Protein–RNA interactions for Protein: Q06159

ATG39, Autophagy-related protein 39, yeastyeast

Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
ATG39Q06159 YML009W-BYML009W-B 477 nt15.83■□□□□ 0.12
ATG39Q06159 NSR1YGR159C 1245 nt15.8■□□□□ 0.12
ATG39Q06159 NOP1YDL014W 984 nt15.36■□□□□ 0.05
ATG39Q06159 MDJ1YFL016C 1536 nt14.1□□□□□ -0.15
ATG39Q06159 YKL036CYKL036C 393 nt14.08□□□□□ -0.16
ATG39Q06159 Q0297Q0297 156 nt13.4□□□□□ -0.26
ATG39Q06159 SRX1YKL086W 384 nt13.4□□□□□ -0.26
ATG39Q06159 YJL027CYJL027C 417 nt13.14□□□□□ -0.31
ATG39Q06159 SSA3YBL075C 1950 nt12.87□□□□□ -0.35
ATG39Q06159 SCS3YGL126W 1143 nt12.75□□□□□ -0.37
ATG39Q06159 YCR051WYCR051W 669 nt12.72□□□□□ -0.37
ATG39Q06159 DBP2YNL112W 1641 nt12.41□□□□□ -0.42
ATG39Q06159 YOL085CYOL085C 342 nt12.19□□□□□ -0.46
ATG39Q06159 TRN1tP(UGG)A 72 nt12.17□□□□□ -0.46
ATG39Q06159 SUF9tP(UGG)F 72 nt12.17□□□□□ -0.46
ATG39Q06159 SUF8tP(UGG)H 72 nt12.17□□□□□ -0.46
ATG39Q06159 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt12.17□□□□□ -0.46
ATG39Q06159 SUF7tP(UGG)M 72 nt12.17□□□□□ -0.46
ATG39Q06159 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt12.17□□□□□ -0.46
ATG39Q06159 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt12.17□□□□□ -0.46
ATG39Q06159 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt12.17□□□□□ -0.46
ATG39Q06159 SUF11tP(UGG)O2 72 nt12.17□□□□□ -0.46
ATG39Q06159 CCC1YLR220W 969 nt12.05□□□□□ -0.48
ATG39Q06159 YBR190WYBR190W 312 nt12.05□□□□□ -0.48
ATG39Q06159 RPP1BYDL130W 321 nt12.02□□□□□ -0.49
ATG39Q06159 PKP1YIL042C 1185 nt12.02□□□□□ -0.49
ATG39Q06159 RTC3YHR087W 336 nt11.8□□□□□ -0.52
ATG39Q06159 RVS167YDR388W 1449 nt11.71□□□□□ -0.53
ATG39Q06159 SCJ1YMR214W 1134 nt11.6□□□□□ -0.55
ATG39Q06159 PET122YER153C 765 nt11.49□□□□□ -0.57
ATG39Q06159 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt11.48□□□□□ -0.57
ATG39Q06159 ATS1YAL020C 1002 nt11.38□□□□□ -0.59
ATG39Q06159 SCR1SCR1 522 nt11.37□□□□□ -0.59
ATG39Q06159 SHR5YOL110W 714 nt11.27□□□□□ -0.61
ATG39Q06159 RRN5YLR141W 1092 nt11.16□□□□□ -0.62
ATG39Q06159 PUT4YOR348C 1884 nt11.16□□□□□ -0.62
ATG39Q06159 YDJ1YNL064C 1230 nt11.12□□□□□ -0.63
ATG39Q06159 URN1YPR152C 1398 nt11□□□□□ -0.65
ATG39Q06159 DEP1YAL013W 1218 nt10.97□□□□□ -0.65
ATG39Q06159 YER088W-BYER088W-B 147 nt10.93□□□□□ -0.66
ATG39Q06159 RSB1YOR049C 1065 nt10.92□□□□□ -0.66
ATG39Q06159 PAC11YDR488C 1602 nt10.91□□□□□ -0.66
ATG39Q06159 SSA4YER103W 1929 nt10.9□□□□□ -0.66
ATG39Q06159 GAR1YHR089C 618 nt10.89□□□□□ -0.67
ATG39Q06159 OPI9YLR338W 858 nt10.86□□□□□ -0.67
ATG39Q06159 RPN10YHR200W 807 nt10.84□□□□□ -0.67
ATG39Q06159 NVJ2YPR091C 2313 nt10.84□□□□□ -0.67
ATG39Q06159 ARE1YCR048W 1833 nt10.81□□□□□ -0.68
