Protein–RNA interactions for Protein: Q12358

JLP1, Alpha-ketoglutarate-dependent sulfonate dioxygenase, yeastyeast

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
JLP1Q12358 NSR1YGR159C 1245 nt19.6■□□□□ 0.73
JLP1Q12358 YML009W-BYML009W-B 477 nt19.55■□□□□ 0.72
JLP1Q12358 NOP1YDL014W 984 nt18.82■□□□□ 0.6
JLP1Q12358 MDJ1YFL016C 1536 nt17.73■□□□□ 0.43
JLP1Q12358 YKL036CYKL036C 393 nt17.17■□□□□ 0.34
JLP1Q12358 SRX1YKL086W 384 nt16.49■□□□□ 0.23
JLP1Q12358 Q0297Q0297 156 nt16.42■□□□□ 0.22
JLP1Q12358 YJL027CYJL027C 417 nt16.29■□□□□ 0.2
JLP1Q12358 YCR051WYCR051W 669 nt15.65■□□□□ 0.1
JLP1Q12358 DBP2YNL112W 1641 nt15.58■□□□□ 0.09
JLP1Q12358 SCS3YGL126W 1143 nt15.52■□□□□ 0.08
JLP1Q12358 YBR190WYBR190W 312 nt15.12■□□□□ 0.01
JLP1Q12358 TRN1tP(UGG)A 72 nt15.08■□□□□ 0
JLP1Q12358 SUF9tP(UGG)F 72 nt15.08■□□□□ 0
JLP1Q12358 SUF8tP(UGG)H 72 nt15.08■□□□□ 0
JLP1Q12358 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt15.08■□□□□ 0
JLP1Q12358 SUF7tP(UGG)M 72 nt15.08■□□□□ 0
JLP1Q12358 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt15.08■□□□□ 0
JLP1Q12358 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt15.08■□□□□ 0
JLP1Q12358 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt15.08■□□□□ 0
JLP1Q12358 SUF11tP(UGG)O2 72 nt15.08■□□□□ 0
JLP1Q12358 CCC1YLR220W 969 nt14.95□□□□□ -0.02
JLP1Q12358 YOL085CYOL085C 342 nt14.9□□□□□ -0.02
JLP1Q12358 RTC3YHR087W 336 nt14.79□□□□□ -0.04
JLP1Q12358 PKP1YIL042C 1185 nt14.76□□□□□ -0.05
JLP1Q12358 RPP1BYDL130W 321 nt14.74□□□□□ -0.05
JLP1Q12358 RVS167YDR388W 1449 nt14.5□□□□□ -0.09
JLP1Q12358 SCJ1YMR214W 1134 nt14.48□□□□□ -0.09
JLP1Q12358 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt14.18□□□□□ -0.14
JLP1Q12358 PET122YER153C 765 nt14.16□□□□□ -0.14
JLP1Q12358 SHR5YOL110W 714 nt13.97□□□□□ -0.17
JLP1Q12358 PUT4YOR348C 1884 nt13.97□□□□□ -0.17
JLP1Q12358 SCR1SCR1 522 nt13.87□□□□□ -0.19
JLP1Q12358 ATS1YAL020C 1002 nt13.8□□□□□ -0.2
JLP1Q12358 URN1YPR152C 1398 nt13.76□□□□□ -0.21
JLP1Q12358 DEP1YAL013W 1218 nt13.73□□□□□ -0.21
JLP1Q12358 RRN5YLR141W 1092 nt13.72□□□□□ -0.21
JLP1Q12358 YDJ1YNL064C 1230 nt13.69□□□□□ -0.22
JLP1Q12358 ARE1YCR048W 1833 nt13.64□□□□□ -0.23
JLP1Q12358 SSA3YBL075C 1950 nt13.63□□□□□ -0.23
JLP1Q12358 SAH1YER043C 1350 nt13.61□□□□□ -0.23
JLP1Q12358 OPI9YLR338W 858 nt13.6□□□□□ -0.23
JLP1Q12358 POA1YBR022W 534 nt13.52□□□□□ -0.25
JLP1Q12358 GAR1YHR089C 618 nt13.48□□□□□ -0.25
JLP1Q12358 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt13.47□□□□□ -0.25
JLP1Q12358 YER088W-BYER088W-B 147 nt13.44□□□□□ -0.26
JLP1Q12358 RPN10YHR200W 807 nt13.44□□□□□ -0.26
JLP1Q12358 YNL208WYNL208W 600 nt13.41□□□□□ -0.26
