Protein–RNA interactions for Protein: Q12363

WTM1, Transcriptional modulator WTM1, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
WTM1Q12363 NSR1YGR159C 1245 nt19.16■□□□□ 0.66
WTM1Q12363 YML009W-BYML009W-B 477 nt19.01■□□□□ 0.63
WTM1Q12363 NOP1YDL014W 984 nt18.28■□□□□ 0.52
WTM1Q12363 MDJ1YFL016C 1536 nt17.41■□□□□ 0.38
WTM1Q12363 YKL036CYKL036C 393 nt16.57■□□□□ 0.24
WTM1Q12363 YJL027CYJL027C 417 nt15.99■□□□□ 0.15
WTM1Q12363 SRX1YKL086W 384 nt15.99■□□□□ 0.15
WTM1Q12363 Q0297Q0297 156 nt15.91■□□□□ 0.14
WTM1Q12363 DBP2YNL112W 1641 nt15.25■□□□□ 0.03
WTM1Q12363 YCR051WYCR051W 669 nt15.17■□□□□ 0.02
WTM1Q12363 SCS3YGL126W 1143 nt14.92□□□□□ -0.02
WTM1Q12363 YBR190WYBR190W 312 nt14.88□□□□□ -0.03
WTM1Q12363 TRN1tP(UGG)A 72 nt14.69□□□□□ -0.06
WTM1Q12363 SUF9tP(UGG)F 72 nt14.69□□□□□ -0.06
WTM1Q12363 SUF8tP(UGG)H 72 nt14.69□□□□□ -0.06
WTM1Q12363 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt14.69□□□□□ -0.06
WTM1Q12363 SUF7tP(UGG)M 72 nt14.69□□□□□ -0.06
WTM1Q12363 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt14.69□□□□□ -0.06
WTM1Q12363 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt14.69□□□□□ -0.06
WTM1Q12363 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt14.69□□□□□ -0.06
WTM1Q12363 SUF11tP(UGG)O2 72 nt14.69□□□□□ -0.06
WTM1Q12363 CCC1YLR220W 969 nt14.56□□□□□ -0.08
WTM1Q12363 RTC3YHR087W 336 nt14.55□□□□□ -0.08
WTM1Q12363 YOL085CYOL085C 342 nt14.38□□□□□ -0.11
WTM1Q12363 RPP1BYDL130W 321 nt14.28□□□□□ -0.12
WTM1Q12363 PKP1YIL042C 1185 nt14.24□□□□□ -0.13
WTM1Q12363 RVS167YDR388W 1449 nt14.2□□□□□ -0.14
WTM1Q12363 SCJ1YMR214W 1134 nt14.12□□□□□ -0.15
WTM1Q12363 PUT4YOR348C 1884 nt13.81□□□□□ -0.2
WTM1Q12363 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt13.79□□□□□ -0.2
WTM1Q12363 SSA3YBL075C 1950 nt13.72□□□□□ -0.21
WTM1Q12363 PET122YER153C 765 nt13.72□□□□□ -0.21
WTM1Q12363 SHR5YOL110W 714 nt13.64□□□□□ -0.23
WTM1Q12363 URN1YPR152C 1398 nt13.5□□□□□ -0.25
WTM1Q12363 ARE1YCR048W 1833 nt13.46□□□□□ -0.25
WTM1Q12363 DEP1YAL013W 1218 nt13.42□□□□□ -0.26
WTM1Q12363 SCR1SCR1 522 nt13.42□□□□□ -0.26
WTM1Q12363 SAH1YER043C 1350 nt13.39□□□□□ -0.27
WTM1Q12363 OPI9YLR338W 858 nt13.36□□□□□ -0.27
WTM1Q12363 POA1YBR022W 534 nt13.36□□□□□ -0.27
WTM1Q12363 YDJ1YNL064C 1230 nt13.31□□□□□ -0.28
WTM1Q12363 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt13.29□□□□□ -0.28
WTM1Q12363 RRN5YLR141W 1092 nt13.28□□□□□ -0.28
WTM1Q12363 ATS1YAL020C 1002 nt13.23□□□□□ -0.29
WTM1Q12363 RPN10YHR200W 807 nt13.17□□□□□ -0.3
WTM1Q12363 BSC6YOL137W 1494 nt13.14□□□□□ -0.31
WTM1Q12363 YNL208WYNL208W 600 nt13.12□□□□□ -0.31
WTM1Q12363 GAR1YHR089C 618 nt13.11□□□□□ -0.31
