Protein–RNA interactions for Protein: Q08219

RRT8, Outer spore wall protein RRT8, yeastyeast

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RRT8Q08219 NSR1YGR159C 1245 nt19.11■□□□□ 0.65
RRT8Q08219 YML009W-BYML009W-B 477 nt19.02■□□□□ 0.64
RRT8Q08219 NOP1YDL014W 984 nt18.39■□□□□ 0.53
RRT8Q08219 MDJ1YFL016C 1536 nt17.24■□□□□ 0.35
RRT8Q08219 YKL036CYKL036C 393 nt16.68■□□□□ 0.26
RRT8Q08219 SRX1YKL086W 384 nt16.02■□□□□ 0.16
RRT8Q08219 Q0297Q0297 156 nt15.94■□□□□ 0.14
RRT8Q08219 YJL027CYJL027C 417 nt15.93■□□□□ 0.14
RRT8Q08219 YCR051WYCR051W 669 nt15.23■□□□□ 0.03
RRT8Q08219 DBP2YNL112W 1641 nt15.08■□□□□ 0
RRT8Q08219 SCS3YGL126W 1143 nt15□□□□□ -0.01
RRT8Q08219 YBR190WYBR190W 312 nt14.78□□□□□ -0.04
RRT8Q08219 TRN1tP(UGG)A 72 nt14.64□□□□□ -0.07
RRT8Q08219 SUF9tP(UGG)F 72 nt14.64□□□□□ -0.07
RRT8Q08219 SUF8tP(UGG)H 72 nt14.64□□□□□ -0.07
RRT8Q08219 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt14.64□□□□□ -0.07
RRT8Q08219 SUF7tP(UGG)M 72 nt14.64□□□□□ -0.07
RRT8Q08219 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt14.64□□□□□ -0.07
RRT8Q08219 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt14.64□□□□□ -0.07
RRT8Q08219 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt14.64□□□□□ -0.07
RRT8Q08219 SUF11tP(UGG)O2 72 nt14.64□□□□□ -0.07
RRT8Q08219 CCC1YLR220W 969 nt14.54□□□□□ -0.08
RRT8Q08219 RTC3YHR087W 336 nt14.49□□□□□ -0.09
RRT8Q08219 YOL085CYOL085C 342 nt14.42□□□□□ -0.1
RRT8Q08219 RPP1BYDL130W 321 nt14.32□□□□□ -0.12
RRT8Q08219 PKP1YIL042C 1185 nt14.26□□□□□ -0.13
RRT8Q08219 RVS167YDR388W 1449 nt14.24□□□□□ -0.13
RRT8Q08219 SCJ1YMR214W 1134 nt14.01□□□□□ -0.17
RRT8Q08219 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt13.77□□□□□ -0.21
RRT8Q08219 PET122YER153C 765 nt13.71□□□□□ -0.21
RRT8Q08219 SSA3YBL075C 1950 nt13.67□□□□□ -0.22
RRT8Q08219 SHR5YOL110W 714 nt13.62□□□□□ -0.23
RRT8Q08219 PUT4YOR348C 1884 nt13.59□□□□□ -0.23
RRT8Q08219 SCR1SCR1 522 nt13.55□□□□□ -0.24
RRT8Q08219 URN1YPR152C 1398 nt13.43□□□□□ -0.26
RRT8Q08219 DEP1YAL013W 1218 nt13.34□□□□□ -0.27
RRT8Q08219 ATS1YAL020C 1002 nt13.33□□□□□ -0.28
RRT8Q08219 YDJ1YNL064C 1230 nt13.32□□□□□ -0.28
RRT8Q08219 RRN5YLR141W 1092 nt13.29□□□□□ -0.28
RRT8Q08219 OPI9YLR338W 858 nt13.27□□□□□ -0.29
RRT8Q08219 ARE1YCR048W 1833 nt13.27□□□□□ -0.29
RRT8Q08219 SAH1YER043C 1350 nt13.26□□□□□ -0.29
RRT8Q08219 RPN10YHR200W 807 nt13.21□□□□□ -0.29
RRT8Q08219 POA1YBR022W 534 nt13.18□□□□□ -0.3
RRT8Q08219 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt13.14□□□□□ -0.31
RRT8Q08219 GAR1YHR089C 618 nt13.1□□□□□ -0.31
RRT8Q08219 YNL208WYNL208W 600 nt13.1□□□□□ -0.31
RRT8Q08219 YER088W-BYER088W-B 147 nt13.02□□□□□ -0.33
