Protein–RNA interactions for Protein: Q12116

TMS1, Membrane protein TMS1, yeastyeast

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TMS1Q12116 YML009W-BYML009W-B 477 nt18.6■□□□□ 0.57
TMS1Q12116 NOP1YDL014W 984 nt18.3■□□□□ 0.52
TMS1Q12116 NSR1YGR159C 1245 nt18.1■□□□□ 0.49
TMS1Q12116 YKL036CYKL036C 393 nt17.28■□□□□ 0.36
TMS1Q12116 YJL027CYJL027C 417 nt16.22■□□□□ 0.19
TMS1Q12116 Q0297Q0297 156 nt16.13■□□□□ 0.17
TMS1Q12116 SRX1YKL086W 384 nt15.96■□□□□ 0.15
TMS1Q12116 MDJ1YFL016C 1536 nt15.95■□□□□ 0.14
TMS1Q12116 SCS3YGL126W 1143 nt15.93■□□□□ 0.14
TMS1Q12116 YCR051WYCR051W 669 nt15.18■□□□□ 0.02
TMS1Q12116 YOL085CYOL085C 342 nt14.93□□□□□ -0.02
TMS1Q12116 SCJ1YMR214W 1134 nt14.71□□□□□ -0.05
TMS1Q12116 PKP1YIL042C 1185 nt14.64□□□□□ -0.07
TMS1Q12116 RPP1BYDL130W 321 nt14.48□□□□□ -0.09
TMS1Q12116 ATS1YAL020C 1002 nt14.38□□□□□ -0.11
TMS1Q12116 TRN1tP(UGG)A 72 nt14.15□□□□□ -0.14
TMS1Q12116 SUF9tP(UGG)F 72 nt14.15□□□□□ -0.14
TMS1Q12116 SUF8tP(UGG)H 72 nt14.15□□□□□ -0.14
TMS1Q12116 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt14.15□□□□□ -0.14
TMS1Q12116 SUF7tP(UGG)M 72 nt14.15□□□□□ -0.14
TMS1Q12116 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt14.15□□□□□ -0.14
TMS1Q12116 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt14.15□□□□□ -0.14
TMS1Q12116 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt14.15□□□□□ -0.14
TMS1Q12116 SUF11tP(UGG)O2 72 nt14.15□□□□□ -0.14
TMS1Q12116 CCC1YLR220W 969 nt14.03□□□□□ -0.16
TMS1Q12116 DBP2YNL112W 1641 nt13.97□□□□□ -0.17
TMS1Q12116 SCR1SCR1 522 nt13.79□□□□□ -0.2
TMS1Q12116 PET122YER153C 765 nt13.75□□□□□ -0.21
TMS1Q12116 YBR190WYBR190W 312 nt13.71□□□□□ -0.21
TMS1Q12116 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt13.55□□□□□ -0.24
TMS1Q12116 RRN5YLR141W 1092 nt13.42□□□□□ -0.26
TMS1Q12116 RTC3YHR087W 336 nt13.36□□□□□ -0.27
TMS1Q12116 SSA3YBL075C 1950 nt13.32□□□□□ -0.28
TMS1Q12116 RVS167YDR388W 1449 nt13.32□□□□□ -0.28
TMS1Q12116 RSB1YOR049C 1065 nt13.29□□□□□ -0.28
TMS1Q12116 PST2YDR032C 597 nt13.24□□□□□ -0.29
TMS1Q12116 YER088W-BYER088W-B 147 nt13.16□□□□□ -0.3
TMS1Q12116 YDJ1YNL064C 1230 nt13.1□□□□□ -0.31
TMS1Q12116 YKL097CYKL097C 411 nt12.97□□□□□ -0.33
TMS1Q12116 SHR5YOL110W 714 nt12.94□□□□□ -0.34
TMS1Q12116 PUT4YOR348C 1884 nt12.9□□□□□ -0.34
TMS1Q12116 GAR1YHR089C 618 nt12.74□□□□□ -0.37
TMS1Q12116 SHU1YHL006C 453 nt12.58□□□□□ -0.4
TMS1Q12116 ARE1YCR048W 1833 nt12.51□□□□□ -0.41
TMS1Q12116 POA1YBR022W 534 nt12.41□□□□□ -0.42
TMS1Q12116 DEP1YAL013W 1218 nt12.4□□□□□ -0.42
TMS1Q12116 URN1YPR152C 1398 nt12.33□□□□□ -0.44
TMS1Q12116 YOR139CYOR139C 393 nt12.33□□□□□ -0.44
TMS1Q12116 SAH1YER043C 1350 nt12.32□□□□□ -0.44
