.63■■□□□ 1.37
YGR117CP53270 YKL036CYKL036C 393 nt22.65■■□□□ 1.22
YGR117CP53270 YJL027CYJL027C 417 nt21.29■■□□□ 1
YGR117CP53270 Q0297Q0297 156 nt21.12■□□□□ 0.97
YGR117CP53270 SCS3YGL126W 1143 nt20.93■□□□□ 0.94
YGR117CP53270 SRX1YKL086W 384 nt20.89■□□□□ 0.93
YGR117CP53270 MDJ1YFL016C 1536 nt20.43■□□□□ 0.86
YGR117CP53270 YCR051WYCR051W 669 nt19.92■□□□□ 0.78
YGR117CP53270 YOL085CYOL085C 342 nt19.61■□□□□ 0.73
YGR117CP53270 PKP1YIL042C 1185 nt19.28■□□□□ 0.68
YGR117CP53270 SCJ1YMR214W 1134 nt19.28■□□□□ 0.68
YGR117CP53270 RPP1BYDL130W 321 nt18.97■□□□□ 0.63
YGR117CP53270 ATS1YAL020C 1002 nt18.91■□□□□ 0.62
YGR117CP53270 TRN1tP(UGG)A 72 nt18.5■□□□□ 0.55
YGR117CP53270 SUF9tP(UGG)F 72 nt18.5■□□□□ 0.55
YGR117CP53270 SUF8tP(UGG)H 72 nt18.5■□□□□ 0.55
YGR117CP53270 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt18.5■□□□□ 0.55
YGR117CP53270 SUF7tP(UGG)M 72 nt18.5■□□□□ 0.55
YGR117CP53270 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt18.5■□□□□ 0.55
YGR117CP53270 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt18.5■□□□□ 0.55
YGR117CP53270 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt18.5■□□□□ 0.55
YGR117CP53270 SUF11tP(UGG)O2 72 nt18.5■□□□□ 0.55
YGR117CP53270 CCC1YLR220W 969 nt18.42■□□□□ 0.54
YGR117CP53270 DBP2YNL112W 1641 nt18.3■□□□□ 0.52
YGR117CP53270 PET122YER153C 765 nt18.05■□□□□ 0.48
YGR117CP53270 SCR1SCR1 522 nt18.05■□□□□ 0.48
YGR117CP53270 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt17.74■□□□□ 0.43
YGR117CP53270 RRN5YLR141W 1092 nt17.63■□□□□ 0.41
YGR117CP53270 RTC3YHR087W 336 nt17.6■□□□□ 0.41
YGR117CP53270 RSB1YOR049C 1065 nt17.45■□□□□ 0.38
YGR117CP53270 PST2YDR032C 597 nt17.4■□□□□ 0.38
YGR117CP53270 RVS167YDR388W 1449 nt17.37■□□□□ 0.37
YGR117CP53270 YER088W-BYER088W-B 147 nt17.27■□□□□ 0.36
YGR117CP53270 YBR190WYBR190W 312 nt17.21■□□□□ 0.35
YGR117CP53270 YDJ1YNL064C 1230 nt17.12■□□□□ 0.33
YGR117CP53270 YKL097CYKL097C 411 nt17.05■□□□□ 0.32
YGR117CP53270 SHR5YOL110W 714 nt16.88■□□□□ 0.29
YGR117CP53270 GAR1YHR089C 618 nt16.7■□□□□ 0.26
YGR117CP53270 SHU1YHL006C 453 nt16.56■□□□□ 0.24
YGR117CP53270 DEP1YAL013W 1218 nt16.27■□□□□ 0.2
YGR117CP53270 YOR139CYOR139C 393 nt16.24■□□□□ 0.19
YGR117CP53270 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt16.16■□□□□ 0.18
YGR117CP53270 TIR1YER011W 765 nt16.09■□□□□ 0.17
YGR117CP53270 URN1YPR152C 1398 nt16.05■□□□□ 0.16
YGR117CP53270 YNL208WYNL208W 600 nt16.03■□□□□ 0.16
YGR117CP53270 NPL3YDR432W 1245 nt15.99■□□□□ 0.15
YGR117CP53270 RPN10YHR200W 807 nt15.94■□□□□ 0.14
YGR117CP53270 SSA1YAL005C 1929 nt15.77■□□□□ 0.12
YGR117CP53270 OPI9YLR338W 858 nt15.66■□□□□ 0.1
YGR117CP53270 SRB2YHR041C 633 nt15.62■□□□□ 0.09
