RNA–Protein interactions for RNA: YLL047W

YLL047W, Transcript of Dubious open reading frame, yeastyeast

Gene YLL047W, Length 384 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YLL047WYLL047W RHO5P53879 331 aaKnown RBP3.89□□□□□ -1.79
YLL047WYLL047W ACL4Q03771 387 aa3.89□□□□□ -1.79
YLL047WYLL047W YDR131CQ03899 556 aa3.89□□□□□ -1.79
YLL047WYLL047W DCS1Q06151 350 aa3.89□□□□□ -1.79
YLL047WYLL047W IRC25Q07951 179 aa3.89□□□□□ -1.79
YLL047WYLL047W RUP1Q12242 671 aa3.89□□□□□ -1.79
YLL047WYLL047W TPT1Q12272 230 aaKnown RBP3.89□□□□□ -1.79
YLL047WYLL047W WTM1Q12363 437 aaKnown RBP3.89□□□□□ -1.79
YLL047WYLL047W ADE4P04046 510 aaKnown RBP3.88□□□□□ -1.79
YLL047WYLL047W URA4P20051 364 aa3.88□□□□□ -1.79
YLL047WYLL047W URA7P28274 579 aaKnown RBP3.88□□□□□ -1.79
YLL047WYLL047W RRP1P35178 278 aaPredicted RBP3.88□□□□□ -1.79
YLL047WYLL047W RRP4P38792 359 aaKnown RBP3.88□□□□□ -1.79
YLL047WYLL047W CAK1P43568 368 aaPredicted RBP3.88□□□□□ -1.79
YLL047WYLL047W SHY1P53266 389 aa3.88□□□□□ -1.79
YLL047WYLL047W RPT4P53549 437 aaKnown RBP3.88□□□□□ -1.79
YLL047WYLL047W BNI5P53890 448 aaKnown RBP3.88□□□□□ -1.79
YLL047WYLL047W YMR130WQ04223 302 aa3.88□□□□□ -1.79
YLL047WYLL047W AFI1Q99222 893 aa3.88□□□□□ -1.79
YLL047WYLL047W CYC3P06182 269 aa3.87□□□□□ -1.79
YLL047WYLL047W RPS8AP0CX39 200 aaKnown RBP3.87□□□□□ -1.79
YLL047WYLL047W RPS8BP0CX40 200 aaKnown RBP3.87□□□□□ -1.79
YLL047WYLL047W RPC53P25441 422 aa3.87□□□□□ -1.79
YLL047WYLL047W PRS1P32895 427 aaKnown RBP3.87□□□□□ -1.79
YLL047WYLL047W RPN9Q04062 393 aaKnown RBP3.87□□□□□ -1.79
YLL047WYLL047W NDE2Q07500 545 aa3.87□□□□□ -1.79
YLL047WYLL047W DIS3Q08162 1001 aaKnown RBP3.87□□□□□ -1.79
YLL047WYLL047W BSC6Q08280 497 aa3.87□□□□□ -1.79
YLL047WYLL047W RAD57P25301 460 aa3.86□□□□□ -1.79
YLL047WYLL047W ERB1Q04660 807 aaKnown RBP3.86□□□□□ -1.79
YLL047WYLL047W MMR1Q06324 491 aa3.86□□□□□ -1.79
YLL047WYLL047W TMC1Q08422 150 aaPredicted RBP3.86□□□□□ -1.79
YLL047WYLL047W RAX1Q08760 435 aa3.86□□□□□ -1.79
YLL047WYLL047W MTR10Q99189 972 aa3.86□□□□□ -1.79
YLL047WYLL047W TFB1P32776 642 aa3.85□□□□□ -1.79
YLL047WYLL047W SLM4P38247 162 aa3.85□□□□□ -1.79
YLL047WYLL047W YPS6P40583 537 aa3.85□□□□□ -1.79
YLL047WYLL047W MDE1P47095 244 aa3.85□□□□□ -1.79
YLL047WYLL047W OAZ1Q02803 292 aa3.85□□□□□ -1.79
YLL047WYLL047W RRP9Q06506 573 aaKnown RBP3.85□□□□□ -1.79
YLL047WYLL047W CEX1Q12453 761 aa3.85□□□□□ -1.79
YLL047WYLL047W HOM3P10869 527 aa3.84□□□□□ -1.79
YLL047WYLL047W CLB1P24868 471 aa3.84□□□□□ -1.79
YLL047WYLL047W RMT2Q03305 412 aa3.84□□□□□ -1.79
YLL047WYLL047W CPR2P23285 205 aa3.83□□□□□ -1.8
YLL047WYLL047W OLA1P38219 394 aaKnown RBP3.83□□□□□ -1.8
YLL047WYLL047W MTQ1P53944 314 aa3.83□□□□□ -1.8
YLL047WYLL047W JID1Q12350 301 aa3.83□□□□□ -1.8
