Protein–RNA interactions for Protein: Q06678

MRPL35, 54S ribosomal protein L35, mitochondrial, yeastyeast

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
MRPL35Q06678 NSR1YGR159C 1245 nt17.81■□□□□ 0.44
MRPL35Q06678 YML009W-BYML009W-B 477 nt17.57■□□□□ 0.4
MRPL35Q06678 NOP1YDL014W 984 nt16.79■□□□□ 0.28
MRPL35Q06678 MDJ1YFL016C 1536 nt16.4■□□□□ 0.22
MRPL35Q06678 YKL036CYKL036C 393 nt15.07■□□□□ 0
MRPL35Q06678 YJL027CYJL027C 417 nt15.02■□□□□ -0
MRPL35Q06678 SRX1YKL086W 384 nt14.69□□□□□ -0.06
MRPL35Q06678 Q0297Q0297 156 nt14.55□□□□□ -0.08
MRPL35Q06678 DBP2YNL112W 1641 nt14.29□□□□□ -0.12
MRPL35Q06678 YBR190WYBR190W 312 nt14.02□□□□□ -0.17
MRPL35Q06678 YCR051WYCR051W 669 nt13.96□□□□□ -0.17
MRPL35Q06678 RTC3YHR087W 336 nt13.74□□□□□ -0.21
MRPL35Q06678 TRN1tP(UGG)A 72 nt13.6□□□□□ -0.23
MRPL35Q06678 SUF9tP(UGG)F 72 nt13.6□□□□□ -0.23
MRPL35Q06678 SUF8tP(UGG)H 72 nt13.6□□□□□ -0.23
MRPL35Q06678 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt13.6□□□□□ -0.23
MRPL35Q06678 SUF7tP(UGG)M 72 nt13.6□□□□□ -0.23
MRPL35Q06678 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt13.6□□□□□ -0.23
MRPL35Q06678 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt13.6□□□□□ -0.23
MRPL35Q06678 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt13.6□□□□□ -0.23
MRPL35Q06678 SUF11tP(UGG)O2 72 nt13.6□□□□□ -0.23
MRPL35Q06678 CCC1YLR220W 969 nt13.54□□□□□ -0.24
MRPL35Q06678 SSA3YBL075C 1950 nt13.51□□□□□ -0.25
MRPL35Q06678 SCS3YGL126W 1143 nt13.5□□□□□ -0.25
MRPL35Q06678 RVS167YDR388W 1449 nt13.24□□□□□ -0.29
MRPL35Q06678 SCJ1YMR214W 1134 nt13.17□□□□□ -0.3
MRPL35Q06678 PUT4YOR348C 1884 nt13.16□□□□□ -0.3
MRPL35Q06678 YOL085CYOL085C 342 nt13.1□□□□□ -0.31
MRPL35Q06678 RPP1BYDL130W 321 nt13.07□□□□□ -0.32
MRPL35Q06678 PKP1YIL042C 1185 nt13.03□□□□□ -0.32
MRPL35Q06678 ARE1YCR048W 1833 nt12.78□□□□□ -0.36
MRPL35Q06678 POA1YBR022W 534 nt12.74□□□□□ -0.37
MRPL35Q06678 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt12.71□□□□□ -0.37
MRPL35Q06678 URN1YPR152C 1398 nt12.68□□□□□ -0.38
MRPL35Q06678 SHR5YOL110W 714 nt12.67□□□□□ -0.38
MRPL35Q06678 SAH1YER043C 1350 nt12.67□□□□□ -0.38
MRPL35Q06678 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt12.63□□□□□ -0.39
MRPL35Q06678 PET122YER153C 765 nt12.6□□□□□ -0.39
MRPL35Q06678 DEP1YAL013W 1218 nt12.6□□□□□ -0.39
MRPL35Q06678 OPI9YLR338W 858 nt12.56□□□□□ -0.4
MRPL35Q06678 BSC6YOL137W 1494 nt12.54□□□□□ -0.4
MRPL35Q06678 BUD23YCR047C 828 nt12.32□□□□□ -0.44
MRPL35Q06678 SPT5YML010W 3192 nt12.32□□□□□ -0.44
MRPL35Q06678 RPN10YHR200W 807 nt12.29□□□□□ -0.44
MRPL35Q06678 SCR1SCR1 522 nt12.25□□□□□ -0.45
MRPL35Q06678 YDJ1YNL064C 1230 nt12.24□□□□□ -0.45
MRPL35Q06678 YNL208WYNL208W 600 nt12.24□□□□□ -0.45