WTM1Q12363 YER088W-BYER088W-B 147 nt13.01□□□□□ -0.33
WTM1Q12363 BUD23YCR047C 828 nt12.96□□□□□ -0.33
WTM1Q12363 PUN1YLR414C 792 nt12.95□□□□□ -0.34
WTM1Q12363 RSB1YOR049C 1065 nt12.89□□□□□ -0.35
WTM1Q12363 PTC2YER089C 1395 nt12.89□□□□□ -0.35
WTM1Q12363 YJR018WYJR018W 363 nt12.85□□□□□ -0.35
WTM1Q12363 SPT5YML010W 3192 nt12.77□□□□□ -0.37
WTM1Q12363 NAB2YGL122C 1578 nt12.74□□□□□ -0.37
WTM1Q12363 TIR1YER011W 765 nt12.68□□□□□ -0.38
WTM1Q12363 YJR120WYJR120W 351 nt12.62□□□□□ -0.39
WTM1Q12363 SSA1YAL005C 1929 nt12.62□□□□□ -0.39
WTM1Q12363 FIS1YIL065C 468 nt12.56□□□□□ -0.4
WTM1Q12363 DAL1YIR027C 1383 nt12.52□□□□□ -0.41
WTM1Q12363 FPR4YLR449W 1179 nt12.51□□□□□ -0.41
WTM1Q12363 SSA4YER103W 1929 nt12.48□□□□□ -0.41
WTM1Q12363 RPP2BYDR382W 333 nt12.47□□□□□ -0.41
WTM1Q12363 PHO4YFR034C 939 nt12.42□□□□□ -0.42
WTM1Q12363 INM2YDR287W 879 nt12.4□□□□□ -0.42
WTM1Q12363 SRB2YHR041C 633 nt12.38□□□□□ -0.43
WTM1Q12363 MEP2YNL142W 1500 nt12.36□□□□□ -0.43
WTM1Q12363 PST2YDR032C 597 nt12.32□□□□□ -0.44
WTM1Q12363 YPS1YLR120C 1710 nt12.29□□□□□ -0.44
WTM1Q12363 YBL100CYBL100C 315 nt12.26□□□□□ -0.45
WTM1Q12363 DCW1YKL046C 1350 nt12.19□□□□□ -0.46
WTM1Q12363 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt12.18□□□□□ -0.46
WTM1Q12363 BDH2YAL061W 1254 nt12.18□□□□□ -0.46
WTM1Q12363 YDR095CYDR095C 411 nt12.16□□□□□ -0.46
WTM1Q12363 FUN26YAL022C 1554 nt12.1□□□□□ -0.47
WTM1Q12363 WWM1YFL010C 636 nt12.08□□□□□ -0.48
WTM1Q12363 BDF1YLR399C 2061 nt12.02□□□□□ -0.49
WTM1Q12363 TRM9YML014W 840 nt12□□□□□ -0.49
WTM1Q12363 EMI2YDR516C 1503 nt12□□□□□ -0.49
WTM1Q12363 ALF1YNL148C 765 nt11.99□□□□□ -0.49
WTM1Q12363 PTP1YDL230W 1008 nt11.94□□□□□ -0.5
WTM1Q12363 LSM3YLR438C-A 270 nt11.93□□□□□ -0.5
WTM1Q12363 RPP2AYOL039W 321 nt11.93□□□□□ -0.5
WTM1Q12363 CAC2YML102W 1407 nt11.93□□□□□ -0.5
WTM1Q12363 SHU1YHL006C 453 nt11.92□□□□□ -0.5
WTM1Q12363 CCT6YDR188W 1641 nt11.89□□□□□ -0.51
WTM1Q12363 YMR090WYMR090W 684 nt11.89□□□□□ -0.51
WTM1Q12363 YBR220CYBR220C 1683 nt11.88□□□□□ -0.51
WTM1Q12363 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt11.88□□□□□ -0.51
WTM1Q12363 YDL221WYDL221W 552 nt11.87□□□□□ -0.51
WTM1Q12363 TAT1YBR069C 1860 nt11.85□□□□□ -0.51
WTM1Q12363 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt11.84□□□□□ -0.51
WTM1Q12363 YGR021WYGR021W 873 nt11.84□□□□□ -0.51
WTM1Q12363 SIS1YNL007C 1059 nt11.83□□□□□ -0.52
WTM1Q12363 HOM6YJR139C 1080 nt11.82□□□□□ -0.52
WTM1Q12363 SUF2tP(AGG)C 72 nt11.8□□□□□ -0.52
WTM1Q12363 SUF10tP(AGG)N 72 nt11.8□□□□□ -0.52
WTM1Q12363 SDH1YKL148C 1923 nt11.79□□□□□ -0.52
WTM1Q12363 MNP1YGL068W 585 nt11.75□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 10.9 ms