ATG39Q06159 SAH1YER043C 1350 nt10.8□□□□□ -0.68
ATG39Q06159 YNL208WYNL208W 600 nt10.8□□□□□ -0.68
ATG39Q06159 SPT5YML010W 3192 nt10.76□□□□□ -0.69
ATG39Q06159 POA1YBR022W 534 nt10.74□□□□□ -0.69
ATG39Q06159 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt10.67□□□□□ -0.7
ATG39Q06159 FPS1YLL043W 2010 nt10.65□□□□□ -0.71
ATG39Q06159 BDF1YLR399C 2061 nt10.64□□□□□ -0.71
ATG39Q06159 BSC6YOL137W 1494 nt10.61□□□□□ -0.71
ATG39Q06159 PUN1YLR414C 792 nt10.56□□□□□ -0.72
ATG39Q06159 PST2YDR032C 597 nt10.55□□□□□ -0.72
ATG39Q06159 TIR1YER011W 765 nt10.52□□□□□ -0.73
ATG39Q06159 SSA1YAL005C 1929 nt10.5□□□□□ -0.73
ATG39Q06159 YJR018WYJR018W 363 nt10.5□□□□□ -0.73
ATG39Q06159 TAT1YBR069C 1860 nt10.48□□□□□ -0.73
ATG39Q06159 PTC2YER089C 1395 nt10.43□□□□□ -0.74
ATG39Q06159 BUD23YCR047C 828 nt10.41□□□□□ -0.74
ATG39Q06159 NAB2YGL122C 1578 nt10.3□□□□□ -0.76
ATG39Q06159 YJR120WYJR120W 351 nt10.29□□□□□ -0.76
ATG39Q06159 RPP2BYDR382W 333 nt10.28□□□□□ -0.76
ATG39Q06159 SRB2YHR041C 633 nt10.19□□□□□ -0.78
ATG39Q06159 DAL1YIR027C 1383 nt10.15□□□□□ -0.78
ATG39Q06159 FIS1YIL065C 468 nt10.15□□□□□ -0.78
ATG39Q06159 FPR4YLR449W 1179 nt10.15□□□□□ -0.78
ATG39Q06159 INM2YDR287W 879 nt10.14□□□□□ -0.79
ATG39Q06159 SHU1YHL006C 453 nt10.14□□□□□ -0.79
ATG39Q06159 YKL097CYKL097C 411 nt10.11□□□□□ -0.79
ATG39Q06159 PHO4YFR034C 939 nt10.06□□□□□ -0.8
ATG39Q06159 MEP2YNL142W 1500 nt10.03□□□□□ -0.8
ATG39Q06159 WWM1YFL010C 636 nt10.03□□□□□ -0.8
ATG39Q06159 BDH2YAL061W 1254 nt10.03□□□□□ -0.8
ATG39Q06159 YBL100CYBL100C 315 nt10.02□□□□□ -0.81
ATG39Q06159 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt10.01□□□□□ -0.81
ATG39Q06159 UME6YDR207C 2511 nt10□□□□□ -0.81
ATG39Q06159 YGR021WYGR021W 873 nt9.97□□□□□ -0.81
ATG39Q06159 HOM6YJR139C 1080 nt9.92□□□□□ -0.82
ATG39Q06159 YJL225CYJL225C 5277 nt9.91□□□□□ -0.82
ATG39Q06159 FUN26YAL022C 1554 nt9.89□□□□□ -0.83
ATG39Q06159 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt9.89□□□□□ -0.83
ATG39Q06159 LSM3YLR438C-A 270 nt9.89□□□□□ -0.83
ATG39Q06159 YPS1YLR120C 1710 nt9.88□□□□□ -0.83
ATG39Q06159 TRM9YML014W 840 nt9.87□□□□□ -0.83
ATG39Q06159 MNP1YGL068W 585 nt9.86□□□□□ -0.83
ATG39Q06159 YDR095CYDR095C 411 nt9.82□□□□□ -0.84
ATG39Q06159 DCW1YKL046C 1350 nt9.81□□□□□ -0.84
ATG39Q06159 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt9.81□□□□□ -0.84
ATG39Q06159 ALF1YNL148C 765 nt9.8□□□□□ -0.84
ATG39Q06159 RKM5YLR137W 1104 nt9.77□□□□□ -0.85
ATG39Q06159 CCT6YDR188W 1641 nt9.75□□□□□ -0.85
ATG39Q06159 YMR090WYMR090W 684 nt9.73□□□□□ -0.85
ATG39Q06159 SUF2tP(AGG)C 72 nt9.71□□□□□ -0.86
ATG39Q06159 SUF10tP(AGG)N 72 nt9.71□□□□□ -0.86
ATG39Q06159 EMI2YDR516C 1503 nt9.71□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 10.3 ms