Protein–RNA interactions for Protein: Q06389

FRQ1, Calcium-binding protein NCS-1, yeastyeast

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
FRQ1Q06389 NSR1YGR159C 1245 nt16.46■□□□□ 0.23
FRQ1Q06389 YML009W-BYML009W-B 477 nt16.32■□□□□ 0.2
FRQ1Q06389 NOP1YDL014W 984 nt15.72■□□□□ 0.11
FRQ1Q06389 MDJ1YFL016C 1536 nt14.94□□□□□ -0.02
FRQ1Q06389 YKL036CYKL036C 393 nt14.22□□□□□ -0.13
FRQ1Q06389 YJL027CYJL027C 417 nt13.76□□□□□ -0.21
FRQ1Q06389 SRX1YKL086W 384 nt13.73□□□□□ -0.21
FRQ1Q06389 Q0297Q0297 156 nt13.65□□□□□ -0.22
FRQ1Q06389 SSA3YBL075C 1950 nt13.22□□□□□ -0.29
FRQ1Q06389 DBP2YNL112W 1641 nt13.07□□□□□ -0.32
FRQ1Q06389 YCR051WYCR051W 669 nt13.01□□□□□ -0.33
FRQ1Q06389 YBR190WYBR190W 312 nt12.81□□□□□ -0.36
FRQ1Q06389 SCS3YGL126W 1143 nt12.78□□□□□ -0.36
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FRQ1Q06389 SUF9tP(UGG)F 72 nt12.62□□□□□ -0.39
FRQ1Q06389 SUF8tP(UGG)H 72 nt12.62□□□□□ -0.39
FRQ1Q06389 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt12.62□□□□□ -0.39
FRQ1Q06389 SUF7tP(UGG)M 72 nt12.62□□□□□ -0.39
FRQ1Q06389 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt12.62□□□□□ -0.39
FRQ1Q06389 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt12.62□□□□□ -0.39
FRQ1Q06389 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt12.62□□□□□ -0.39
FRQ1Q06389 SUF11tP(UGG)O2 72 nt12.62□□□□□ -0.39
FRQ1Q06389 RTC3YHR087W 336 nt12.51□□□□□ -0.41
FRQ1Q06389 CCC1YLR220W 969 nt12.47□□□□□ -0.41
FRQ1Q06389 YOL085CYOL085C 342 nt12.31□□□□□ -0.44
FRQ1Q06389 RPP1BYDL130W 321 nt12.25□□□□□ -0.45
FRQ1Q06389 RVS167YDR388W 1449 nt12.24□□□□□ -0.45
FRQ1Q06389 PKP1YIL042C 1185 nt12.17□□□□□ -0.46
FRQ1Q06389 SCJ1YMR214W 1134 nt12.12□□□□□ -0.47
FRQ1Q06389 PUT4YOR348C 1884 nt11.92□□□□□ -0.5
FRQ1Q06389 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt11.82□□□□□ -0.52
FRQ1Q06389 PET122YER153C 765 nt11.76□□□□□ -0.53
FRQ1Q06389 SHR5YOL110W 714 nt11.74□□□□□ -0.53
FRQ1Q06389 URN1YPR152C 1398 nt11.6□□□□□ -0.55
FRQ1Q06389 ARE1YCR048W 1833 nt11.56□□□□□ -0.56
FRQ1Q06389 SCR1SCR1 522 nt11.54□□□□□ -0.56
FRQ1Q06389 DEP1YAL013W 1218 nt11.5□□□□□ -0.57
FRQ1Q06389 OPI9YLR338W 858 nt11.5□□□□□ -0.57
FRQ1Q06389 SAH1YER043C 1350 nt11.5□□□□□ -0.57
FRQ1Q06389 POA1YBR022W 534 nt11.47□□□□□ -0.57
FRQ1Q06389 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt11.44□□□□□ -0.58
FRQ1Q06389 YDJ1YNL064C 1230 nt11.44□□□□□ -0.58
FRQ1Q06389 RPN10YHR200W 807 nt11.38□□□□□ -0.59
FRQ1Q06389 RRN5YLR141W 1092 nt11.36□□□□□ -0.59
FRQ1Q06389 BSC6YOL137W 1494 nt11.35□□□□□ -0.59
FRQ1Q06389 ATS1YAL020C 1002 nt11.31□□□□□ -0.6