JLP1Q12358 RSB1YOR049C 1065 nt13.35□□□□□ -0.27
JLP1Q12358 BSC6YOL137W 1494 nt13.28□□□□□ -0.28
JLP1Q12358 PUN1YLR414C 792 nt13.18□□□□□ -0.3
JLP1Q12358 BUD23YCR047C 828 nt13.14□□□□□ -0.31
JLP1Q12358 YJR018WYJR018W 363 nt13.11□□□□□ -0.31
JLP1Q12358 PTC2YER089C 1395 nt13.1□□□□□ -0.31
JLP1Q12358 TIR1YER011W 765 nt13.02□□□□□ -0.33
JLP1Q12358 SSA1YAL005C 1929 nt12.94□□□□□ -0.34
JLP1Q12358 NAB2YGL122C 1578 nt12.94□□□□□ -0.34
JLP1Q12358 YJR120WYJR120W 351 nt12.91□□□□□ -0.34
JLP1Q12358 SPT5YML010W 3192 nt12.83□□□□□ -0.36
JLP1Q12358 PST2YDR032C 597 nt12.82□□□□□ -0.36
JLP1Q12358 FIS1YIL065C 468 nt12.77□□□□□ -0.37
JLP1Q12358 SRB2YHR041C 633 nt12.74□□□□□ -0.37
JLP1Q12358 RPP2BYDR382W 333 nt12.73□□□□□ -0.37
JLP1Q12358 DAL1YIR027C 1383 nt12.72□□□□□ -0.37
JLP1Q12358 FPR4YLR449W 1179 nt12.72□□□□□ -0.37
JLP1Q12358 INM2YDR287W 879 nt12.63□□□□□ -0.39
JLP1Q12358 PHO4YFR034C 939 nt12.63□□□□□ -0.39
JLP1Q12358 YBL100CYBL100C 315 nt12.5□□□□□ -0.41
JLP1Q12358 SSA4YER103W 1929 nt12.49□□□□□ -0.41
JLP1Q12358 MEP2YNL142W 1500 nt12.47□□□□□ -0.41
JLP1Q12358 YPS1YLR120C 1710 nt12.46□□□□□ -0.41
JLP1Q12358 BDH2YAL061W 1254 nt12.46□□□□□ -0.41
JLP1Q12358 WWM1YFL010C 636 nt12.43□□□□□ -0.42
JLP1Q12358 SHU1YHL006C 453 nt12.39□□□□□ -0.43
JLP1Q12358 FUN26YAL022C 1554 nt12.35□□□□□ -0.43
JLP1Q12358 YDR095CYDR095C 411 nt12.35□□□□□ -0.43
JLP1Q12358 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt12.34□□□□□ -0.43
JLP1Q12358 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt12.32□□□□□ -0.44
JLP1Q12358 DCW1YKL046C 1350 nt12.31□□□□□ -0.44
JLP1Q12358 TRM9YML014W 840 nt12.26□□□□□ -0.45
JLP1Q12358 LSM3YLR438C-A 270 nt12.22□□□□□ -0.45
JLP1Q12358 YGR021WYGR021W 873 nt12.2□□□□□ -0.46
JLP1Q12358 HOM6YJR139C 1080 nt12.2□□□□□ -0.46
JLP1Q12358 ALF1YNL148C 765 nt12.2□□□□□ -0.46
JLP1Q12358 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt12.18□□□□□ -0.46
JLP1Q12358 YKL097CYKL097C 411 nt12.16□□□□□ -0.46
JLP1Q12358 CCT6YDR188W 1641 nt12.15□□□□□ -0.46
JLP1Q12358 MNP1YGL068W 585 nt12.15□□□□□ -0.46
JLP1Q12358 PTP1YDL230W 1008 nt12.13□□□□□ -0.47
JLP1Q12358 EMI2YDR516C 1503 nt12.12□□□□□ -0.47
JLP1Q12358 RPP2AYOL039W 321 nt12.11□□□□□ -0.47
JLP1Q12358 CAC2YML102W 1407 nt12.1□□□□□ -0.47
JLP1Q12358 SIS1YNL007C 1059 nt12.04□□□□□ -0.48
JLP1Q12358 SUF2tP(AGG)C 72 nt12.03□□□□□ -0.48
JLP1Q12358 SUF10tP(AGG)N 72 nt12.03□□□□□ -0.48
JLP1Q12358 BDF1YLR399C 2061 nt12.01□□□□□ -0.49
JLP1Q12358 RKM5YLR137W 1104 nt12.01□□□□□ -0.49
JLP1Q12358 YDL221WYDL221W 552 nt12□□□□□ -0.49
JLP1Q12358 YMR090WYMR090W 684 nt11.99□□□□□ -0.49
JLP1Q12358 YBR220CYBR220C 1683 nt11.97□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 31.6 ms