Protein–RNA interactions for Protein: P43555

EMP47, Protein EMP47, yeastyeast

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
EMP47P43555 YML009W-BYML009W-B 477 nt24.29■■□□□ 1.48
EMP47P43555 NOP1YDL014W 984 nt23.85■■□□□ 1.41
EMP47P43555 NSR1YGR159C 1245 nt23.54■■□□□ 1.36
EMP47P43555 YKL036CYKL036C 393 nt22.63■■□□□ 1.21
EMP47P43555 YJL027CYJL027C 417 nt21.26■□□□□ 0.99
EMP47P43555 Q0297Q0297 156 nt21.08■□□□□ 0.97
EMP47P43555 SCS3YGL126W 1143 nt20.93■□□□□ 0.94
EMP47P43555 SRX1YKL086W 384 nt20.85■□□□□ 0.93
EMP47P43555 MDJ1YFL016C 1536 nt20.31■□□□□ 0.84
EMP47P43555 YCR051WYCR051W 669 nt19.86■□□□□ 0.77
EMP47P43555 YOL085CYOL085C 342 nt19.58■□□□□ 0.72
EMP47P43555 SCJ1YMR214W 1134 nt19.33■□□□□ 0.68
EMP47P43555 PKP1YIL042C 1185 nt19.23■□□□□ 0.67
EMP47P43555 RPP1BYDL130W 321 nt18.93■□□□□ 0.62
EMP47P43555 ATS1YAL020C 1002 nt18.9■□□□□ 0.62
EMP47P43555 TRN1tP(UGG)A 72 nt18.47■□□□□ 0.55
EMP47P43555 SUF9tP(UGG)F 72 nt18.47■□□□□ 0.55
EMP47P43555 SUF8tP(UGG)H 72 nt18.47■□□□□ 0.55
EMP47P43555 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt18.47■□□□□ 0.55
EMP47P43555 SUF7tP(UGG)M 72 nt18.47■□□□□ 0.55
EMP47P43555 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt18.47■□□□□ 0.55
EMP47P43555 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt18.47■□□□□ 0.55
EMP47P43555 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt18.47■□□□□ 0.55
EMP47P43555 SUF11tP(UGG)O2 72 nt18.47■□□□□ 0.55
EMP47P43555 CCC1YLR220W 969 nt18.32■□□□□ 0.52
EMP47P43555 DBP2YNL112W 1641 nt18.21■□□□□ 0.51
EMP47P43555 PET122YER153C 765 nt18.02■□□□□ 0.48
EMP47P43555 SCR1SCR1 522 nt18.01■□□□□ 0.47
EMP47P43555 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt17.7■□□□□ 0.42
EMP47P43555 RTC3YHR087W 336 nt17.62■□□□□ 0.41
EMP47P43555 RRN5YLR141W 1092 nt17.57■□□□□ 0.4
EMP47P43555 RSB1YOR049C 1065 nt17.42■□□□□ 0.38
EMP47P43555 PST2YDR032C 597 nt17.38■□□□□ 0.37
EMP47P43555 RVS167YDR388W 1449 nt17.3■□□□□ 0.36
EMP47P43555 YER088W-BYER088W-B 147 nt17.22■□□□□ 0.35
EMP47P43555 YBR190WYBR190W 312 nt17.12■□□□□ 0.33
EMP47P43555 YDJ1YNL064C 1230 nt17.08■□□□□ 0.32
EMP47P43555 YKL097CYKL097C 411 nt17.06■□□□□ 0.32
EMP47P43555 SHR5YOL110W 714 nt16.84■□□□□ 0.29
EMP47P43555 GAR1YHR089C 618 nt16.65■□□□□ 0.26
EMP47P43555 SHU1YHL006C 453 nt16.53■□□□□ 0.24
EMP47P43555 YOR139CYOR139C 393 nt16.24■□□□□ 0.19
EMP47P43555 DEP1YAL013W 1218 nt16.17■□□□□ 0.18
EMP47P43555 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt16.1■□□□□ 0.17
EMP47P43555 TIR1YER011W 765 nt16.04■□□□□ 0.16
EMP47P43555 NPL3YDR432W 1245 nt15.99■□□□□ 0.15
EMP47P43555 URN1YPR152C 1398 nt15.98■□□□□ 0.15
EMP47P43555 YNL208WYNL208W 600 nt15.97■□□□□ 0.15