FRQ1Q06389 SPT5YML010W 3192 nt11.31□□□□□ -0.6
FRQ1Q06389 YNL208WYNL208W 600 nt11.29□□□□□ -0.6
FRQ1Q06389 SSA4YER103W 1929 nt11.27□□□□□ -0.6
FRQ1Q06389 GAR1YHR089C 618 nt11.23□□□□□ -0.61
FRQ1Q06389 PAC11YDR488C 1602 nt11.21□□□□□ -0.61
FRQ1Q06389 PUN1YLR414C 792 nt11.17□□□□□ -0.62
FRQ1Q06389 BUD23YCR047C 828 nt11.14□□□□□ -0.63
FRQ1Q06389 YER088W-BYER088W-B 147 nt11.14□□□□□ -0.63
FRQ1Q06389 PTC2YER089C 1395 nt11.07□□□□□ -0.64
FRQ1Q06389 YJR018WYJR018W 363 nt11.05□□□□□ -0.64
FRQ1Q06389 RSB1YOR049C 1065 nt11.05□□□□□ -0.64
FRQ1Q06389 NVJ2YPR091C 2313 nt11.04□□□□□ -0.64
FRQ1Q06389 NAB2YGL122C 1578 nt10.98□□□□□ -0.65
FRQ1Q06389 BDF1YLR399C 2061 nt10.96□□□□□ -0.66
FRQ1Q06389 TIR1YER011W 765 nt10.88□□□□□ -0.67
FRQ1Q06389 FIS1YIL065C 468 nt10.81□□□□□ -0.68
FRQ1Q06389 YJR120WYJR120W 351 nt10.81□□□□□ -0.68
FRQ1Q06389 SSA1YAL005C 1929 nt10.8□□□□□ -0.68
FRQ1Q06389 TAT1YBR069C 1860 nt10.79□□□□□ -0.68
FRQ1Q06389 FPS1YLL043W 2010 nt10.79□□□□□ -0.68
FRQ1Q06389 DAL1YIR027C 1383 nt10.77□□□□□ -0.68
FRQ1Q06389 RPP2BYDR382W 333 nt10.75□□□□□ -0.69
FRQ1Q06389 MEP2YNL142W 1500 nt10.74□□□□□ -0.69
FRQ1Q06389 FPR4YLR449W 1179 nt10.74□□□□□ -0.69
FRQ1Q06389 INM2YDR287W 879 nt10.68□□□□□ -0.7
FRQ1Q06389 PHO4YFR034C 939 nt10.68□□□□□ -0.7
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FRQ1Q06389 YPS1YLR120C 1710 nt10.58□□□□□ -0.72
FRQ1Q06389 SRB2YHR041C 633 nt10.55□□□□□ -0.72
FRQ1Q06389 YBL100CYBL100C 315 nt10.55□□□□□ -0.72
FRQ1Q06389 PST2YDR032C 597 nt10.53□□□□□ -0.72
FRQ1Q06389 DCW1YKL046C 1350 nt10.5□□□□□ -0.73
FRQ1Q06389 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt10.48□□□□□ -0.73
FRQ1Q06389 YDR095CYDR095C 411 nt10.47□□□□□ -0.73
FRQ1Q06389 BDH2YAL061W 1254 nt10.47□□□□□ -0.73
FRQ1Q06389 FUN26YAL022C 1554 nt10.4□□□□□ -0.74
FRQ1Q06389 YBR220CYBR220C 1683 nt10.4□□□□□ -0.74
FRQ1Q06389 YMR090WYMR090W 684 nt10.39□□□□□ -0.75
FRQ1Q06389 EMI2YDR516C 1503 nt10.38□□□□□ -0.75
FRQ1Q06389 RDN37-1RDN37-1 5354 nt10.36□□□□□ -0.75
FRQ1Q06389 RDN37-2RDN37-2 5354 nt10.36□□□□□ -0.75
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FRQ1Q06389 TRM9YML014W 840 nt10.31□□□□□ -0.76
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FRQ1Q06389 LSM3YLR438C-A 270 nt10.26□□□□□ -0.77
FRQ1Q06389 SDH1YKL148C 1923 nt10.26□□□□□ -0.77
FRQ1Q06389 PTP1YDL230W 1008 nt10.25□□□□□ -0.77
FRQ1Q06389 CCT6YDR188W 1641 nt10.24□□□□□ -0.77
FRQ1Q06389 CAC2YML102W 1407 nt10.22□□□□□ -0.77
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FRQ1Q06389 SHU1YHL006C 453 nt10.19□□□□□ -0.78
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