MRPL35Q06678 RRN5YLR141W 1092 nt12.18□□□□□ -0.46
MRPL35Q06678 PTC2YER089C 1395 nt12.17□□□□□ -0.46
MRPL35Q06678 PUN1YLR414C 792 nt12.16□□□□□ -0.46
MRPL35Q06678 GAR1YHR089C 618 nt12.15□□□□□ -0.46
MRPL35Q06678 SSA4YER103W 1929 nt12.13□□□□□ -0.47
MRPL35Q06678 YJR018WYJR018W 363 nt12.04□□□□□ -0.48
MRPL35Q06678 NAB2YGL122C 1578 nt12.03□□□□□ -0.48
MRPL35Q06678 YER088W-BYER088W-B 147 nt11.93□□□□□ -0.5
MRPL35Q06678 ATS1YAL020C 1002 nt11.92□□□□□ -0.5
MRPL35Q06678 FIS1YIL065C 468 nt11.84□□□□□ -0.51
MRPL35Q06678 FPR4YLR449W 1179 nt11.81□□□□□ -0.52
MRPL35Q06678 YJR120WYJR120W 351 nt11.8□□□□□ -0.52
MRPL35Q06678 MEP2YNL142W 1500 nt11.8□□□□□ -0.52
MRPL35Q06678 DAL1YIR027C 1383 nt11.79□□□□□ -0.52
MRPL35Q06678 RSB1YOR049C 1065 nt11.78□□□□□ -0.52
MRPL35Q06678 TIR1YER011W 765 nt11.73□□□□□ -0.53
MRPL35Q06678 SSA1YAL005C 1929 nt11.73□□□□□ -0.53
MRPL35Q06678 BDF1YLR399C 2061 nt11.71□□□□□ -0.54
MRPL35Q06678 PHO4YFR034C 939 nt11.7□□□□□ -0.54
MRPL35Q06678 DCW1YKL046C 1350 nt11.67□□□□□ -0.54
MRPL35Q06678 YPS1YLR120C 1710 nt11.63□□□□□ -0.55
MRPL35Q06678 INM2YDR287W 879 nt11.63□□□□□ -0.55
MRPL35Q06678 RPP2BYDR382W 333 nt11.62□□□□□ -0.55
MRPL35Q06678 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt11.55□□□□□ -0.56
MRPL35Q06678 TAT1YBR069C 1860 nt11.52□□□□□ -0.57
MRPL35Q06678 SRB2YHR041C 633 nt11.5□□□□□ -0.57
MRPL35Q06678 YBL100CYBL100C 315 nt11.49□□□□□ -0.57
MRPL35Q06678 YDR095CYDR095C 411 nt11.47□□□□□ -0.57
MRPL35Q06678 EMI2YDR516C 1503 nt11.45□□□□□ -0.58
MRPL35Q06678 Q0182Q0182 405 nt11.44□□□□□ -0.58
MRPL35Q06678 YBR220CYBR220C 1683 nt11.41□□□□□ -0.58
MRPL35Q06678 FUN26YAL022C 1554 nt11.34□□□□□ -0.59
MRPL35Q06678 YMR090WYMR090W 684 nt11.34□□□□□ -0.59
MRPL35Q06678 CAC2YML102W 1407 nt11.34□□□□□ -0.59
MRPL35Q06678 BDH2YAL061W 1254 nt11.32□□□□□ -0.6
MRPL35Q06678 YDL221WYDL221W 552 nt11.31□□□□□ -0.6
MRPL35Q06678 PTP1YDL230W 1008 nt11.3□□□□□ -0.6
MRPL35Q06678 SDH1YKL148C 1923 nt11.27□□□□□ -0.6
MRPL35Q06678 ALF1YNL148C 765 nt11.26□□□□□ -0.61
MRPL35Q06678 RPP2AYOL039W 321 nt11.26□□□□□ -0.61
MRPL35Q06678 TRM9YML014W 840 nt11.21□□□□□ -0.61
MRPL35Q06678 WWM1YFL010C 636 nt11.17□□□□□ -0.62
MRPL35Q06678 IRC15YPL017C 1500 nt11.14□□□□□ -0.63
MRPL35Q06678 SCC4YER147C 1875 nt11.14□□□□□ -0.63
MRPL35Q06678 PST2YDR032C 597 nt11.12□□□□□ -0.63
MRPL35Q06678 CCT6YDR188W 1641 nt11.1□□□□□ -0.63
MRPL35Q06678 SIS1YNL007C 1059 nt11.1□□□□□ -0.63
MRPL35Q06678 PAC11YDR488C 1602 nt11.09□□□□□ -0.63
MRPL35Q06678 GIS3YLR094C 1509 nt11.09□□□□□ -0.63
MRPL35Q06678 PCH2YBR186W 1695 nt11.07□□□□□ -0.64
MRPL35Q06678 LSM3YLR438C-A 270 nt11.05□□□□□ -0.64
MRPL35Q06678 ART5YGR068C 1761 nt11.03□□□□□ -0.64
MRPL35Q06678 GUT2YIL155C 1950 nt11.03□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 14.8 ms