Protein–RNA interactions for Protein: P47087

YJR012C, Uncharacterized protein YJR012C, yeastyeast

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YJR012CP47087 NSR1YGR159C 1245 nt16.88■□□□□ 0.29
YJR012CP47087 YML009W-BYML009W-B 477 nt16.62■□□□□ 0.25
YJR012CP47087 NOP1YDL014W 984 nt16.01■□□□□ 0.15
YJR012CP47087 MDJ1YFL016C 1536 nt15.34■□□□□ 0.05
YJR012CP47087 YKL036CYKL036C 393 nt14.46□□□□□ -0.09
YJR012CP47087 YJL027CYJL027C 417 nt14.13□□□□□ -0.15
YJR012CP47087 SRX1YKL086W 384 nt13.98□□□□□ -0.17
YJR012CP47087 Q0297Q0297 156 nt13.88□□□□□ -0.19
YJR012CP47087 DBP2YNL112W 1641 nt13.42□□□□□ -0.26
YJR012CP47087 YCR051WYCR051W 669 nt13.23□□□□□ -0.29
YJR012CP47087 YBR190WYBR190W 312 nt13.2□□□□□ -0.3
YJR012CP47087 SSA3YBL075C 1950 nt13.18□□□□□ -0.3
YJR012CP47087 SCS3YGL126W 1143 nt13.03□□□□□ -0.32
YJR012CP47087 RTC3YHR087W 336 nt12.88□□□□□ -0.35
YJR012CP47087 TRN1tP(UGG)A 72 nt12.87□□□□□ -0.35
YJR012CP47087 SUF9tP(UGG)F 72 nt12.87□□□□□ -0.35
YJR012CP47087 SUF8tP(UGG)H 72 nt12.87□□□□□ -0.35
YJR012CP47087 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt12.87□□□□□ -0.35
YJR012CP47087 SUF7tP(UGG)M 72 nt12.87□□□□□ -0.35
YJR012CP47087 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt12.87□□□□□ -0.35
YJR012CP47087 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt12.87□□□□□ -0.35
YJR012CP47087 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt12.87□□□□□ -0.35
YJR012CP47087 SUF11tP(UGG)O2 72 nt12.87□□□□□ -0.35
YJR012CP47087 CCC1YLR220W 969 nt12.74□□□□□ -0.37
YJR012CP47087 RVS167YDR388W 1449 nt12.54□□□□□ -0.4
YJR012CP47087 YOL085CYOL085C 342 nt12.48□□□□□ -0.41
YJR012CP47087 RPP1BYDL130W 321 nt12.46□□□□□ -0.41
YJR012CP47087 SCJ1YMR214W 1134 nt12.37□□□□□ -0.43
YJR012CP47087 PKP1YIL042C 1185 nt12.33□□□□□ -0.44
YJR012CP47087 PUT4YOR348C 1884 nt12.29□□□□□ -0.44
YJR012CP47087 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt12.05□□□□□ -0.48
YJR012CP47087 SHR5YOL110W 714 nt12□□□□□ -0.49
YJR012CP47087 ARE1YCR048W 1833 nt11.95□□□□□ -0.5
YJR012CP47087 PET122YER153C 765 nt11.94□□□□□ -0.5
YJR012CP47087 URN1YPR152C 1398 nt11.92□□□□□ -0.5
YJR012CP47087 POA1YBR022W 534 nt11.87□□□□□ -0.51
YJR012CP47087 SAH1YER043C 1350 nt11.85□□□□□ -0.51
YJR012CP47087 OPI9YLR338W 858 nt11.82□□□□□ -0.52
YJR012CP47087 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt11.78□□□□□ -0.52
YJR012CP47087 DEP1YAL013W 1218 nt11.78□□□□□ -0.52
YJR012CP47087 SCR1SCR1 522 nt11.71□□□□□ -0.53
YJR012CP47087 BSC6YOL137W 1494 nt11.69□□□□□ -0.54
YJR012CP47087 YDJ1YNL064C 1230 nt11.67□□□□□ -0.54
YJR012CP47087 ATS1YAL020C 1002 nt11.65□□□□□ -0.54
YJR012CP47087 RPN10YHR200W 807 nt11.64□□□□□ -0.55
YJR012CP47087 YNL208WYNL208W 600 nt11.57□□□□□ -0.56
YJR012CP47087 RRN5YLR141W 1092 nt11.56□□□□□ -0.56