YLL047WYLL047W TY1B-AO13527 1196 aaKnown RBP3.82□□□□□ -1.8
YLL047WYLL047W YBR056WP38081 501 aa3.82□□□□□ -1.8
YLL047WYLL047W GAT2P40209 560 aa3.82□□□□□ -1.8
YLL047WYLL047W VHS2P40463 436 aa3.82□□□□□ -1.8
YLL047WYLL047W GAB1P41733 394 aa3.82□□□□□ -1.8
YLL047WYLL047W TIS11P47977 285 aa3.82□□□□□ -1.8
YLL047WYLL047W OCA2P53949 197 aa3.82□□□□□ -1.8
YLL047WYLL047W MMT1Q03218 510 aa3.82□□□□□ -1.8
YLL047WYLL047W PRP42Q03776 544 aaKnown RBP3.82□□□□□ -1.8
YLL047WYLL047W PLP2Q12017 286 aa3.82□□□□□ -1.8
YLL047WYLL047W SOD1P00445 154 aaKnown RBP3.81□□□□□ -1.8
YLL047WYLL047W NAT1P12945 854 aaKnown RBP3.81□□□□□ -1.8
YLL047WYLL047W RPB5P20434 215 aa3.81□□□□□ -1.8
YLL047WYLL047W YCL068CP25593 260 aa3.81□□□□□ -1.8
YLL047WYLL047W CHK1P38147 527 aa3.81□□□□□ -1.8
YLL047WYLL047W COX14P39103 70 aa3.81□□□□□ -1.8
YLL047WYLL047W TCB2P48231 1178 aa3.81□□□□□ -1.8
YLL047WYLL047W PHB2P50085 310 aa3.81□□□□□ -1.8
YLL047WYLL047W MDM36Q06820 579 aa3.81□□□□□ -1.8
YLL047WYLL047W CMS1Q07897 291 aaKnown RBP3.81□□□□□ -1.8
YLL047WYLL047W YRM1Q12340 786 aa3.81□□□□□ -1.8
YLL047WYLL047W COX3P00420 269 aa3.8□□□□□ -1.8
YLL047WYLL047W IMA3P0CW40 589 aa3.8□□□□□ -1.8
YLL047WYLL047W IMA4P0CW41 589 aa3.8□□□□□ -1.8
YLL047WYLL047W PHA2P32452 334 aa3.8□□□□□ -1.8
YLL047WYLL047W ATP3P38077 311 aaKnown RBP3.8□□□□□ -1.8
YLL047WYLL047W UTP18P40362 594 aaPredicted RBP3.8□□□□□ -1.8
YLL047WYLL047W YIL029CP40538 142 aa3.8□□□□□ -1.8
YLL047WYLL047W BRO1P48582 844 aa3.8□□□□□ -1.8
YLL047WYLL047W SNT309Q06091 175 aaPredicted RBP3.8□□□□□ -1.8
YLL047WYLL047W IMA2Q08295 589 aa3.8□□□□□ -1.8
YLL047WYLL047W CUE5Q08412 411 aaKnown RBP3.8□□□□□ -1.8
YLL047WYLL047W HSP104P31539 908 aaKnown RBP3.79□□□□□ -1.8
YLL047WYLL047W DBF4P32325 704 aa3.79□□□□□ -1.8
YLL047WYLL047W ASC1P38011 319 aaKnown RBP3.79□□□□□ -1.8
YLL047WYLL047W DED81P38707 554 aaKnown RBP3.79□□□□□ -1.8
YLL047WYLL047W AIM10P39965 576 aaKnown RBP3.79□□□□□ -1.8
YLL047WYLL047W STD1Q02794 444 aa3.79□□□□□ -1.8
YLL047WYLL047W TSA2Q04120 196 aa3.79□□□□□ -1.8
YLL047WYLL047W YLR345WQ06137 509 aa3.79□□□□□ -1.8
YLL047WYLL047W AEP3Q12089 606 aa3.79□□□□□ -1.8
YLL047WYLL047W MDH1P17505 334 aaKnown RBP RIP-Chip data3.78□□□□□ -1.8not detected
YLL047WYLL047W ERV1P27882 189 aa3.78□□□□□ -1.8
YLL047WYLL047W PRR1P28708 518 aa3.78□□□□□ -1.8
YLL047WYLL047W NUP2P32499 720 aa3.78□□□□□ -1.8
YLL047WYLL047W SBE22P38814 852 aa3.78□□□□□ -1.8
YLL047WYLL047W SIM1P40472 476 aa3.78□□□□□ -1.8
YLL047WYLL047W LOT6Q07923 191 aa3.78□□□□□ -1.8
YLL047WYLL047W NAM2P11325 894 aa3.77□□□□□ -1.81
YLL047WYLL047W CSE2P33308 149 aa3.77□□□□□ -1.81
YLL047WYLL047W STN1P38960 494 aa3.77□□□□□ -1.81
YLL047WYLL047W YJR085CP47131 105 aaKnown RBP3.77□□□□□ -1.81
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 33.8 ms