EMP47P43555 RPN10YHR200W 807 nt15.88■□□□□ 0.13
EMP47P43555 SSA1YAL005C 1929 nt15.7■□□□□ 0.1
EMP47P43555 MNP1YGL068W 585 nt15.58■□□□□ 0.08
EMP47P43555 OPI9YLR338W 858 nt15.58■□□□□ 0.08
EMP47P43555 SRB2YHR041C 633 nt15.57■□□□□ 0.08
EMP47P43555 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt15.56■□□□□ 0.08
EMP47P43555 IMT4tM(CAU)E 72 nt15.56■□□□□ 0.08
EMP47P43555 IMT3tM(CAU)J3 72 nt15.56■□□□□ 0.08
EMP47P43555 IMT1tM(CAU)O1 72 nt15.56■□□□□ 0.08
EMP47P43555 IMT2tM(CAU)P 72 nt15.56■□□□□ 0.08
EMP47P43555 YOL037CYOL037C 354 nt15.56■□□□□ 0.08
EMP47P43555 YGR021WYGR021W 873 nt15.55■□□□□ 0.08
EMP47P43555 HOM6YJR139C 1080 nt15.53■□□□□ 0.08
EMP47P43555 PUT4YOR348C 1884 nt15.52■□□□□ 0.07
EMP47P43555 WWM1YFL010C 636 nt15.45■□□□□ 0.06
EMP47P43555 SAH1YER043C 1350 nt15.33■□□□□ 0.04
EMP47P43555 RKM5YLR137W 1104 nt15.31■□□□□ 0.04
EMP47P43555 Q0182Q0182 405 nt15.3■□□□□ 0.04
EMP47P43555 YJR018WYJR018W 363 nt15.27■□□□□ 0.04
EMP47P43555 MOT3YMR070W 1473 nt15.23■□□□□ 0.03
EMP47P43555 PUS2YGL063W 1113 nt15.23■□□□□ 0.03
EMP47P43555 ARE1YCR048W 1833 nt15.22■□□□□ 0.03
EMP47P43555 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt15.18■□□□□ 0.02
EMP47P43555 BSC6YOL137W 1494 nt15.16■□□□□ 0.02
EMP47P43555 YJR120WYJR120W 351 nt15.16■□□□□ 0.02
EMP47P43555 RPP2BYDR382W 333 nt15.15■□□□□ 0.02
EMP47P43555 PUN1YLR414C 792 nt15.15■□□□□ 0.02
EMP47P43555 YLR281CYLR281C 468 nt15.13■□□□□ 0.01
EMP47P43555 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt15.02■□□□□ -0
EMP47P43555 POA1YBR022W 534 nt15.02■□□□□ -0
EMP47P43555 WHI5YOR083W 888 nt15□□□□□ -0.01
EMP47P43555 SSA3YBL075C 1950 nt14.98□□□□□ -0.01
EMP47P43555 BDH2YAL061W 1254 nt14.94□□□□□ -0.02
EMP47P43555 FMP45YDL222C 930 nt14.86□□□□□ -0.03
EMP47P43555 LSM3YLR438C-A 270 nt14.86□□□□□ -0.03
EMP47P43555 PTC2YER089C 1395 nt14.85□□□□□ -0.03
EMP47P43555 MRPL8YJL063C 717 nt14.84□□□□□ -0.03
EMP47P43555 YPR011CYPR011C 981 nt14.78□□□□□ -0.04
EMP47P43555 DSK2YMR276W 1122 nt14.76□□□□□ -0.05
EMP47P43555 YCH1YGR203W 447 nt14.73□□□□□ -0.05
EMP47P43555 YLR236CYLR236C 324 nt14.7□□□□□ -0.06
EMP47P43555 BUD23YCR047C 828 nt14.66□□□□□ -0.06
EMP47P43555 IMP2'YIL154C 1041 nt14.66□□□□□ -0.06
EMP47P43555 INM2YDR287W 879 nt14.64□□□□□ -0.07
EMP47P43555 YBL100CYBL100C 315 nt14.62□□□□□ -0.07
EMP47P43555 ADO1YJR105W 1023 nt14.61□□□□□ -0.07
EMP47P43555 UBX6YJL048C 1191 nt14.6□□□□□ -0.07
EMP47P43555 TRM9YML014W 840 nt14.56□□□□□ -0.08
EMP47P43555 NAB2YGL122C 1578 nt14.56□□□□□ -0.08
EMP47P43555 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt14.53□□□□□ -0.08
EMP47P43555 FPR4YLR449W 1179 nt14.52□□□□□ -0.09
EMP47P43555 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 16.5 ms