Protein–RNA interactions for Protein: Q12523

YPL247C, WD repeat-containing protein YPL247C, yeastyeast

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YPL247CQ12523 NSR1YGR159C 1245 nt20.11■□□□□ 0.81
YPL247CQ12523 YML009W-BYML009W-B 477 nt20.09■□□□□ 0.81
YPL247CQ12523 NOP1YDL014W 984 nt19.38■□□□□ 0.69
YPL247CQ12523 MDJ1YFL016C 1536 nt18.11■□□□□ 0.49
YPL247CQ12523 YKL036CYKL036C 393 nt17.75■□□□□ 0.43
YPL247CQ12523 SRX1YKL086W 384 nt16.99■□□□□ 0.31
YPL247CQ12523 Q0297Q0297 156 nt16.96■□□□□ 0.31
YPL247CQ12523 YJL027CYJL027C 417 nt16.63■□□□□ 0.25
YPL247CQ12523 YCR051WYCR051W 669 nt16.11■□□□□ 0.17
YPL247CQ12523 SCS3YGL126W 1143 nt16.1■□□□□ 0.17
YPL247CQ12523 DBP2YNL112W 1641 nt15.98■□□□□ 0.15
YPL247CQ12523 TRN1tP(UGG)A 72 nt15.5■□□□□ 0.07
YPL247CQ12523 SUF9tP(UGG)F 72 nt15.5■□□□□ 0.07
YPL247CQ12523 SUF8tP(UGG)H 72 nt15.5■□□□□ 0.07
YPL247CQ12523 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt15.5■□□□□ 0.07
YPL247CQ12523 SUF7tP(UGG)M 72 nt15.5■□□□□ 0.07
YPL247CQ12523 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt15.5■□□□□ 0.07
YPL247CQ12523 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt15.5■□□□□ 0.07
YPL247CQ12523 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt15.5■□□□□ 0.07
YPL247CQ12523 SUF11tP(UGG)O2 72 nt15.5■□□□□ 0.07
YPL247CQ12523 YBR190WYBR190W 312 nt15.44■□□□□ 0.06
YPL247CQ12523 YOL085CYOL085C 342 nt15.42■□□□□ 0.06
YPL247CQ12523 CCC1YLR220W 969 nt15.36■□□□□ 0.05
YPL247CQ12523 PKP1YIL042C 1185 nt15.25■□□□□ 0.03
YPL247CQ12523 RPP1BYDL130W 321 nt15.22■□□□□ 0.03
YPL247CQ12523 RTC3YHR087W 336 nt15.09■□□□□ 0.01
YPL247CQ12523 SCJ1YMR214W 1134 nt14.85□□□□□ -0.03
YPL247CQ12523 RVS167YDR388W 1449 nt14.84□□□□□ -0.03
YPL247CQ12523 PET122YER153C 765 nt14.6□□□□□ -0.07
YPL247CQ12523 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt14.6□□□□□ -0.07
YPL247CQ12523 ATS1YAL020C 1002 nt14.33□□□□□ -0.12
YPL247CQ12523 SHR5YOL110W 714 nt14.32□□□□□ -0.12
YPL247CQ12523 SCR1SCR1 522 nt14.31□□□□□ -0.12
YPL247CQ12523 PUT4YOR348C 1884 nt14.23□□□□□ -0.13
YPL247CQ12523 RRN5YLR141W 1092 nt14.16□□□□□ -0.14
YPL247CQ12523 YDJ1YNL064C 1230 nt14.09□□□□□ -0.15
YPL247CQ12523 URN1YPR152C 1398 nt14.08□□□□□ -0.16
YPL247CQ12523 DEP1YAL013W 1218 nt14.05□□□□□ -0.16
YPL247CQ12523 ARE1YCR048W 1833 nt13.92□□□□□ -0.18
YPL247CQ12523 OPI9YLR338W 858 nt13.9□□□□□ -0.18
YPL247CQ12523 SAH1YER043C 1350 nt13.9□□□□□ -0.18
YPL247CQ12523 YER088W-BYER088W-B 147 nt13.87□□□□□ -0.19
YPL247CQ12523 GAR1YHR089C 618 nt13.84□□□□□ -0.19
YPL247CQ12523 RSB1YOR049C 1065 nt13.78□□□□□ -0.2
YPL247CQ12523 POA1YBR022W 534 nt13.76□□□□□ -0.21
YPL247CQ12523 SSA3YBL075C 1950 nt13.73□□□□□ -0.21
YPL247CQ12523 RPN10YHR200W 807 nt13.73□□□□□ -0.21
YPL247CQ12523 YNL208WYNL208W 600 nt13.73□□□□□ -0.21