YGR117CP53270 MNP1YGL068W 585 nt15.59■□□□□ 0.09
YGR117CP53270 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt15.58■□□□□ 0.08
YGR117CP53270 IMT4tM(CAU)E 72 nt15.58■□□□□ 0.08
YGR117CP53270 IMT3tM(CAU)J3 72 nt15.58■□□□□ 0.08
YGR117CP53270 IMT1tM(CAU)O1 72 nt15.58■□□□□ 0.08
YGR117CP53270 IMT2tM(CAU)P 72 nt15.58■□□□□ 0.08
YGR117CP53270 YGR021WYGR021W 873 nt15.56■□□□□ 0.08
YGR117CP53270 HOM6YJR139C 1080 nt15.55■□□□□ 0.08
YGR117CP53270 YOL037CYOL037C 354 nt15.53■□□□□ 0.08
YGR117CP53270 WWM1YFL010C 636 nt15.51■□□□□ 0.07
YGR117CP53270 SAH1YER043C 1350 nt15.44■□□□□ 0.06
YGR117CP53270 YJR018WYJR018W 363 nt15.36■□□□□ 0.05
YGR117CP53270 RKM5YLR137W 1104 nt15.32■□□□□ 0.04
YGR117CP53270 PUS2YGL063W 1113 nt15.25■□□□□ 0.03
YGR117CP53270 PUN1YLR414C 792 nt15.22■□□□□ 0.03
YGR117CP53270 RPP2BYDR382W 333 nt15.21■□□□□ 0.03
YGR117CP53270 YJR120WYJR120W 351 nt15.21■□□□□ 0.03
YGR117CP53270 MOT3YMR070W 1473 nt15.2■□□□□ 0.02
YGR117CP53270 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt15.2■□□□□ 0.02
YGR117CP53270 YLR281CYLR281C 468 nt15.17■□□□□ 0.02
YGR117CP53270 PUT4YOR348C 1884 nt15.14■□□□□ 0.01
YGR117CP53270 BSC6YOL137W 1494 nt15.13■□□□□ 0.01
YGR117CP53270 ARE1YCR048W 1833 nt15.08■□□□□ 0
YGR117CP53270 WHI5YOR083W 888 nt15.03■□□□□ -0
YGR117CP53270 SSA3YBL075C 1950 nt15.02□□□□□ -0.01
YGR117CP53270 BDH2YAL061W 1254 nt15□□□□□ -0.01
YGR117CP53270 PTC2YER089C 1395 nt14.96□□□□□ -0.02
YGR117CP53270 LSM3YLR438C-A 270 nt14.92□□□□□ -0.02
YGR117CP53270 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt14.88□□□□□ -0.03
YGR117CP53270 FMP45YDL222C 930 nt14.87□□□□□ -0.03
YGR117CP53270 YPR011CYPR011C 981 nt14.81□□□□□ -0.04
YGR117CP53270 MRPL8YJL063C 717 nt14.8□□□□□ -0.04
YGR117CP53270 POA1YBR022W 534 nt14.78□□□□□ -0.04
YGR117CP53270 DSK2YMR276W 1122 nt14.77□□□□□ -0.05
YGR117CP53270 YCH1YGR203W 447 nt14.74□□□□□ -0.05
YGR117CP53270 INM2YDR287W 879 nt14.72□□□□□ -0.05
YGR117CP53270 YLR236CYLR236C 324 nt14.7□□□□□ -0.06
YGR117CP53270 YBL100CYBL100C 315 nt14.68□□□□□ -0.06
YGR117CP53270 IMP2'YIL154C 1041 nt14.66□□□□□ -0.06
YGR117CP53270 NAB2YGL122C 1578 nt14.65□□□□□ -0.06
YGR117CP53270 TRM9YML014W 840 nt14.65□□□□□ -0.06
YGR117CP53270 BUD23YCR047C 828 nt14.64□□□□□ -0.07
YGR117CP53270 FPR4YLR449W 1179 nt14.62□□□□□ -0.07
YGR117CP53270 ADO1YJR105W 1023 nt14.59□□□□□ -0.07
YGR117CP53270 UBX6YJL048C 1191 nt14.58□□□□□ -0.08
YGR117CP53270 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt14.58□□□□□ -0.08
YGR117CP53270 DAL1YIR027C 1383 nt14.58□□□□□ -0.08
YGR117CP53270 FUN26YAL022C 1554 nt14.54□□□□□ -0.08
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