Protein–RNA interactions for Protein: Q08108

PLB3, Lysophospholipase 3, yeastyeast

Predictions only

Length 686 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PLB3Q08108 YML009W-BYML009W-B 477 nt20.14■□□□□ 0.81
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PLB3Q08108 NOP1YDL014W 984 nt19.66■□□□□ 0.74
PLB3Q08108 YKL036CYKL036C 393 nt18.28■□□□□ 0.52
PLB3Q08108 MDJ1YFL016C 1536 nt17.45■□□□□ 0.38
PLB3Q08108 Q0297Q0297 156 nt17.23■□□□□ 0.35
PLB3Q08108 SRX1YKL086W 384 nt17.16■□□□□ 0.34
PLB3Q08108 YJL027CYJL027C 417 nt17.11■□□□□ 0.33
PLB3Q08108 SCS3YGL126W 1143 nt16.7■□□□□ 0.26
PLB3Q08108 YCR051WYCR051W 669 nt16.31■□□□□ 0.2
PLB3Q08108 YOL085CYOL085C 342 nt15.81■□□□□ 0.12
PLB3Q08108 PKP1YIL042C 1185 nt15.56■□□□□ 0.08
PLB3Q08108 DBP2YNL112W 1641 nt15.47■□□□□ 0.07
PLB3Q08108 RPP1BYDL130W 321 nt15.47■□□□□ 0.07
PLB3Q08108 TRN1tP(UGG)A 72 nt15.4■□□□□ 0.06
PLB3Q08108 SUF9tP(UGG)F 72 nt15.4■□□□□ 0.06
PLB3Q08108 SUF8tP(UGG)H 72 nt15.4■□□□□ 0.06
PLB3Q08108 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt15.4■□□□□ 0.06
PLB3Q08108 SUF7tP(UGG)M 72 nt15.4■□□□□ 0.06
PLB3Q08108 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt15.4■□□□□ 0.06
PLB3Q08108 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt15.4■□□□□ 0.06
PLB3Q08108 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt15.4■□□□□ 0.06
PLB3Q08108 SUF11tP(UGG)O2 72 nt15.4■□□□□ 0.06
PLB3Q08108 CCC1YLR220W 969 nt15.27■□□□□ 0.04
PLB3Q08108 SCJ1YMR214W 1134 nt15.03■□□□□ -0
PLB3Q08108 ATS1YAL020C 1002 nt14.99□□□□□ -0.01
PLB3Q08108 YBR190WYBR190W 312 nt14.85□□□□□ -0.03
PLB3Q08108 PET122YER153C 765 nt14.75□□□□□ -0.05
PLB3Q08108 SCR1SCR1 522 nt14.69□□□□□ -0.06
PLB3Q08108 RVS167YDR388W 1449 nt14.67□□□□□ -0.06
PLB3Q08108 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt14.63□□□□□ -0.07
PLB3Q08108 RTC3YHR087W 336 nt14.56□□□□□ -0.08
PLB3Q08108 RRN5YLR141W 1092 nt14.35□□□□□ -0.11
PLB3Q08108 SHR5YOL110W 714 nt14.17□□□□□ -0.14
PLB3Q08108 YDJ1YNL064C 1230 nt14.15□□□□□ -0.14
PLB3Q08108 RSB1YOR049C 1065 nt14.13□□□□□ -0.15
PLB3Q08108 YER088W-BYER088W-B 147 nt14.06□□□□□ -0.16
PLB3Q08108 PST2YDR032C 597 nt13.84□□□□□ -0.19
PLB3Q08108 GAR1YHR089C 618 nt13.82□□□□□ -0.2
PLB3Q08108 DEP1YAL013W 1218 nt13.71□□□□□ -0.21
PLB3Q08108 URN1YPR152C 1398 nt13.67□□□□□ -0.22
PLB3Q08108 RPN10YHR200W 807 nt13.54□□□□□ -0.24
PLB3Q08108 YNL208WYNL208W 600 nt13.53□□□□□ -0.24
PLB3Q08108 SSA3YBL075C 1950 nt13.43□□□□□ -0.26
PLB3Q08108 OPI9YLR338W 858 nt13.43□□□□□ -0.26
PLB3Q08108 YKL097CYKL097C 411 nt13.42□□□□□ -0.26
PLB3Q08108 TIR1YER011W 765 nt13.35□□□□□ -0.27
PLB3Q08108 PUT4YOR348C 1884 nt13.31□□□□□ -0.28
PLB3Q08108 SAH1YER043C 1350 nt13.3□□□□□ -0.28
