Protein–RNA interactions for Protein: Q12443

RTN2, Reticulon-like protein 2, yeastyeast

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RTN2Q12443 NSR1YGR159C 1245 nt17.83■□□□□ 0.44
RTN2Q12443 YML009W-BYML009W-B 477 nt17.82■□□□□ 0.44
RTN2Q12443 NOP1YDL014W 984 nt17.37■□□□□ 0.37
RTN2Q12443 MDJ1YFL016C 1536 nt16.44■□□□□ 0.22
RTN2Q12443 YKL036CYKL036C 393 nt16.01■□□□□ 0.15
RTN2Q12443 Q0297Q0297 156 nt15.27■□□□□ 0.04
RTN2Q12443 SRX1YKL086W 384 nt15.21■□□□□ 0.03
RTN2Q12443 YJL027CYJL027C 417 nt15.1■□□□□ 0.01
RTN2Q12443 SCS3YGL126W 1143 nt14.56□□□□□ -0.08
RTN2Q12443 YCR051WYCR051W 669 nt14.32□□□□□ -0.12
RTN2Q12443 DBP2YNL112W 1641 nt14.24□□□□□ -0.13
RTN2Q12443 YBR190WYBR190W 312 nt14.12□□□□□ -0.15
RTN2Q12443 YOL085CYOL085C 342 nt13.88□□□□□ -0.19
RTN2Q12443 RTC3YHR087W 336 nt13.83□□□□□ -0.2
RTN2Q12443 SSA3YBL075C 1950 nt13.81□□□□□ -0.2
RTN2Q12443 TRN1tP(UGG)A 72 nt13.78□□□□□ -0.2
RTN2Q12443 SUF9tP(UGG)F 72 nt13.78□□□□□ -0.2
RTN2Q12443 SUF8tP(UGG)H 72 nt13.78□□□□□ -0.2
RTN2Q12443 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt13.78□□□□□ -0.2
RTN2Q12443 SUF7tP(UGG)M 72 nt13.78□□□□□ -0.2
RTN2Q12443 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt13.78□□□□□ -0.2
RTN2Q12443 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt13.78□□□□□ -0.2
RTN2Q12443 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt13.78□□□□□ -0.2
RTN2Q12443 SUF11tP(UGG)O2 72 nt13.78□□□□□ -0.2
RTN2Q12443 RPP1BYDL130W 321 nt13.66□□□□□ -0.22
RTN2Q12443 PKP1YIL042C 1185 nt13.56□□□□□ -0.24
RTN2Q12443 CCC1YLR220W 969 nt13.48□□□□□ -0.25
RTN2Q12443 RVS167YDR388W 1449 nt13.3□□□□□ -0.28
RTN2Q12443 PUT4YOR348C 1884 nt13.27□□□□□ -0.29
RTN2Q12443 SCJ1YMR214W 1134 nt13.11□□□□□ -0.31
RTN2Q12443 PET122YER153C 765 nt13.02□□□□□ -0.33
RTN2Q12443 ATS1YAL020C 1002 nt13.02□□□□□ -0.33
RTN2Q12443 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt12.99□□□□□ -0.33
RTN2Q12443 Q0182Q0182 405 nt12.88□□□□□ -0.35
RTN2Q12443 SCR1SCR1 522 nt12.86□□□□□ -0.35
RTN2Q12443 ARE1YCR048W 1833 nt12.85□□□□□ -0.35
RTN2Q12443 POA1YBR022W 534 nt12.84□□□□□ -0.35
RTN2Q12443 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt12.73□□□□□ -0.37
RTN2Q12443 SAH1YER043C 1350 nt12.71□□□□□ -0.37
RTN2Q12443 SHR5YOL110W 714 nt12.71□□□□□ -0.37
RTN2Q12443 URN1YPR152C 1398 nt12.7□□□□□ -0.38
RTN2Q12443 BSC6YOL137W 1494 nt12.67□□□□□ -0.38
RTN2Q12443 RRN5YLR141W 1092 nt12.63□□□□□ -0.39
RTN2Q12443 YDJ1YNL064C 1230 nt12.63□□□□□ -0.39
RTN2Q12443 OPI9YLR338W 858 nt12.62□□□□□ -0.39
RTN2Q12443 DEP1YAL013W 1218 nt12.57□□□□□ -0.4
RTN2Q12443 BUD23YCR047C 828 nt12.42□□□□□ -0.42
RTN2Q12443 YER088W-BYER088W-B 147 nt12.41□□□□□ -0.42