YPL247CQ12523 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt13.71□□□□□ -0.21
YPL247CQ12523 BSC6YOL137W 1494 nt13.48□□□□□ -0.25
YPL247CQ12523 PUN1YLR414C 792 nt13.45□□□□□ -0.26
YPL247CQ12523 YJR018WYJR018W 363 nt13.41□□□□□ -0.26
YPL247CQ12523 TIR1YER011W 765 nt13.38□□□□□ -0.27
YPL247CQ12523 PTC2YER089C 1395 nt13.37□□□□□ -0.27
YPL247CQ12523 BUD23YCR047C 828 nt13.37□□□□□ -0.27
YPL247CQ12523 PST2YDR032C 597 nt13.33□□□□□ -0.28
YPL247CQ12523 SSA1YAL005C 1929 nt13.31□□□□□ -0.28
YPL247CQ12523 YJR120WYJR120W 351 nt13.24□□□□□ -0.29
YPL247CQ12523 NAB2YGL122C 1578 nt13.2□□□□□ -0.3
YPL247CQ12523 SRB2YHR041C 633 nt13.12□□□□□ -0.31
YPL247CQ12523 SPT5YML010W 3192 nt13.08□□□□□ -0.32
YPL247CQ12523 FIS1YIL065C 468 nt13.04□□□□□ -0.32
YPL247CQ12523 RPP2BYDR382W 333 nt13.02□□□□□ -0.33
YPL247CQ12523 DAL1YIR027C 1383 nt12.99□□□□□ -0.33
YPL247CQ12523 FPR4YLR449W 1179 nt12.97□□□□□ -0.33
YPL247CQ12523 INM2YDR287W 879 nt12.92□□□□□ -0.34
YPL247CQ12523 PHO4YFR034C 939 nt12.89□□□□□ -0.35
YPL247CQ12523 SHU1YHL006C 453 nt12.85□□□□□ -0.35
YPL247CQ12523 WWM1YFL010C 636 nt12.8□□□□□ -0.36
YPL247CQ12523 YBL100CYBL100C 315 nt12.79□□□□□ -0.36
YPL247CQ12523 BDH2YAL061W 1254 nt12.78□□□□□ -0.36
YPL247CQ12523 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt12.75□□□□□ -0.37
YPL247CQ12523 YPS1YLR120C 1710 nt12.72□□□□□ -0.37
YPL247CQ12523 MEP2YNL142W 1500 nt12.67□□□□□ -0.38
YPL247CQ12523 FUN26YAL022C 1554 nt12.64□□□□□ -0.39
YPL247CQ12523 YKL097CYKL097C 411 nt12.64□□□□□ -0.39
YPL247CQ12523 SSA4YER103W 1929 nt12.62□□□□□ -0.39
YPL247CQ12523 YDR095CYDR095C 411 nt12.59□□□□□ -0.39
YPL247CQ12523 HOM6YJR139C 1080 nt12.58□□□□□ -0.4
YPL247CQ12523 YGR021WYGR021W 873 nt12.57□□□□□ -0.4
YPL247CQ12523 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt12.56□□□□□ -0.4
YPL247CQ12523 TRM9YML014W 840 nt12.56□□□□□ -0.4
YPL247CQ12523 LSM3YLR438C-A 270 nt12.55□□□□□ -0.4
YPL247CQ12523 MNP1YGL068W 585 nt12.53□□□□□ -0.4
YPL247CQ12523 DCW1YKL046C 1350 nt12.53□□□□□ -0.4
YPL247CQ12523 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt12.52□□□□□ -0.41
YPL247CQ12523 CCT6YDR188W 1641 nt12.46□□□□□ -0.41
YPL247CQ12523 ALF1YNL148C 765 nt12.45□□□□□ -0.42
YPL247CQ12523 PTP1YDL230W 1008 nt12.39□□□□□ -0.43
YPL247CQ12523 RKM5YLR137W 1104 nt12.39□□□□□ -0.43
YPL247CQ12523 RPP2AYOL039W 321 nt12.35□□□□□ -0.43
YPL247CQ12523 CAC2YML102W 1407 nt12.34□□□□□ -0.43
YPL247CQ12523 SIS1YNL007C 1059 nt12.33□□□□□ -0.44
YPL247CQ12523 EMI2YDR516C 1503 nt12.32□□□□□ -0.44
YPL247CQ12523 SUF2tP(AGG)C 72 nt12.3□□□□□ -0.44
YPL247CQ12523 SUF10tP(AGG)N 72 nt12.3□□□□□ -0.44
YPL247CQ12523 YOR139CYOR139C 393 nt12.25□□□□□ -0.45
YPL247CQ12523 YDL221WYDL221W 552 nt12.19□□□□□ -0.46
YPL247CQ12523 BDF1YLR399C 2061 nt12.18□□□□□ -0.46
YPL247CQ12523 ART5YGR068C 1761 nt12.18□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 15.1 ms