PLB3Q08108 SHU1YHL006C 453 nt13.24□□□□□ -0.29
PLB3Q08108 ARE1YCR048W 1833 nt13.13□□□□□ -0.31
PLB3Q08108 SSA1YAL005C 1929 nt13.13□□□□□ -0.31
PLB3Q08108 YJR018WYJR018W 363 nt13.06□□□□□ -0.32
PLB3Q08108 PUN1YLR414C 792 nt13.06□□□□□ -0.32
PLB3Q08108 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt12.99□□□□□ -0.33
PLB3Q08108 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt12.99□□□□□ -0.33
PLB3Q08108 POA1YBR022W 534 nt12.94□□□□□ -0.34
PLB3Q08108 SRB2YHR041C 633 nt12.9□□□□□ -0.34
PLB3Q08108 RPP2BYDR382W 333 nt12.87□□□□□ -0.35
PLB3Q08108 PTC2YER089C 1395 nt12.85□□□□□ -0.35
PLB3Q08108 YJR120WYJR120W 351 nt12.83□□□□□ -0.36
PLB3Q08108 YOR139CYOR139C 393 nt12.8□□□□□ -0.36
PLB3Q08108 YGR021WYGR021W 873 nt12.79□□□□□ -0.36
PLB3Q08108 WWM1YFL010C 636 nt12.78□□□□□ -0.36
PLB3Q08108 BUD23YCR047C 828 nt12.73□□□□□ -0.37
PLB3Q08108 NPL3YDR432W 1245 nt12.72□□□□□ -0.37
PLB3Q08108 HOM6YJR139C 1080 nt12.72□□□□□ -0.37
PLB3Q08108 MNP1YGL068W 585 nt12.68□□□□□ -0.38
PLB3Q08108 NAB2YGL122C 1578 nt12.68□□□□□ -0.38
PLB3Q08108 BSC6YOL137W 1494 nt12.62□□□□□ -0.39
PLB3Q08108 BDH2YAL061W 1254 nt12.61□□□□□ -0.39
PLB3Q08108 INM2YDR287W 879 nt12.58□□□□□ -0.4
PLB3Q08108 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt12.58□□□□□ -0.4
PLB3Q08108 YOL037CYOL037C 354 nt12.56□□□□□ -0.4
PLB3Q08108 RKM5YLR137W 1104 nt12.54□□□□□ -0.4
PLB3Q08108 FPR4YLR449W 1179 nt12.54□□□□□ -0.4
PLB3Q08108 DAL1YIR027C 1383 nt12.54□□□□□ -0.4
PLB3Q08108 FIS1YIL065C 468 nt12.48□□□□□ -0.41
PLB3Q08108 LSM3YLR438C-A 270 nt12.48□□□□□ -0.41
PLB3Q08108 YBL100CYBL100C 315 nt12.48□□□□□ -0.41
PLB3Q08108 SPT5YML010W 3192 nt12.45□□□□□ -0.42
PLB3Q08108 PHO4YFR034C 939 nt12.41□□□□□ -0.42
PLB3Q08108 TRM9YML014W 840 nt12.36□□□□□ -0.43
PLB3Q08108 FUN26YAL022C 1554 nt12.33□□□□□ -0.44
PLB3Q08108 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt12.3□□□□□ -0.44
PLB3Q08108 IMT4tM(CAU)E 72 nt12.3□□□□□ -0.44
PLB3Q08108 IMT3tM(CAU)J3 72 nt12.3□□□□□ -0.44
PLB3Q08108 IMT1tM(CAU)O1 72 nt12.3□□□□□ -0.44
PLB3Q08108 IMT2tM(CAU)P 72 nt12.3□□□□□ -0.44
PLB3Q08108 YLR281CYLR281C 468 nt12.24□□□□□ -0.45
PLB3Q08108 CCT6YDR188W 1641 nt12.21□□□□□ -0.46
PLB3Q08108 PUS2YGL063W 1113 nt12.19□□□□□ -0.46
PLB3Q08108 WHI5YOR083W 888 nt12.18□□□□□ -0.46
PLB3Q08108 ALF1YNL148C 765 nt12.16□□□□□ -0.46
PLB3Q08108 SSA4YER103W 1929 nt12.13□□□□□ -0.47
PLB3Q08108 SUF2tP(AGG)C 72 nt12.12□□□□□ -0.47
PLB3Q08108 SUF10tP(AGG)N 72 nt12.12□□□□□ -0.47
PLB3Q08108 YPS1YLR120C 1710 nt12.09□□□□□ -0.47
PLB3Q08108 YDR095CYDR095C 411 nt12.05□□□□□ -0.48
PLB3Q08108 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt12.04□□□□□ -0.48
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