RTN2Q12443 SPT5YML010W 3192 nt12.4□□□□□ -0.42
RTN2Q12443 RPN10YHR200W 807 nt12.38□□□□□ -0.43
RTN2Q12443 SSA4YER103W 1929 nt12.33□□□□□ -0.44
RTN2Q12443 RSB1YOR049C 1065 nt12.32□□□□□ -0.44
RTN2Q12443 YNL208WYNL208W 600 nt12.27□□□□□ -0.45
RTN2Q12443 PUN1YLR414C 792 nt12.26□□□□□ -0.45
RTN2Q12443 PTC2YER089C 1395 nt12.22□□□□□ -0.45
RTN2Q12443 GAR1YHR089C 618 nt12.22□□□□□ -0.45
RTN2Q12443 MOT3YMR070W 1473 nt12.21□□□□□ -0.45
RTN2Q12443 NAB2YGL122C 1578 nt12.12□□□□□ -0.47
RTN2Q12443 PST2YDR032C 597 nt12.1□□□□□ -0.47
RTN2Q12443 YJR018WYJR018W 363 nt12.08□□□□□ -0.48
RTN2Q12443 MEP2YNL142W 1500 nt11.93□□□□□ -0.5
RTN2Q12443 FIS1YIL065C 468 nt11.9□□□□□ -0.5
RTN2Q12443 FPR4YLR449W 1179 nt11.88□□□□□ -0.51
RTN2Q12443 TIR1YER011W 765 nt11.87□□□□□ -0.51
RTN2Q12443 DAL1YIR027C 1383 nt11.87□□□□□ -0.51
RTN2Q12443 BDF1YLR399C 2061 nt11.87□□□□□ -0.51
RTN2Q12443 PHO4YFR034C 939 nt11.76□□□□□ -0.53
RTN2Q12443 YJR120WYJR120W 351 nt11.75□□□□□ -0.53
RTN2Q12443 DCW1YKL046C 1350 nt11.75□□□□□ -0.53
RTN2Q12443 SSA1YAL005C 1929 nt11.74□□□□□ -0.53
RTN2Q12443 TAT1YBR069C 1860 nt11.71□□□□□ -0.53
RTN2Q12443 YPS1YLR120C 1710 nt11.71□□□□□ -0.54
RTN2Q12443 INM2YDR287W 879 nt11.7□□□□□ -0.54
RTN2Q12443 RPP2BYDR382W 333 nt11.69□□□□□ -0.54
RTN2Q12443 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt11.68□□□□□ -0.54
RTN2Q12443 EMI2YDR516C 1503 nt11.58□□□□□ -0.56
RTN2Q12443 SHU1YHL006C 453 nt11.57□□□□□ -0.56
RTN2Q12443 YDR095CYDR095C 411 nt11.56□□□□□ -0.56
RTN2Q12443 SRB2YHR041C 633 nt11.55□□□□□ -0.56
RTN2Q12443 YMR090WYMR090W 684 nt11.55□□□□□ -0.56
RTN2Q12443 YKL097CYKL097C 411 nt11.54□□□□□ -0.56
RTN2Q12443 YBR220CYBR220C 1683 nt11.53□□□□□ -0.56
RTN2Q12443 YBL100CYBL100C 315 nt11.52□□□□□ -0.57
RTN2Q12443 YDL221WYDL221W 552 nt11.44□□□□□ -0.58
RTN2Q12443 PAC11YDR488C 1602 nt11.42□□□□□ -0.58
RTN2Q12443 SDH1YKL148C 1923 nt11.39□□□□□ -0.59
RTN2Q12443 CAC2YML102W 1407 nt11.38□□□□□ -0.59
RTN2Q12443 FUN26YAL022C 1554 nt11.36□□□□□ -0.59
RTN2Q12443 ALF1YNL148C 765 nt11.35□□□□□ -0.59
RTN2Q12443 RPP2AYOL039W 321 nt11.35□□□□□ -0.59
RTN2Q12443 PTP1YDL230W 1008 nt11.34□□□□□ -0.59
RTN2Q12443 WWM1YFL010C 636 nt11.32□□□□□ -0.6
RTN2Q12443 BDH2YAL061W 1254 nt11.32□□□□□ -0.6
RTN2Q12443 YGR021WYGR021W 873 nt11.31□□□□□ -0.6
RTN2Q12443 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt11.31□□□□□ -0.6
RTN2Q12443 HOM6YJR139C 1080 nt11.28□□□□□ -0.6
RTN2Q12443 SCC4YER147C 1875 nt11.25□□□□□ -0.61
RTN2Q12443 PCH2YBR186W 1695 nt11.24□□□□□ -0.61
RTN2Q12443 TRM9YML014W 840 nt11.23□□□□□ -0.61
RTN2Q12443 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt11.21□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 19 ms