RRT8Q08219 RSB1YOR049C 1065 nt12.97□□□□□ -0.33
RRT8Q08219 BSC6YOL137W 1494 nt12.94□□□□□ -0.34
RRT8Q08219 PUN1YLR414C 792 nt12.91□□□□□ -0.34
RRT8Q08219 BUD23YCR047C 828 nt12.86□□□□□ -0.35
RRT8Q08219 YJR018WYJR018W 363 nt12.79□□□□□ -0.36
RRT8Q08219 PTC2YER089C 1395 nt12.79□□□□□ -0.36
RRT8Q08219 NAB2YGL122C 1578 nt12.66□□□□□ -0.38
RRT8Q08219 TIR1YER011W 765 nt12.66□□□□□ -0.38
RRT8Q08219 SSA1YAL005C 1929 nt12.52□□□□□ -0.4
RRT8Q08219 RPP2BYDR382W 333 nt12.5□□□□□ -0.41
RRT8Q08219 FPR4YLR449W 1179 nt12.45□□□□□ -0.42
RRT8Q08219 DAL1YIR027C 1383 nt12.44□□□□□ -0.42
RRT8Q08219 YJR120WYJR120W 351 nt12.44□□□□□ -0.42
RRT8Q08219 SPT5YML010W 3192 nt12.42□□□□□ -0.42
RRT8Q08219 FIS1YIL065C 468 nt12.41□□□□□ -0.42
RRT8Q08219 INM2YDR287W 879 nt12.38□□□□□ -0.43
RRT8Q08219 PST2YDR032C 597 nt12.37□□□□□ -0.43
RRT8Q08219 PHO4YFR034C 939 nt12.31□□□□□ -0.44
RRT8Q08219 SSA4YER103W 1929 nt12.24□□□□□ -0.45
RRT8Q08219 SRB2YHR041C 633 nt12.21□□□□□ -0.45
RRT8Q08219 YBL100CYBL100C 315 nt12.21□□□□□ -0.45
RRT8Q08219 MEP2YNL142W 1500 nt12.17□□□□□ -0.46
RRT8Q08219 BDH2YAL061W 1254 nt12.16□□□□□ -0.46
RRT8Q08219 YPS1YLR120C 1710 nt12.16□□□□□ -0.46
RRT8Q08219 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt12.1□□□□□ -0.47
RRT8Q08219 FUN26YAL022C 1554 nt12.05□□□□□ -0.48
RRT8Q08219 YDR095CYDR095C 411 nt12.04□□□□□ -0.48
RRT8Q08219 WWM1YFL010C 636 nt12.04□□□□□ -0.48
RRT8Q08219 TRM9YML014W 840 nt12□□□□□ -0.49
RRT8Q08219 ALF1YNL148C 765 nt11.99□□□□□ -0.49
RRT8Q08219 DCW1YKL046C 1350 nt11.96□□□□□ -0.49
RRT8Q08219 Q0182Q0182 405 nt11.96□□□□□ -0.49
RRT8Q08219 SHU1YHL006C 453 nt11.95□□□□□ -0.5
RRT8Q08219 LSM3YLR438C-A 270 nt11.94□□□□□ -0.5
RRT8Q08219 YGR021WYGR021W 873 nt11.91□□□□□ -0.5
RRT8Q08219 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt11.88□□□□□ -0.51
RRT8Q08219 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt11.87□□□□□ -0.51
RRT8Q08219 CCT6YDR188W 1641 nt11.86□□□□□ -0.51
RRT8Q08219 YMR090WYMR090W 684 nt11.84□□□□□ -0.51
RRT8Q08219 EMI2YDR516C 1503 nt11.83□□□□□ -0.52
RRT8Q08219 SUF2tP(AGG)C 72 nt11.83□□□□□ -0.52
RRT8Q08219 SUF10tP(AGG)N 72 nt11.83□□□□□ -0.52
RRT8Q08219 RPP2AYOL039W 321 nt11.83□□□□□ -0.52
RRT8Q08219 HOM6YJR139C 1080 nt11.81□□□□□ -0.52
RRT8Q08219 BDF1YLR399C 2061 nt11.81□□□□□ -0.52
RRT8Q08219 YKL097CYKL097C 411 nt11.79□□□□□ -0.52
RRT8Q08219 PTP1YDL230W 1008 nt11.75□□□□□ -0.53
RRT8Q08219 SIS1YNL007C 1059 nt11.73□□□□□ -0.53
RRT8Q08219 CAC2YML102W 1407 nt11.72□□□□□ -0.53
RRT8Q08219 MNP1YGL068W 585 nt11.72□□□□□ -0.53
RRT8Q08219 YDL221WYDL221W 552 nt11.71□□□□□ -0.53
RRT8Q08219 YBR220CYBR220C 1683 nt11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 6.2 ms