RNA–Protein interactions for RNA: YML034W

SRC1, Transcript of Inner nuclear membrane protein, yeast

Gene SRC1, Length 2,505 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SRC1	YML034W	MRX4	Q12467	430 aa		2.74	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	CTF3	Q12748	733 aa		2.74	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	YBR126W-A	Q8TGU7	68 aa		2.74	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	FSH3	Q99369	266 aa		2.74	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	YEL009C-A	A0A023PZF2	135 aa		2.73	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	RPC40	P07703	335 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	PRB1	P09232	635 aa		2.73	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	SNF6	P18888	332 aa		2.73	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	PRE7	P23724	241 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	EMP24	P32803	203 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	SDH4	P37298	181 aa		2.73	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	FMC1	P40491	155 aa		2.73	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	MAF1	P41910	395 aa		2.73	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	SSU1	P41930	458 aa		2.73	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	ALT2	P52892	507 aa		2.73	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	NBP35	P52920	328 aa		2.73	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	MDM34	P53083	459 aa		2.73	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	DUO1	P53168	247 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	BUD32	P53323	261 aa		2.73	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	MKC7	P53379	596 aa		2.73	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	YNL184C	P53876	108 aa		2.73	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	DIA1	P54005	336 aa		2.73	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	NUP100	Q02629	959 aa		2.73	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	SLD5	Q03406	294 aa		2.73	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	YDR248C	Q03786	193 aa		2.73	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	GIM5	Q04493	163 aa		2.73	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	NAT4	Q04751	285 aa		2.73	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	FRQ1	Q06389	190 aa		2.73	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	BER1	Q06688	274 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	JLP1	Q12358	412 aa		2.73	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	TFC7	Q12415	435 aa		2.73	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	YPL247C	Q12523	523 aa		2.73	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	EFG1	Q3E705	233 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	Q0144	Q9ZZW2	109 aa		2.73	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	SGF29	P25554	259 aa		2.73	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	STP22	P25604	385 aa		2.73	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	TIP1	P27654	210 aa	Predicted RBP	2.73	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	SPS19	P32573	292 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	SUA5	P32579	426 aa		2.73	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	TVP38	P36164	337 aa		2.73	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	BNA4	P38169	460 aa		2.73	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	DBP8	P38719	431 aa		2.73	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	NDT80	P38830	627 aa		2.73	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	POP2	P39008	433 aa		2.73	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	PCL7	P40186	285 aa		2.73	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	YJR011C	P47086	261 aa	Predicted RBP	2.73	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	YJR012C	P47087	207 aa		2.73	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	NUP57	P48837	541 aa		2.73	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	ERG26	P53199	349 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	PEX31	P53203	462 aa		2.73	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	SLX9	P53251	210 aa	Predicted RBP	2.73	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	SSU72	P53538	206 aa	Predicted RBP	2.73	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	SAE3	P89114	91 aa		2.73	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	MSC1	Q03104	513 aa		2.73	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	HPT1	Q04178	221 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	YLR281C	Q05863	155 aa		2.73	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	ATG39	Q06159	398 aa		2.73	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	ANT1	Q06497	328 aa		2.73	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	PLB3	Q08108	686 aa		2.73	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	RRT8	Q08219	342 aa		2.73	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	TMS1	Q12116	473 aa		2.73	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	WTM1	Q12363	437 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	RTN2	Q12443	393 aa		2.73	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	SPT3	P06844	337 aa		2.72	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	GCY1	P14065	312 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.72	□□□□□ -1.97	not detected
SRC1	YML034W	HSP26	P15992	214 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.72	□□□□□ -1.97	not detected
SRC1	YML034W	MDH1	P17505	334 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.72	□□□□□ -1.97	not detected
SRC1	YML034W	PPH21	P23594	369 aa		2.72	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	PET18	P25362	215 aa		2.72	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	IMG1	P25626	169 aa		2.72	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	HMX1	P32339	317 aa		2.72	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	LSM2	P38203	95 aa	Known RBP	2.72	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	YHR210C	P38893	341 aa		2.72	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	YND1	P40009	630 aa		2.72	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	YER188W	P40103	239 aa		2.72	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	PHO86	P46956	311 aa		2.72	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	FLC3	P53121	802 aa		2.72	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	RPN14	P53196	417 aa		2.72	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	YGR042W	P53227	271 aa		2.72	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	EFM6	P53970	246 aa		2.72	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	VPS28	Q02767	242 aa		2.72	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	UPS3	Q04006	179 aa		2.72	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	CUE4	Q04201	117 aa	Predicted RBP	2.72	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	MRPL35	Q06678	367 aa		2.72	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	MRX9	Q07349	420 aa	Known RBP	2.72	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	TEN1	Q07921	160 aa		2.72	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	THP1	Q08231	455 aa		2.72	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	NAT5	Q08689	176 aa		2.72	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	TIR4	Q12218	487 aa	Predicted RBP	2.72	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	VPS13	Q07878	3144 aa		2.72	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	NOP1	P15646	327 aa	Known RBP	2.72	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	SAM2	P19358	384 aa	Known RBP	2.72	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	SFC1	P33303	322 aa		2.72	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	NTF2	P33331	125 aa	Known RBP	2.72	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	MCR1	P36060	302 aa	Known RBP	2.72	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	PRY2	P36110	329 aa		2.72	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	ASC1	P38011	319 aa	Known RBP	2.72	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	GCV3	P39726	170 aa	Predicted RBP	2.72	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	LSM5	P40089	93 aa	Known RBP	2.72	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	MOB1	P40484	314 aa		2.72	□□□□□ -1.97

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