TMS1Q12116 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt12.31□□□□□ -0.44
TMS1Q12116 TIR1YER011W 765 nt12.29□□□□□ -0.44
TMS1Q12116 YNL208WYNL208W 600 nt12.29□□□□□ -0.44
TMS1Q12116 OPI9YLR338W 858 nt12.27□□□□□ -0.45
TMS1Q12116 BSC6YOL137W 1494 nt12.26□□□□□ -0.45
TMS1Q12116 RPN10YHR200W 807 nt12.25□□□□□ -0.45
TMS1Q12116 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt12.25□□□□□ -0.45
TMS1Q12116 SPT5YML010W 3192 nt12.19□□□□□ -0.46
TMS1Q12116 NPL3YDR432W 1245 nt12.18□□□□□ -0.46
TMS1Q12116 SSA1YAL005C 1929 nt12.02□□□□□ -0.49
TMS1Q12116 BUD23YCR047C 828 nt11.94□□□□□ -0.5
TMS1Q12116 SSA4YER103W 1929 nt11.93□□□□□ -0.5
TMS1Q12116 YGR021WYGR021W 873 nt11.92□□□□□ -0.5
TMS1Q12116 PUN1YLR414C 792 nt11.88□□□□□ -0.51
TMS1Q12116 YOL037CYOL037C 354 nt11.88□□□□□ -0.51
TMS1Q12116 HOM6YJR139C 1080 nt11.87□□□□□ -0.51
TMS1Q12116 MNP1YGL068W 585 nt11.86□□□□□ -0.51
TMS1Q12116 SRB2YHR041C 633 nt11.86□□□□□ -0.51
TMS1Q12116 PTC2YER089C 1395 nt11.84□□□□□ -0.51
TMS1Q12116 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt11.83□□□□□ -0.52
TMS1Q12116 IMT4tM(CAU)E 72 nt11.83□□□□□ -0.52
TMS1Q12116 IMT3tM(CAU)J3 72 nt11.83□□□□□ -0.52
TMS1Q12116 IMT1tM(CAU)O1 72 nt11.83□□□□□ -0.52
TMS1Q12116 IMT2tM(CAU)P 72 nt11.83□□□□□ -0.52
TMS1Q12116 WWM1YFL010C 636 nt11.81□□□□□ -0.52
TMS1Q12116 YJR018WYJR018W 363 nt11.76□□□□□ -0.53
TMS1Q12116 NAB2YGL122C 1578 nt11.75□□□□□ -0.53
TMS1Q12116 RKM5YLR137W 1104 nt11.7□□□□□ -0.54
TMS1Q12116 RPP2BYDR382W 333 nt11.68□□□□□ -0.54
TMS1Q12116 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt11.64□□□□□ -0.55
TMS1Q12116 YJR120WYJR120W 351 nt11.61□□□□□ -0.55
TMS1Q12116 PUS2YGL063W 1113 nt11.6□□□□□ -0.55
TMS1Q12116 FIS1YIL065C 468 nt11.59□□□□□ -0.55
TMS1Q12116 BDF1YLR399C 2061 nt11.56□□□□□ -0.56
TMS1Q12116 MEP2YNL142W 1500 nt11.56□□□□□ -0.56
TMS1Q12116 YLR281CYLR281C 468 nt11.56□□□□□ -0.56
TMS1Q12116 MOT3YMR070W 1473 nt11.56□□□□□ -0.56
TMS1Q12116 DAL1YIR027C 1383 nt11.51□□□□□ -0.57
TMS1Q12116 BDH2YAL061W 1254 nt11.49□□□□□ -0.57
TMS1Q12116 WHI5YOR083W 888 nt11.45□□□□□ -0.58
TMS1Q12116 LSM3YLR438C-A 270 nt11.44□□□□□ -0.58
TMS1Q12116 PHO4YFR034C 939 nt11.42□□□□□ -0.58
TMS1Q12116 FPR4YLR449W 1179 nt11.42□□□□□ -0.58
TMS1Q12116 YPS1YLR120C 1710 nt11.39□□□□□ -0.59
TMS1Q12116 TAT1YBR069C 1860 nt11.39□□□□□ -0.59
TMS1Q12116 DCW1YKL046C 1350 nt11.39□□□□□ -0.59
TMS1Q12116 INM2YDR287W 879 nt11.35□□□□□ -0.59
TMS1Q12116 FMP45YDL222C 930 nt11.3□□□□□ -0.6
TMS1Q12116 MRPL8YJL063C 717 nt11.29□□□□□ -0.6
TMS1Q12116 DSK2YMR276W 1122 nt11.27□□□□□ -0.61
TMS1Q12116 YBL100CYBL100C 315 nt11.26□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 7.7 ms