YJR012CP47087 BUD23YCR047C 828 nt11.48□□□□□ -0.57
YJR012CP47087 PUN1YLR414C 792 nt11.47□□□□□ -0.57
YJR012CP47087 SPT5YML010W 3192 nt11.46□□□□□ -0.57
YJR012CP47087 GAR1YHR089C 618 nt11.46□□□□□ -0.57
YJR012CP47087 PTC2YER089C 1395 nt11.41□□□□□ -0.58
YJR012CP47087 YJR018WYJR018W 363 nt11.34□□□□□ -0.59
YJR012CP47087 YER088W-BYER088W-B 147 nt11.33□□□□□ -0.6
YJR012CP47087 NAB2YGL122C 1578 nt11.32□□□□□ -0.6
YJR012CP47087 SSA4YER103W 1929 nt11.31□□□□□ -0.6
YJR012CP47087 RSB1YOR049C 1065 nt11.19□□□□□ -0.62
YJR012CP47087 PAC11YDR488C 1602 nt11.11□□□□□ -0.63
YJR012CP47087 TIR1YER011W 765 nt11.1□□□□□ -0.63
YJR012CP47087 FIS1YIL065C 468 nt11.1□□□□□ -0.63
YJR012CP47087 DAL1YIR027C 1383 nt11.09□□□□□ -0.63
YJR012CP47087 YJR120WYJR120W 351 nt11.07□□□□□ -0.64
YJR012CP47087 SSA1YAL005C 1929 nt11.05□□□□□ -0.64
YJR012CP47087 FPR4YLR449W 1179 nt11.04□□□□□ -0.64
YJR012CP47087 MEP2YNL142W 1500 nt11.02□□□□□ -0.65
YJR012CP47087 RPP2BYDR382W 333 nt11.01□□□□□ -0.65
YJR012CP47087 BDF1YLR399C 2061 nt11□□□□□ -0.65
YJR012CP47087 INM2YDR287W 879 nt11□□□□□ -0.65
YJR012CP47087 PHO4YFR034C 939 nt10.98□□□□□ -0.65
YJR012CP47087 NVJ2YPR091C 2313 nt10.93□□□□□ -0.66
YJR012CP47087 YPS1YLR120C 1710 nt10.92□□□□□ -0.66
YJR012CP47087 TAT1YBR069C 1860 nt10.83□□□□□ -0.68
YJR012CP47087 DCW1YKL046C 1350 nt10.82□□□□□ -0.68
YJR012CP47087 YBL100CYBL100C 315 nt10.82□□□□□ -0.68
YJR012CP47087 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt10.81□□□□□ -0.68
YJR012CP47087 PST2YDR032C 597 nt10.79□□□□□ -0.68
YJR012CP47087 YDR095CYDR095C 411 nt10.78□□□□□ -0.68
YJR012CP47087 SRB2YHR041C 633 nt10.78□□□□□ -0.68
YJR012CP47087 BDH2YAL061W 1254 nt10.72□□□□□ -0.69
YJR012CP47087 EMI2YDR516C 1503 nt10.68□□□□□ -0.7
YJR012CP47087 FUN26YAL022C 1554 nt10.68□□□□□ -0.7
YJR012CP47087 YMR090WYMR090W 684 nt10.65□□□□□ -0.7
YJR012CP47087 YBR220CYBR220C 1683 nt10.62□□□□□ -0.71
YJR012CP47087 ALF1YNL148C 765 nt10.61□□□□□ -0.71
YJR012CP47087 TRM9YML014W 840 nt10.59□□□□□ -0.71
YJR012CP47087 PTP1YDL230W 1008 nt10.58□□□□□ -0.72
YJR012CP47087 RPP2AYOL039W 321 nt10.58□□□□□ -0.72
YJR012CP47087 YDL221WYDL221W 552 nt10.57□□□□□ -0.72
YJR012CP47087 CAC2YML102W 1407 nt10.57□□□□□ -0.72
YJR012CP47087 Q0182Q0182 405 nt10.56□□□□□ -0.72
YJR012CP47087 FPS1YLL043W 2010 nt10.55□□□□□ -0.72
YJR012CP47087 WWM1YFL010C 636 nt10.54□□□□□ -0.72
YJR012CP47087 LSM3YLR438C-A 270 nt10.52□□□□□ -0.73
YJR012CP47087 SDH1YKL148C 1923 nt10.52□□□□□ -0.73
YJR012CP47087 CCT6YDR188W 1641 nt10.51□□□□□ -0.73
YJR012CP47087 SIS1YNL007C 1059 nt10.46□□□□□ -0.73
YJR012CP47087 SUF2tP(AGG)C 72 nt10.44□□□□□ -0.74
YJR012CP47087 SUF10tP(AGG)N 72 nt10.44□□□□□ -0.74
YJR012CP47087 IRC15YPL017C 1500 nt10.41□□□□□ -0.74
YJR012CP47087 SCC4YER147C 1875 nt10.4□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 14.1 ms